RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578600.1

PTPRM-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRM, Length 578 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-208ENST00000578600 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
PTPRM-208ENST00000578600 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
PTPRM-208ENST00000578600 STARD13Q9Y3M8 1113 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRM-208ENST00000578600 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
PTPRM-208ENST00000578600 EPXP11678 715 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRM-208ENST00000578600 ZNF394Q53GI3 561 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRM-208ENST00000578600 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRM-208ENST00000578600 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
PTPRM-208ENST00000578600 SV2BQ7L1I2 683 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRM-208ENST00000578600 SLC43A3Q8NBI5 491 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRM-208ENST00000578600 ASAP3Q8TDY4 903 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRM-208ENST00000578600 BSNDQ8WZ55 320 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRM-208ENST00000578600 IRF7Q92985 503 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRM-208ENST00000578600 ACDQ96AP0 544 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRM-208ENST00000578600 RSRP1Q9BUV0 290 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRM-208ENST00000578600 SOX13Q9UN79 622 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRM-208ENST00000578600 TRIM33Q9UPN9 1127 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRM-208ENST00000578600 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRM-208ENST00000578600 FAAP100Q0VG06 881 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRM-208ENST00000578600 GRIK5Q16478 980 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRM-208ENST00000578600 LCE2CQ5TA81 110 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRM-208ENST00000578600 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRM-208ENST00000578600 C20orf204Q6ZNR8 217 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRM-208ENST00000578600 VN1R5Q7Z5H4 357 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRM-208ENST00000578600 COPRSQ9NQ92 184 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRM-208ENST00000578600 SEC31BQ9NQW1 1179 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRM-208ENST00000578600 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRM-208ENST00000578600 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRM-208ENST00000578600 KIF14Q15058 1648 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRM-208ENST00000578600 FBXO24O75426 580 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRM-208ENST00000578600 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
PTPRM-208ENST00000578600 GGT6Q6P531 493 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRM-208ENST00000578600 TPTE2Q6XPS3 522 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRM-208ENST00000578600 MICALL1Q8N3F8 863 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRM-208ENST00000578600 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
PTPRM-208ENST00000578600 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
PTPRM-208ENST00000578600 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRM-208ENST00000578600 SHANK2Q9UPX8 1470 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRM-208ENST00000578600 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
PTPRM-208ENST00000578600 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRM-208ENST00000578600 ADAMTS2O95450 1211 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRM-208ENST00000578600 SLURP2P0DP57 97 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRM-208ENST00000578600 PTPRAP18433 802 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRM-208ENST00000578600 ATP2B1P20020 1258 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRM-208ENST00000578600 ALAS2P22557 587 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRM-208ENST00000578600 TNNI2P48788 182 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRM-208ENST00000578600 VPS37DQ86XT2 251 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRM-208ENST00000578600 CEP44Q9C0F1 390 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRM-208ENST00000578600 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
PTPRM-208ENST00000578600 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRM-208ENST00000578600 A2ML1A8K2U0 1454 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRM-208ENST00000578600 ENC1O14682 589 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRM-208ENST00000578600 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
PTPRM-208ENST00000578600 ZNF423Q2M1K9 1284 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRM-208ENST00000578600 KBTBD4Q9NVX7 518 aa8.03□□□□□ -1.12
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PTPRM-208ENST00000578600 ARID5AQ03989 594 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRM-208ENST00000578600 PCDH1Q08174 1060 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRM-208ENST00000578600 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa8.02□□□□□ -1.13
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PTPRM-208ENST00000578600 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
PTPRM-208ENST00000578600 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
PTPRM-208ENST00000578600 MYO5CQ9NQX4 1742 aa8.02□□□□□ -1.13
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PTPRM-208ENST00000578600 CCDC18Q5T9S5 1454 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRM-208ENST00000578600 OIP5O43482 229 aa8.01□□□□□ -1.13
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PTPRM-208ENST00000578600 BAG6P46379 1132 aa8.01□□□□□ -1.13
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PTPRM-208ENST00000578600 KANK3Q6NY19 840 aa8.01□□□□□ -1.13
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PTPRM-208ENST00000578600 TMEM74Q96NL1 305 aa8.01□□□□□ -1.13
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PTPRM-208ENST00000578600 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
PTPRM-208ENST00000578600 PAGE1O75459 146 aa8□□□□□ -1.13
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PTPRM-208ENST00000578600 PWP1Q13610 501 aa8□□□□□ -1.13
PTPRM-208ENST00000578600 RELL1Q8IUW5 271 aa8□□□□□ -1.13
PTPRM-208ENST00000578600 GALNT6Q8NCL4 622 aa8□□□□□ -1.13
PTPRM-208ENST00000578600 PHC3Q8NDX5 983 aa8□□□□□ -1.13
PTPRM-208ENST00000578600 BTBD6Q96KE9 485 aa8□□□□□ -1.13
PTPRM-208ENST00000578600 RHOVQ96L33 236 aa8□□□□□ -1.13
PTPRM-208ENST00000578600 KCNQ5Q9NR82 932 aa8□□□□□ -1.13
PTPRM-208ENST00000578600 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa8□□□□□ -1.13
PTPRM-208ENST00000578600 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
PTPRM-208ENST00000578600 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa8□□□□□ -1.13
PTPRM-208ENST00000578600 A2MP01023 1474 aa8□□□□□ -1.13
PTPRM-208ENST00000578600 NLRP1Q9C000 1473 aa8□□□□□ -1.13
PTPRM-208ENST00000578600 FAM135AQ9P2D6 1515 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRM-208ENST00000578600 SHISA8B8ZZ34 492 aa7.99□□□□□ -1.13
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