RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567771.5

SPNS1-209, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 3

Gene SPNS1, Length 829 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-209ENST00000567771 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP31.56■■■□□ 2.64
SPNS1-209ENST00000567771 CRHR2Q13324 411 aa31.56■■■□□ 2.64
SPNS1-209ENST00000567771 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP31.56■■■□□ 2.64
SPNS1-209ENST00000567771 A0A1B0GUL7 405 aa31.55■■■□□ 2.64
SPNS1-209ENST00000567771 GNAI2P04899 355 aa31.55■■■□□ 2.64
SPNS1-209ENST00000567771 FAM151AQ8WW52 585 aa31.55■■■□□ 2.64
SPNS1-209ENST00000567771 HOOK2Q96ED9 719 aa31.55■■■□□ 2.64
SPNS1-209ENST00000567771 OTUD5Q96G74 571 aa31.55■■■□□ 2.64
SPNS1-209ENST00000567771 WRNIP1Q96S55 665 aa31.55■■■□□ 2.64
SPNS1-209ENST00000567771 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa31.55■■■□□ 2.64
SPNS1-209ENST00000567771 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP31.55■■■□□ 2.64
SPNS1-209ENST00000567771 RASGRF1Q13972 1273 aa31.54■■■□□ 2.64
SPNS1-209ENST00000567771 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP31.54■■■□□ 2.64
SPNS1-209ENST00000567771 BRI3BPQ8WY22 251 aa31.54■■■□□ 2.64
SPNS1-209ENST00000567771 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP31.54■■■□□ 2.64
SPNS1-209ENST00000567771 AKAP2Q9Y2D5 859 aa31.54■■■□□ 2.64
SPNS1-209ENST00000567771 TCP10Q12799 353 aa31.53■■■□□ 2.64
SPNS1-209ENST00000567771 NFIAQ12857 509 aa31.53■■■□□ 2.64
SPNS1-209ENST00000567771 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP31.53■■■□□ 2.64
SPNS1-209ENST00000567771 MIGA2Q7L4E1 593 aa31.53■■■□□ 2.64
SPNS1-209ENST00000567771 XAGE2Q96GT9 111 aa31.53■■■□□ 2.64
SPNS1-209ENST00000567771 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa31.52■■■□□ 2.64
SPNS1-209ENST00000567771 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa31.52■■■□□ 2.64
SPNS1-209ENST00000567771 SPDYE5A6NIY4 337 aa31.52■■■□□ 2.64
SPNS1-209ENST00000567771 GTF2A2P52657 109 aa31.52■■■□□ 2.64
SPNS1-209ENST00000567771 CCL15Q16663 113 aa31.52■■■□□ 2.64
SPNS1-209ENST00000567771 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa31.52■■■□□ 2.64
SPNS1-209ENST00000567771 DCAF15Q66K64 600 aa31.52■■■□□ 2.64
SPNS1-209ENST00000567771 TMEM57Q8N5G2 664 aa31.52■■■□□ 2.64
SPNS1-209ENST00000567771 USP40Q9NVE5 1235 aa31.52■■■□□ 2.64
SPNS1-209ENST00000567771 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP31.51■■■□□ 2.63
SPNS1-209ENST00000567771 ERO1BQ86YB8 467 aa31.5■■■□□ 2.63
SPNS1-209ENST00000567771 ZNF341Q9BYN7 854 aa31.5■■■□□ 2.63
SPNS1-209ENST00000567771 FAM198AQ9UFP1 575 aa31.5■■■□□ 2.63
SPNS1-209ENST00000567771 TRIM17Q9Y577 477 aa31.5■■■□□ 2.63
SPNS1-209ENST00000567771 MVPQ14764 893 aaKnown RBP31.49■■■□□ 2.63
SPNS1-209ENST00000567771 NEUROD6Q96NK8 337 aa31.49■■■□□ 2.63
SPNS1-209ENST00000567771 ABCF2Q9UG63 623 aa31.49■■■□□ 2.63
SPNS1-209ENST00000567771 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP31.49■■■□□ 2.63
SPNS1-209ENST00000567771 OTOP1Q7RTM1 612 aa31.48■■■□□ 2.63
SPNS1-209ENST00000567771 FAM43AQ8N2R8 423 aa31.48■■■□□ 2.63
SPNS1-209ENST00000567771 INPP5BP32019 993 aa31.47■■■□□ 2.63
SPNS1-209ENST00000567771 ZFPM1Q8IX07 1006 aa31.47■■■□□ 2.63
SPNS1-209ENST00000567771 CD99L2Q8TCZ2 262 aa31.47■■■□□ 2.63
SPNS1-209ENST00000567771 ERO1AQ96HE7 468 aa31.47■■■□□ 2.63
SPNS1-209ENST00000567771 GAKO14976 1311 aa31.47■■■□□ 2.63
SPNS1-209ENST00000567771 IRF6O14896 467 aa31.46■■■□□ 2.63
SPNS1-209ENST00000567771 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP31.46■■■□□ 2.63
SPNS1-209ENST00000567771 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP31.46■■■□□ 2.63
SPNS1-209ENST00000567771 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP31.46■■■□□ 2.63
SPNS1-209ENST00000567771 SP3Q02447 781 aa31.45■■■□□ 2.63
SPNS1-209ENST00000567771 ZNF112Q9UJU3 913 aa31.45■■■□□ 2.63
SPNS1-209ENST00000567771 PPIL2Q13356 520 aa31.44■■■□□ 2.62
SPNS1-209ENST00000567771 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP31.44■■■□□ 2.62
SPNS1-209ENST00000567771 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa31.44■■■□□ 2.62
SPNS1-209ENST00000567771 MYH2Q9UKX2 1941 aa31.43■■■□□ 2.62
SPNS1-209ENST00000567771 CETPP11597 493 aa31.43■■■□□ 2.62
SPNS1-209ENST00000567771 CAP1Q01518 475 aa31.43■■■□□ 2.62
SPNS1-209ENST00000567771 SNAPC2Q13487 334 aa31.43■■■□□ 2.62
SPNS1-209ENST00000567771 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP31.43■■■□□ 2.62
SPNS1-209ENST00000567771 IDI2Q9BXS1 227 aa31.43■■■□□ 2.62
SPNS1-209ENST00000567771 HMG20BQ9P0W2 317 aa31.43■■■□□ 2.62
SPNS1-209ENST00000567771 RGS3P49796 1198 aa31.42■■■□□ 2.62
SPNS1-209ENST00000567771 PPATQ06203 517 aa31.42■■■□□ 2.62
SPNS1-209ENST00000567771 GORABQ5T7V8 394 aa31.42■■■□□ 2.62
SPNS1-209ENST00000567771 SLF2Q8IX21 1173 aa31.42■■■□□ 2.62
SPNS1-209ENST00000567771 AK9Q5TCS8 1911 aa31.41■■■□□ 2.62
SPNS1-209ENST00000567771 POLA2Q14181 598 aa31.41■■■□□ 2.62
SPNS1-209ENST00000567771 PI16Q6UXB8 463 aa31.41■■■□□ 2.62
SPNS1-209ENST00000567771 ERICH6Q7L0X2 663 aa31.41■■■□□ 2.62
SPNS1-209ENST00000567771 BTBD19C9JJ37 291 aa31.4■■■□□ 2.62
SPNS1-209ENST00000567771 ENTPD3O75355 529 aa31.4■■■□□ 2.62
SPNS1-209ENST00000567771 BTDP43251 543 aa31.4■■■□□ 2.62
SPNS1-209ENST00000567771 MECOMQ03112 1051 aa31.4■■■□□ 2.62
SPNS1-209ENST00000567771 SPATA5Q8NB90 893 aa31.4■■■□□ 2.62
SPNS1-209ENST00000567771 ZNF384Q8TF68 577 aa31.4■■■□□ 2.62
SPNS1-209ENST00000567771 EFCC1Q9HA90 598 aa31.4■■■□□ 2.62
SPNS1-209ENST00000567771 PTPN22Q9Y2R2 807 aa31.4■■■□□ 2.62
SPNS1-209ENST00000567771 RFX7Q2KHR2 1363 aa31.4■■■□□ 2.62
SPNS1-209ENST00000567771 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP31.39■■■□□ 2.62
SPNS1-209ENST00000567771 ATP8B2P98198 1209 aa31.39■■■□□ 2.62
SPNS1-209ENST00000567771 C1orf115Q9H7X2 142 aa31.39■■■□□ 2.62
SPNS1-209ENST00000567771 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa31.39■■■□□ 2.62
SPNS1-209ENST00000567771 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP31.38■■■□□ 2.61
SPNS1-209ENST00000567771 RLBP1P12271 317 aa31.38■■■□□ 2.61
SPNS1-209ENST00000567771 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP31.38■■■□□ 2.61
SPNS1-209ENST00000567771 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa31.38■■■□□ 2.61
SPNS1-209ENST00000567771 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa31.38■■■□□ 2.61
SPNS1-209ENST00000567771 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP31.38■■■□□ 2.61
SPNS1-209ENST00000567771 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP31.38■■■□□ 2.61
SPNS1-209ENST00000567771 ATRNL1Q5VV63 1379 aa31.38■■■□□ 2.61
SPNS1-209ENST00000567771 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP31.37■■■□□ 2.61
SPNS1-209ENST00000567771 SSH3Q8TE77 659 aa31.37■■■□□ 2.61
SPNS1-209ENST00000567771 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP31.37■■■□□ 2.61
SPNS1-209ENST00000567771 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa31.36■■■□□ 2.61
SPNS1-209ENST00000567771 MCAMP43121 646 aa31.36■■■□□ 2.61
SPNS1-209ENST00000567771 ITPRIPQ8IWB1 547 aa31.36■■■□□ 2.61
SPNS1-209ENST00000567771 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP31.35■■■□□ 2.61
SPNS1-209ENST00000567771 TLR2O60603 784 aa31.35■■■□□ 2.61
SPNS1-209ENST00000567771 RHBDL3P58872 404 aa31.35■■■□□ 2.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.2 ms