RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558555.5

MEIS3-204, Transcript of Meis homeobox 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene MEIS3, Length 1,715 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3-204ENST00000558555 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP28.51■■■□□ 2.15
MEIS3-204ENST00000558555 NACAP1Q9BZK3 213 aa28.51■■■□□ 2.15
MEIS3-204ENST00000558555 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP28.51■■■□□ 2.15
MEIS3-204ENST00000558555 GAKO14976 1311 aa28.51■■■□□ 2.15
MEIS3-204ENST00000558555 PLCG2P16885 1265 aa28.5■■■□□ 2.15
MEIS3-204ENST00000558555 SCNN1DP51172 638 aa28.5■■■□□ 2.15
MEIS3-204ENST00000558555 PPP4CP60510 307 aa28.5■■■□□ 2.15
MEIS3-204ENST00000558555 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP28.5■■■□□ 2.15
MEIS3-204ENST00000558555 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa28.49■■■□□ 2.15
MEIS3-204ENST00000558555 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP28.49■■■□□ 2.15
MEIS3-204ENST00000558555 CREB3L3Q68CJ9 461 aa28.49■■■□□ 2.15
MEIS3-204ENST00000558555 HHIPL2Q6UWX4 724 aa28.49■■■□□ 2.15
MEIS3-204ENST00000558555 MRIQ9BWK5 157 aa28.49■■■□□ 2.15
MEIS3-204ENST00000558555 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP28.49■■■□□ 2.15
MEIS3-204ENST00000558555 BTDP43251 543 aa28.49■■■□□ 2.15
MEIS3-204ENST00000558555 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa28.49■■■□□ 2.15
MEIS3-204ENST00000558555 FOXP2O15409 715 aa28.48■■■□□ 2.15
MEIS3-204ENST00000558555 AGBL3Q8NEM8 1001 aa28.48■■■□□ 2.15
MEIS3-204ENST00000558555 FZD9O00144 591 aa28.47■■■□□ 2.15
MEIS3-204ENST00000558555 SLC27A2O14975 620 aa28.47■■■□□ 2.15
MEIS3-204ENST00000558555 CRKP46108 304 aa28.47■■■□□ 2.15
MEIS3-204ENST00000558555 ALX1Q15699 326 aa28.47■■■□□ 2.15
MEIS3-204ENST00000558555 DDRGK1Q96HY6 314 aa28.47■■■□□ 2.15
MEIS3-204ENST00000558555 HDAC9Q9UKV0 1011 aa28.47■■■□□ 2.15
MEIS3-204ENST00000558555 PALD1Q9ULE6 856 aa28.47■■■□□ 2.15
MEIS3-204ENST00000558555 GSG1L2A8MUP6 293 aa28.46■■■□□ 2.15
MEIS3-204ENST00000558555 PRKAB2O43741 272 aa28.46■■■□□ 2.15
MEIS3-204ENST00000558555 FGAP02671 866 aa28.46■■■□□ 2.15
MEIS3-204ENST00000558555 NAPBQ9H115 298 aa28.46■■■□□ 2.15
MEIS3-204ENST00000558555 SERPINA10Q9UK55 444 aa28.46■■■□□ 2.15
MEIS3-204ENST00000558555 ZMYM6O95789 1325 aa28.46■■■□□ 2.15
MEIS3-204ENST00000558555 TDO2P48775 406 aa28.46■■■□□ 2.15
MEIS3-204ENST00000558555 IFNL3Q8IZI9 196 aa28.46■■■□□ 2.15
MEIS3-204ENST00000558555 OGFOD1Q8N543 542 aa28.46■■■□□ 2.15
MEIS3-204ENST00000558555 KCNB2Q92953 911 aa28.46■■■□□ 2.15
MEIS3-204ENST00000558555 GMLQ99445 158 aa28.46■■■□□ 2.15
MEIS3-204ENST00000558555 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP28.45■■■□□ 2.14
MEIS3-204ENST00000558555 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP28.45■■■□□ 2.14
MEIS3-204ENST00000558555 SNX14Q9Y5W7 946 aa28.45■■■□□ 2.14
MEIS3-204ENST00000558555 GIMAP6Q6P9H5 292 aa28.44■■■□□ 2.14
MEIS3-204ENST00000558555 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP28.44■■■□□ 2.14
MEIS3-204ENST00000558555 SDR42E1Q8WUS8 393 aa28.44■■■□□ 2.14
MEIS3-204ENST00000558555 ZDHHC15Q96MV8 337 aa28.44■■■□□ 2.14
MEIS3-204ENST00000558555 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa28.44■■■□□ 2.14
MEIS3-204ENST00000558555 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP28.44■■■□□ 2.14
MEIS3-204ENST00000558555 RPS12P25398 132 aaKnown RBP28.43■■■□□ 2.14
MEIS3-204ENST00000558555 KIF2CQ99661 725 aa28.43■■■□□ 2.14
MEIS3-204ENST00000558555 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa28.43■■■□□ 2.14
MEIS3-204ENST00000558555 USP5P45974 858 aa28.43■■■□□ 2.14
MEIS3-204ENST00000558555 TEX11Q8IYF3 940 aa28.43■■■□□ 2.14
MEIS3-204ENST00000558555 RASEFQ8IZ41 740 aa28.43■■■□□ 2.14
MEIS3-204ENST00000558555 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP28.43■■■□□ 2.14
MEIS3-204ENST00000558555 USP17L8P0C7I0 530 aa28.42■■■□□ 2.14
MEIS3-204ENST00000558555 KRT32Q14532 448 aa28.42■■■□□ 2.14
MEIS3-204ENST00000558555 RABEP1Q15276 862 aa28.42■■■□□ 2.14
MEIS3-204ENST00000558555 IL17RAQ96F46 866 aa28.42■■■□□ 2.14
MEIS3-204ENST00000558555 TIAM2Q8IVF5 1701 aa28.42■■■□□ 2.14
MEIS3-204ENST00000558555 ZNF213O14771 459 aa28.41■■■□□ 2.14
MEIS3-204ENST00000558555 CYP21A2P08686 494 aa28.41■■■□□ 2.14
MEIS3-204ENST00000558555 MMP14P50281 582 aa28.41■■■□□ 2.14
MEIS3-204ENST00000558555 GJA3Q9Y6H8 435 aa28.41■■■□□ 2.14
MEIS3-204ENST00000558555 LAMA4Q16363 1823 aa28.41■■■□□ 2.14
MEIS3-204ENST00000558555 TSGA10IPQ3SY00 556 aa28.4■■■□□ 2.14
MEIS3-204ENST00000558555 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP28.4■■■□□ 2.14
MEIS3-204ENST00000558555 RHBDL3P58872 404 aa28.4■■■□□ 2.14
MEIS3-204ENST00000558555 CFAP100Q494V2 611 aa28.4■■■□□ 2.14
MEIS3-204ENST00000558555 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa28.4■■■□□ 2.14
MEIS3-204ENST00000558555 USP40Q9NVE5 1235 aa28.4■■■□□ 2.14
MEIS3-204ENST00000558555 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP28.39■■■□□ 2.14
MEIS3-204ENST00000558555 NMRK2Q9NPI5 230 aa28.39■■■□□ 2.14
MEIS3-204ENST00000558555 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP28.39■■■□□ 2.14
MEIS3-204ENST00000558555 ZNF541Q9H0D2 1346 aa28.39■■■□□ 2.13
MEIS3-204ENST00000558555 PSMA5P28066 241 aa28.38■■■□□ 2.13
MEIS3-204ENST00000558555 HAND2P61296 217 aa28.38■■■□□ 2.13
MEIS3-204ENST00000558555 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa28.38■■■□□ 2.13
MEIS3-204ENST00000558555 ECM29Q5VYK3 1845 aa28.38■■■□□ 2.13
MEIS3-204ENST00000558555 NAV1Q8NEY1 1877 aa28.38■■■□□ 2.13
MEIS3-204ENST00000558555 C1QTNF8P60827 252 aa28.38■■■□□ 2.13
MEIS3-204ENST00000558555 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP28.38■■■□□ 2.13
MEIS3-204ENST00000558555 DLGAP5Q15398 846 aa28.37■■■□□ 2.13
MEIS3-204ENST00000558555 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa28.37■■■□□ 2.13
MEIS3-204ENST00000558555 DPF2Q92785 391 aa28.37■■■□□ 2.13
MEIS3-204ENST00000558555 FOCADQ5VW36 1801 aa28.36■■■□□ 2.13
MEIS3-204ENST00000558555 KIF3CO14782 793 aa28.36■■■□□ 2.13
MEIS3-204ENST00000558555 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP28.36■■■□□ 2.13
MEIS3-204ENST00000558555 AMOTL1Q8IY63 956 aa28.36■■■□□ 2.13
MEIS3-204ENST00000558555 TM6SF1Q9BZW5 370 aa28.36■■■□□ 2.13
MEIS3-204ENST00000558555 GPC2Q8N158 579 aa28.35■■■□□ 2.13
MEIS3-204ENST00000558555 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP28.35■■■□□ 2.13
MEIS3-204ENST00000558555 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa28.35■■■□□ 2.13
MEIS3-204ENST00000558555 IL27Q8NEV9 243 aa28.35■■■□□ 2.13
MEIS3-204ENST00000558555 MCM9Q9NXL9 1143 aa28.35■■■□□ 2.13
MEIS3-204ENST00000558555 TAF6LQ9Y6J9 622 aa28.35■■■□□ 2.13
MEIS3-204ENST00000558555 MINDY4BA8MYZ0 360 aa28.34■■■□□ 2.13
MEIS3-204ENST00000558555 CASTP20810 708 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
MEIS3-204ENST00000558555 ADCK5Q3MIX3 580 aa28.34■■■□□ 2.13
MEIS3-204ENST00000558555 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa28.34■■■□□ 2.13
MEIS3-204ENST00000558555 SPDYE2BA6NHP3 402 aa28.33■■■□□ 2.13
MEIS3-204ENST00000558555 USP17L12C9JPN9 530 aa28.33■■■□□ 2.13
MEIS3-204ENST00000558555 USP17L21D6R901 530 aa28.33■■■□□ 2.13
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