RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557478.5

NEDD1-212, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 1, humanhuman

TSL 5

Gene NEDD1, Length 595 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1-212ENST00000557478 ERICH6Q7L0X2 663 aa21.54■■□□□ 1.04
NEDD1-212ENST00000557478 ERC1Q8IUD2 1116 aa21.54■■□□□ 1.04
NEDD1-212ENST00000557478 AOX1Q06278 1338 aa21.54■■□□□ 1.04
NEDD1-212ENST00000557478 SURF6O75683 361 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
NEDD1-212ENST00000557478 LDHCP07864 332 aa21.53■■□□□ 1.04
NEDD1-212ENST00000557478 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
NEDD1-212ENST00000557478 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
NEDD1-212ENST00000557478 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
NEDD1-212ENST00000557478 ABCF2Q9UG63 623 aa21.53■■□□□ 1.04
NEDD1-212ENST00000557478 DDX19BQ9UMR2 479 aa21.53■■□□□ 1.04
NEDD1-212ENST00000557478 SPATA5Q8NB90 893 aa21.52■■□□□ 1.04
NEDD1-212ENST00000557478 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP21.52■■□□□ 1.04
NEDD1-212ENST00000557478 ABHD8Q96I13 439 aa21.52■■□□□ 1.04
NEDD1-212ENST00000557478 USP40Q9NVE5 1235 aa21.52■■□□□ 1.04
NEDD1-212ENST00000557478 GAKO14976 1311 aa21.52■■□□□ 1.03
NEDD1-212ENST00000557478 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
NEDD1-212ENST00000557478 RLBP1P12271 317 aa21.51■■□□□ 1.03
NEDD1-212ENST00000557478 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa21.51■■□□□ 1.03
NEDD1-212ENST00000557478 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
NEDD1-212ENST00000557478 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
NEDD1-212ENST00000557478 IDI2Q9BXS1 227 aa21.51■■□□□ 1.03
NEDD1-212ENST00000557478 RCAN3Q9UKA8 241 aa21.51■■□□□ 1.03
NEDD1-212ENST00000557478 HMMRO75330 724 aa21.5■■□□□ 1.03
NEDD1-212ENST00000557478 ENTPD3O75355 529 aa21.5■■□□□ 1.03
NEDD1-212ENST00000557478 GTF2A2P52657 109 aa21.5■■□□□ 1.03
NEDD1-212ENST00000557478 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
NEDD1-212ENST00000557478 DIXDC1Q155Q3 683 aa21.5■■□□□ 1.03
NEDD1-212ENST00000557478 TNNI3KQ59H18 835 aa21.5■■□□□ 1.03
NEDD1-212ENST00000557478 IFNL1Q8IU54 200 aa21.5■■□□□ 1.03
NEDD1-212ENST00000557478 CLMNQ96JQ2 1002 aa21.5■■□□□ 1.03
NEDD1-212ENST00000557478 ZNF341Q9BYN7 854 aa21.5■■□□□ 1.03
NEDD1-212ENST00000557478 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa21.5■■□□□ 1.03
NEDD1-212ENST00000557478 AKAP11Q9UKA4 1901 aa21.49■■□□□ 1.03
NEDD1-212ENST00000557478 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
NEDD1-212ENST00000557478 NPM3O75607 178 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
NEDD1-212ENST00000557478 CAPN15O75808 1086 aa21.49■■□□□ 1.03
NEDD1-212ENST00000557478 CACNB3P54284 484 aa21.49■■□□□ 1.03
NEDD1-212ENST00000557478 DGKZQ13574 1117 aa21.49■■□□□ 1.03
NEDD1-212ENST00000557478 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
NEDD1-212ENST00000557478 OPTNQ96CV9 577 aa21.49■■□□□ 1.03
NEDD1-212ENST00000557478 HMG20BQ9P0W2 317 aa21.49■■□□□ 1.03
NEDD1-212ENST00000557478 VGLL4Q14135 290 aa21.48■■□□□ 1.03
NEDD1-212ENST00000557478 TTC39AQ5SRH9 613 aa21.48■■□□□ 1.03
NEDD1-212ENST00000557478 CEP85Q6P2H3 762 aa21.48■■□□□ 1.03
NEDD1-212ENST00000557478 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
NEDD1-212ENST00000557478 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
NEDD1-212ENST00000557478 ERO1BQ86YB8 467 aa21.48■■□□□ 1.03
NEDD1-212ENST00000557478 WRNIP1Q96S55 665 aa21.48■■□□□ 1.03
NEDD1-212ENST00000557478 MCOLN1Q9GZU1 580 aa21.48■■□□□ 1.03
NEDD1-212ENST00000557478 GPR25O00155 361 aa21.47■■□□□ 1.03
NEDD1-212ENST00000557478 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
NEDD1-212ENST00000557478 ELP3Q9H9T3 547 aa21.47■■□□□ 1.03
NEDD1-212ENST00000557478 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
NEDD1-212ENST00000557478 LRP2BPQ9P2M1 347 aa21.47■■□□□ 1.03
NEDD1-212ENST00000557478 FZD1Q9UP38 647 aa21.47■■□□□ 1.03
NEDD1-212ENST00000557478 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa21.47■■□□□ 1.03
NEDD1-212ENST00000557478 MYH13Q9UKX3 1938 aa21.47■■□□□ 1.03
NEDD1-212ENST00000557478 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa21.46■■□□□ 1.03
NEDD1-212ENST00000557478 SPDYE5A6NIY4 337 aa21.46■■□□□ 1.03
NEDD1-212ENST00000557478 MECOMQ03112 1051 aa21.46■■□□□ 1.03
NEDD1-212ENST00000557478 PDE3AQ14432 1141 aa21.46■■□□□ 1.03
NEDD1-212ENST00000557478 CERS3Q8IU89 383 aa21.46■■□□□ 1.03
NEDD1-212ENST00000557478 PANK1Q8TE04 598 aa21.46■■□□□ 1.03
NEDD1-212ENST00000557478 C1orf115Q9H7X2 142 aa21.46■■□□□ 1.03
NEDD1-212ENST00000557478 FKTNO75072 461 aa21.45■■□□□ 1.02
NEDD1-212ENST00000557478 TBC1D8O95759 1140 aa21.45■■□□□ 1.02
NEDD1-212ENST00000557478 PLCG2P16885 1265 aa21.45■■□□□ 1.02
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NEDD1-212ENST00000557478 ZNF112Q9UJU3 913 aa21.45■■□□□ 1.02
NEDD1-212ENST00000557478 BAG3O95817 575 aa21.44■■□□□ 1.02
NEDD1-212ENST00000557478 CETPP11597 493 aa21.44■■□□□ 1.02
NEDD1-212ENST00000557478 BTDP43251 543 aa21.44■■□□□ 1.02
NEDD1-212ENST00000557478 TCP10Q12799 353 aa21.44■■□□□ 1.02
NEDD1-212ENST00000557478 ARHGEF6Q15052 776 aa21.44■■□□□ 1.02
NEDD1-212ENST00000557478 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
NEDD1-212ENST00000557478 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
NEDD1-212ENST00000557478 RAI14Q9P0K7 980 aa21.44■■□□□ 1.02
NEDD1-212ENST00000557478 MCAMP43121 646 aa21.43■■□□□ 1.02
NEDD1-212ENST00000557478 PPIL2Q13356 520 aa21.43■■□□□ 1.02
NEDD1-212ENST00000557478 SNAPC2Q13487 334 aa21.43■■□□□ 1.02
NEDD1-212ENST00000557478 CDAN1Q8IWY9 1227 aa21.43■■□□□ 1.02
NEDD1-212ENST00000557478 FAM198AQ9UFP1 575 aa21.43■■□□□ 1.02
NEDD1-212ENST00000557478 RGS3P49796 1198 aa21.42■■□□□ 1.02
NEDD1-212ENST00000557478 NFIAQ12857 509 aa21.42■■□□□ 1.02
NEDD1-212ENST00000557478 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
NEDD1-212ENST00000557478 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
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NEDD1-212ENST00000557478 MS4A4AQ96JQ5 239 aa21.42■■□□□ 1.02
NEDD1-212ENST00000557478 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa21.42■■□□□ 1.02
NEDD1-212ENST00000557478 RAB11FIP3O75154 756 aa21.41■■□□□ 1.02
NEDD1-212ENST00000557478 GJA5P36382 358 aa21.41■■□□□ 1.02
NEDD1-212ENST00000557478 DBNDD2Q9BQY9 259 aa21.41■■□□□ 1.02
NEDD1-212ENST00000557478 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
NEDD1-212ENST00000557478 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa21.41■■□□□ 1.02
NEDD1-212ENST00000557478 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
NEDD1-212ENST00000557478 CCDC85CA6NKD9 419 aa21.4■■□□□ 1.02
NEDD1-212ENST00000557478 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP21.4■■□□□ 1.02
NEDD1-212ENST00000557478 MAP3K10Q02779 954 aa21.4■■□□□ 1.02
NEDD1-212ENST00000557478 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
NEDD1-212ENST00000557478 MIGA2Q7L4E1 593 aa21.4■■□□□ 1.02
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