RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561136.1

TMOD3-209, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 803 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-209ENST00000561136 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
TMOD3-209ENST00000561136 SPON1Q9HCB6 807 aa7.37□□□□□ -1.23
TMOD3-209ENST00000561136 PRDM10Q9NQV6 1147 aa7.37□□□□□ -1.23
TMOD3-209ENST00000561136 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
TMOD3-209ENST00000561136 COL24A1Q17RW2 1714 aa7.36□□□□□ -1.23
TMOD3-209ENST00000561136 DOT1LQ8TEK3 1739 aa7.36□□□□□ -1.23
TMOD3-209ENST00000561136 USP19O94966 1318 aa7.36□□□□□ -1.23
TMOD3-209ENST00000561136 A6NJY4 79 aa7.36□□□□□ -1.23
TMOD3-209ENST00000561136 SPEM2Q0P670 501 aa7.36□□□□□ -1.23
TMOD3-209ENST00000561136 FAM196AQ6ZSG2 479 aa7.36□□□□□ -1.23
TMOD3-209ENST00000561136 FMNL2Q96PY5 1086 aa7.36□□□□□ -1.23
TMOD3-209ENST00000561136 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
TMOD3-209ENST00000561136 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa7.35□□□□□ -1.23
TMOD3-209ENST00000561136 NEUROD1Q13562 356 aa7.35□□□□□ -1.23
TMOD3-209ENST00000561136 MTFR1Q15390 333 aa7.35□□□□□ -1.23
TMOD3-209ENST00000561136 EXOC8Q8IYI6 725 aa7.35□□□□□ -1.23
TMOD3-209ENST00000561136 CNPY4Q8N129 248 aa7.35□□□□□ -1.23
TMOD3-209ENST00000561136 NEUROD4Q9HD90 331 aa7.35□□□□□ -1.23
TMOD3-209ENST00000561136 POGKQ9P215 609 aa7.35□□□□□ -1.23
TMOD3-209ENST00000561136 LTN1O94822 1766 aa7.35□□□□□ -1.23
TMOD3-209ENST00000561136 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
TMOD3-209ENST00000561136 NFAT5O94916 1531 aa7.34□□□□□ -1.23
TMOD3-209ENST00000561136 ABCC6O95255 1503 aa7.34□□□□□ -1.23
TMOD3-209ENST00000561136 TMEM229AB2RXF0 380 aa7.34□□□□□ -1.23
TMOD3-209ENST00000561136 PTMAP06454 111 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
TMOD3-209ENST00000561136 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa7.34□□□□□ -1.23
TMOD3-209ENST00000561136 MTMR14Q8NCE2 650 aa7.34□□□□□ -1.23
TMOD3-209ENST00000561136 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
TMOD3-209ENST00000561136 SLC4A9Q96Q91 983 aa7.34□□□□□ -1.23
TMOD3-209ENST00000561136 MPHOSPH9Q99550 1183 aa7.34□□□□□ -1.23
TMOD3-209ENST00000561136 QSER1Q2KHR3 1735 aa7.34□□□□□ -1.23
TMOD3-209ENST00000561136 CRB1P82279 1406 aa7.34□□□□□ -1.23
TMOD3-209ENST00000561136 CPDO75976 1380 aa7.33□□□□□ -1.24
TMOD3-209ENST00000561136 SSTR4P31391 388 aa7.33□□□□□ -1.24
TMOD3-209ENST00000561136 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa7.33□□□□□ -1.24
TMOD3-209ENST00000561136 TCP11L2Q8N4U5 519 aa7.33□□□□□ -1.24
TMOD3-209ENST00000561136 GPATCH11Q8N954 259 aa7.33□□□□□ -1.24
TMOD3-209ENST00000561136 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
TMOD3-209ENST00000561136 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
TMOD3-209ENST00000561136 TNS2Q63HR2 1409 aa7.33□□□□□ -1.24
TMOD3-209ENST00000561136 ACEP12821 1306 aa7.32□□□□□ -1.24
TMOD3-209ENST00000561136 IRAK1P51617 712 aa7.32□□□□□ -1.24
TMOD3-209ENST00000561136 C1QTNF8P60827 252 aa7.32□□□□□ -1.24
TMOD3-209ENST00000561136 PDE3BQ13370 1112 aa7.32□□□□□ -1.24
TMOD3-209ENST00000561136 ZNF827Q17R98 1081 aa7.32□□□□□ -1.24
TMOD3-209ENST00000561136 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa7.32□□□□□ -1.24
TMOD3-209ENST00000561136 NUDT8Q8WV74 236 aa7.32□□□□□ -1.24
TMOD3-209ENST00000561136 GOPCQ9HD26 462 aa7.32□□□□□ -1.24
TMOD3-209ENST00000561136 RGPD2P0DJD1 1756 aa7.32□□□□□ -1.24
TMOD3-209ENST00000561136 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa7.32□□□□□ -1.24
TMOD3-209ENST00000561136 MON2Q7Z3U7 1717 aa7.32□□□□□ -1.24
TMOD3-209ENST00000561136 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa7.32□□□□□ -1.24
TMOD3-209ENST00000561136 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
TMOD3-209ENST00000561136 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP7.31□□□□□ -1.24
TMOD3-209ENST00000561136 NBPF8Q3BBV2 869 aa7.31□□□□□ -1.24
TMOD3-209ENST00000561136 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
TMOD3-209ENST00000561136 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
TMOD3-209ENST00000561136 L3MBTL2Q969R5 705 aa7.31□□□□□ -1.24
TMOD3-209ENST00000561136 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
TMOD3-209ENST00000561136 IGFLR1Q9H665 355 aa7.31□□□□□ -1.24
TMOD3-209ENST00000561136 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa7.31□□□□□ -1.24
TMOD3-209ENST00000561136 LY75O60449 1722 aa7.3□□□□□ -1.24
TMOD3-209ENST00000561136 USP6P35125 1406 aa7.3□□□□□ -1.24
TMOD3-209ENST00000561136 IREB2P48200 963 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
TMOD3-209ENST00000561136 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
TMOD3-209ENST00000561136 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa7.3□□□□□ -1.24
TMOD3-209ENST00000561136 NLGN2Q8NFZ4 835 aa7.3□□□□□ -1.24
TMOD3-209ENST00000561136 WFDC12Q8WWY7 111 aa7.3□□□□□ -1.24
TMOD3-209ENST00000561136 SYT17Q9BSW7 474 aa7.3□□□□□ -1.24
TMOD3-209ENST00000561136 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
TMOD3-209ENST00000561136 USP54Q70EL1 1684 aa7.29□□□□□ -1.24
TMOD3-209ENST00000561136 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
TMOD3-209ENST00000561136 KCNQ4P56696 695 aa7.29□□□□□ -1.24
TMOD3-209ENST00000561136 FZD5Q13467 585 aa7.29□□□□□ -1.24
TMOD3-209ENST00000561136 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
TMOD3-209ENST00000561136 BHMTQ93088 406 aa7.29□□□□□ -1.24
TMOD3-209ENST00000561136 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
TMOD3-209ENST00000561136 EML1O00423 815 aa7.28□□□□□ -1.24
TMOD3-209ENST00000561136 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
TMOD3-209ENST00000561136 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
TMOD3-209ENST00000561136 EVA1CP58658 441 aa7.28□□□□□ -1.24
TMOD3-209ENST00000561136 TXNRD1Q16881 649 aa7.28□□□□□ -1.24
TMOD3-209ENST00000561136 BANK1Q8NDB2 785 aa7.28□□□□□ -1.24
TMOD3-209ENST00000561136 ACSBG1Q96GR2 724 aa7.28□□□□□ -1.24
TMOD3-209ENST00000561136 CEP63Q96MT8 703 aa7.28□□□□□ -1.24
TMOD3-209ENST00000561136 BRD7Q9NPI1 651 aa7.28□□□□□ -1.24
TMOD3-209ENST00000561136 SNRKQ9NRH2 765 aa7.28□□□□□ -1.24
TMOD3-209ENST00000561136 SLC6A14Q9UN76 642 aa7.28□□□□□ -1.24
TMOD3-209ENST00000561136 ZNF232Q9UNY5 417 aa7.28□□□□□ -1.24
TMOD3-209ENST00000561136 RNF114Q9Y508 228 aa7.28□□□□□ -1.24
TMOD3-209ENST00000561136 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa7.28□□□□□ -1.24
TMOD3-209ENST00000561136 C5P01031 1676 aa7.28□□□□□ -1.24
TMOD3-209ENST00000561136 ATP10DQ9P241 1426 aa7.27□□□□□ -1.24
TMOD3-209ENST00000561136 NOS3P29474 1203 aa7.27□□□□□ -1.25
TMOD3-209ENST00000561136 NOS2P35228 1153 aa7.27□□□□□ -1.25
TMOD3-209ENST00000561136 DDB1Q16531 1140 aa7.27□□□□□ -1.25
TMOD3-209ENST00000561136 PRR23CQ6ZRP0 262 aa7.27□□□□□ -1.25
TMOD3-209ENST00000561136 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
TMOD3-209ENST00000561136 ABTB2Q8N961 1025 aa7.27□□□□□ -1.25
TMOD3-209ENST00000561136 PLPP7Q8NBV4 271 aa7.27□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.3 ms