RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568468.5

GINS3-210, Transcript of GINS complex subunit 3, humanhuman

TSL 4

Gene GINS3, Length 566 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3-210ENST00000568468 CAVIN4Q5BKX8 364 aa7.38□□□□□ -1.23
GINS3-210ENST00000568468 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa7.38□□□□□ -1.23
GINS3-210ENST00000568468 TMC4Q7Z404 712 aa7.38□□□□□ -1.23
GINS3-210ENST00000568468 FBXO33Q7Z6M2 555 aa7.38□□□□□ -1.23
GINS3-210ENST00000568468 DBNDD1Q9H9R9 158 aa7.38□□□□□ -1.23
GINS3-210ENST00000568468 CDHR5Q9HBB8 845 aa7.38□□□□□ -1.23
GINS3-210ENST00000568468 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
GINS3-210ENST00000568468 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
GINS3-210ENST00000568468 PODXL2Q9NZ53 605 aa7.38□□□□□ -1.23
GINS3-210ENST00000568468 HMG20BQ9P0W2 317 aa7.38□□□□□ -1.23
GINS3-210ENST00000568468 CACNA1SQ13698 1873 aa7.37□□□□□ -1.23
GINS3-210ENST00000568468 NFKBIEO00221 500 aa7.37□□□□□ -1.23
GINS3-210ENST00000568468 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
GINS3-210ENST00000568468 PRELPP51888 382 aa7.37□□□□□ -1.23
GINS3-210ENST00000568468 C8orf34Q49A92 452 aa7.37□□□□□ -1.23
GINS3-210ENST00000568468 BMP2KLQ5H9B9 411 aa7.37□□□□□ -1.23
GINS3-210ENST00000568468 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa7.37□□□□□ -1.23
GINS3-210ENST00000568468 ZNF804AQ7Z570 1209 aa7.37□□□□□ -1.23
GINS3-210ENST00000568468 HAUS7Q99871 368 aa7.37□□□□□ -1.23
GINS3-210ENST00000568468 MXD3Q9BW11 206 aa7.37□□□□□ -1.23
GINS3-210ENST00000568468 CD209Q9NNX6 404 aa7.37□□□□□ -1.23
GINS3-210ENST00000568468 PAG1Q9NWQ8 432 aa7.37□□□□□ -1.23
GINS3-210ENST00000568468 FAM198AQ9UFP1 575 aa7.37□□□□□ -1.23
GINS3-210ENST00000568468 A0A1B0GUL6 1792 aa7.37□□□□□ -1.23
GINS3-210ENST00000568468 LRRC37AA6NMS7 1700 aa7.37□□□□□ -1.23
GINS3-210ENST00000568468 MED23Q9ULK4 1368 aa7.36□□□□□ -1.23
GINS3-210ENST00000568468 LTBP3Q9NS15 1303 aa7.36□□□□□ -1.23
GINS3-210ENST00000568468 PPIP5K2O43314 1243 aa7.36□□□□□ -1.23
GINS3-210ENST00000568468 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
GINS3-210ENST00000568468 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa7.36□□□□□ -1.23
GINS3-210ENST00000568468 SOGA3Q5TF21 947 aa7.36□□□□□ -1.23
GINS3-210ENST00000568468 CNTROBQ8N137 903 aa7.36□□□□□ -1.23
GINS3-210ENST00000568468 SPATA5Q8NB90 893 aa7.36□□□□□ -1.23
GINS3-210ENST00000568468 EYA3Q99504 573 aa7.36□□□□□ -1.23
GINS3-210ENST00000568468 FSD1Q9BTV5 496 aa7.36□□□□□ -1.23
GINS3-210ENST00000568468 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
GINS3-210ENST00000568468 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
GINS3-210ENST00000568468 KCNQ5Q9NR82 932 aa7.36□□□□□ -1.23
GINS3-210ENST00000568468 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
GINS3-210ENST00000568468 CHD4Q14839 1912 aa7.35□□□□□ -1.23
GINS3-210ENST00000568468 ECE2O60344 883 aa7.35□□□□□ -1.23
GINS3-210ENST00000568468 CDC45O75419 566 aa7.35□□□□□ -1.23
GINS3-210ENST00000568468 IDH1O75874 414 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
GINS3-210ENST00000568468 PRSS12P56730 875 aa7.35□□□□□ -1.23
GINS3-210ENST00000568468 GTF2IP78347 998 aa7.35□□□□□ -1.23
GINS3-210ENST00000568468 GRIK5Q16478 980 aa7.35□□□□□ -1.23
GINS3-210ENST00000568468 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa7.35□□□□□ -1.23
GINS3-210ENST00000568468 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
GINS3-210ENST00000568468 RTKN2Q8IZC4 609 aa7.35□□□□□ -1.23
GINS3-210ENST00000568468 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
GINS3-210ENST00000568468 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP7.35□□□□□ -1.23
GINS3-210ENST00000568468 EVI5LQ96CN4 794 aa7.35□□□□□ -1.23
GINS3-210ENST00000568468 FAM227BQ96M60 508 aa7.35□□□□□ -1.23
GINS3-210ENST00000568468 NBPF3Q9H094 633 aa7.35□□□□□ -1.23
GINS3-210ENST00000568468 IL25Q9H293 177 aa7.35□□□□□ -1.23
GINS3-210ENST00000568468 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
GINS3-210ENST00000568468 ABCF2Q9UG63 623 aa7.35□□□□□ -1.23
GINS3-210ENST00000568468 LTBP1Q14766 1721 aa7.35□□□□□ -1.23
GINS3-210ENST00000568468 ARAP2Q8WZ64 1704 aa7.35□□□□□ -1.23
GINS3-210ENST00000568468 COL4A5P29400 1685 aa7.35□□□□□ -1.23
GINS3-210ENST00000568468 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa7.34□□□□□ -1.23
GINS3-210ENST00000568468 A0A0D9SFI3 127 aa7.34□□□□□ -1.23
GINS3-210ENST00000568468 YDJCA8MPS7 323 aa7.34□□□□□ -1.23
GINS3-210ENST00000568468 RAD17O75943 681 aa7.34□□□□□ -1.23
GINS3-210ENST00000568468 IL1R1P14778 569 aa7.34□□□□□ -1.23
GINS3-210ENST00000568468 LMNB1P20700 586 aa7.34□□□□□ -1.23
GINS3-210ENST00000568468 CHMLP26374 656 aa7.34□□□□□ -1.23
GINS3-210ENST00000568468 PRDX5P30044 214 aa7.34□□□□□ -1.23
GINS3-210ENST00000568468 IARSP41252 1262 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
GINS3-210ENST00000568468 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
GINS3-210ENST00000568468 KIAA2012Q0VF49 1180 aa7.34□□□□□ -1.23
GINS3-210ENST00000568468 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
GINS3-210ENST00000568468 C9orf131Q5VYM1 1079 aa7.34□□□□□ -1.23
GINS3-210ENST00000568468 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
GINS3-210ENST00000568468 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa7.34□□□□□ -1.23
GINS3-210ENST00000568468 LARGE2Q8N3Y3 721 aa7.34□□□□□ -1.23
GINS3-210ENST00000568468 KBTBD3Q8NAB2 608 aa7.34□□□□□ -1.23
GINS3-210ENST00000568468 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
GINS3-210ENST00000568468 SUPT20HQ8NEM7 779 aa7.34□□□□□ -1.23
GINS3-210ENST00000568468 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
GINS3-210ENST00000568468 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
GINS3-210ENST00000568468 PSMD1Q99460 953 aa7.34□□□□□ -1.23
GINS3-210ENST00000568468 COA1Q9GZY4 146 aa7.34□□□□□ -1.23
GINS3-210ENST00000568468 TAOK3Q9H2K8 898 aa7.34□□□□□ -1.23
GINS3-210ENST00000568468 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa7.34□□□□□ -1.23
GINS3-210ENST00000568468 RNF181Q9P0P0 153 aa7.34□□□□□ -1.23
GINS3-210ENST00000568468 TSKSQ9UJT2 592 aa7.34□□□□□ -1.23
GINS3-210ENST00000568468 DENND2AQ9ULE3 1009 aa7.34□□□□□ -1.23
GINS3-210ENST00000568468 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
GINS3-210ENST00000568468 F8W031 263 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
GINS3-210ENST00000568468 M0R2C6 588 aa7.33□□□□□ -1.24
GINS3-210ENST00000568468 PDE6AP16499 860 aa7.33□□□□□ -1.24
GINS3-210ENST00000568468 PROX2Q3B8N5 592 aa7.33□□□□□ -1.24
GINS3-210ENST00000568468 NIM1KQ8IY84 436 aa7.33□□□□□ -1.24
GINS3-210ENST00000568468 CERS5Q8N5B7 392 aa7.33□□□□□ -1.24
GINS3-210ENST00000568468 MAGEB6Q8N7X4 407 aa7.33□□□□□ -1.24
GINS3-210ENST00000568468 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa7.33□□□□□ -1.24
GINS3-210ENST00000568468 BACH2Q9BYV9 841 aa7.33□□□□□ -1.24
GINS3-210ENST00000568468 RAI14Q9P0K7 980 aa7.33□□□□□ -1.24
GINS3-210ENST00000568468 LRP2BPQ9P2M1 347 aa7.33□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.8 ms