RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558394.5

TSPAN3-204, Transcript of tetraspanin 3, humanhuman

TSL 4

Gene TSPAN3, Length 550 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN3-204ENST00000558394 VAMP4O75379 141 aa22.48■■□□□ 1.19
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TSPAN3-204ENST00000558394 MIGA2Q7L4E1 593 aa22.48■■□□□ 1.19
TSPAN3-204ENST00000558394 FANCIQ9NVI1 1328 aa22.48■■□□□ 1.19
TSPAN3-204ENST00000558394 DLL1O00548 723 aa22.47■■□□□ 1.19
TSPAN3-204ENST00000558394 FBXO33Q7Z6M2 555 aa22.47■■□□□ 1.19
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TSPAN3-204ENST00000558394 ADGRA2Q96PE1 1338 aa22.41■■□□□ 1.18
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TSPAN3-204ENST00000558394 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
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TSPAN3-204ENST00000558394 COA7Q96BR5 231 aa22.31■■□□□ 1.16
TSPAN3-204ENST00000558394 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
TSPAN3-204ENST00000558394 LDHBP07195 334 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
TSPAN3-204ENST00000558394 NECAB2Q7Z6G3 386 aa22.3■■□□□ 1.16
TSPAN3-204ENST00000558394 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
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