RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557115.5

CIPC-208, Transcript of CLOCK interacting pacemaker, humanhuman

TSL 4

Gene CIPC, Length 882 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPC-208ENST00000557115 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP26.87■■□□□ 1.89
CIPC-208ENST00000557115 MVPQ14764 893 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
CIPC-208ENST00000557115 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa26.87■■□□□ 1.89
CIPC-208ENST00000557115 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
CIPC-208ENST00000557115 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa26.87■■□□□ 1.89
CIPC-208ENST00000557115 OTUD5Q96G74 571 aa26.87■■□□□ 1.89
CIPC-208ENST00000557115 XAGE2Q96GT9 111 aa26.87■■□□□ 1.89
CIPC-208ENST00000557115 WRNIP1Q96S55 665 aa26.87■■□□□ 1.89
CIPC-208ENST00000557115 ABCF2Q9UG63 623 aa26.87■■□□□ 1.89
CIPC-208ENST00000557115 RGS19P49795 217 aa26.86■■□□□ 1.89
CIPC-208ENST00000557115 GORABQ5T7V8 394 aa26.86■■□□□ 1.89
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CIPC-208ENST00000557115 GTF2A2P52657 109 aa26.85■■□□□ 1.89
CIPC-208ENST00000557115 RASGRF1Q13972 1273 aa26.85■■□□□ 1.89
CIPC-208ENST00000557115 MIGA2Q7L4E1 593 aa26.85■■□□□ 1.89
CIPC-208ENST00000557115 FAM151AQ8WW52 585 aa26.85■■□□□ 1.89
CIPC-208ENST00000557115 HPS5Q9UPZ3 1129 aa26.85■■□□□ 1.89
CIPC-208ENST00000557115 MYH13Q9UKX3 1938 aa26.84■■□□□ 1.89
CIPC-208ENST00000557115 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
CIPC-208ENST00000557115 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
CIPC-208ENST00000557115 PTPN18Q99952 460 aa26.84■■□□□ 1.89
CIPC-208ENST00000557115 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
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CIPC-208ENST00000557115 CCL15Q16663 113 aa26.83■■□□□ 1.89
CIPC-208ENST00000557115 SLF2Q8IX21 1173 aa26.83■■□□□ 1.89
CIPC-208ENST00000557115 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP26.83■■□□□ 1.89
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CIPC-208ENST00000557115 ZNF341Q9BYN7 854 aa26.83■■□□□ 1.89
CIPC-208ENST00000557115 SOX10P56693 466 aa26.82■■□□□ 1.88
CIPC-208ENST00000557115 NFIAQ12857 509 aa26.82■■□□□ 1.88
CIPC-208ENST00000557115 ERO1BQ86YB8 467 aa26.82■■□□□ 1.88
CIPC-208ENST00000557115 SPDYE5A6NIY4 337 aa26.81■■□□□ 1.88
CIPC-208ENST00000557115 ZBTB22O15209 634 aa26.81■■□□□ 1.88
CIPC-208ENST00000557115 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP26.81■■□□□ 1.88
CIPC-208ENST00000557115 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa26.81■■□□□ 1.88
CIPC-208ENST00000557115 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
CIPC-208ENST00000557115 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
CIPC-208ENST00000557115 ITPRIPQ8IWB1 547 aa26.8■■□□□ 1.88
CIPC-208ENST00000557115 BRI3BPQ8WY22 251 aa26.8■■□□□ 1.88
CIPC-208ENST00000557115 TRIM17Q9Y577 477 aa26.8■■□□□ 1.88
CIPC-208ENST00000557115 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
CIPC-208ENST00000557115 OTOFQ9HC10 1997 aa26.8■■□□□ 1.88
CIPC-208ENST00000557115 ERICH6Q7L0X2 663 aa26.79■■□□□ 1.88
CIPC-208ENST00000557115 ERO1AQ96HE7 468 aa26.79■■□□□ 1.88
CIPC-208ENST00000557115 FAM198AQ9UFP1 575 aa26.79■■□□□ 1.88
CIPC-208ENST00000557115 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP26.78■■□□□ 1.88
CIPC-208ENST00000557115 CETPP11597 493 aa26.78■■□□□ 1.88
CIPC-208ENST00000557115 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP26.78■■□□□ 1.88
CIPC-208ENST00000557115 INPP5BP32019 993 aa26.77■■□□□ 1.88
CIPC-208ENST00000557115 SNAPC2Q13487 334 aa26.77■■□□□ 1.88
CIPC-208ENST00000557115 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
CIPC-208ENST00000557115 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa26.77■■□□□ 1.88
CIPC-208ENST00000557115 GAKO14976 1311 aa26.76■■□□□ 1.87
CIPC-208ENST00000557115 ZBED9Q6R2W3 1325 aa26.76■■□□□ 1.87
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CIPC-208ENST00000557115 SP3Q02447 781 aa26.76■■□□□ 1.87
CIPC-208ENST00000557115 SPATA5Q8NB90 893 aa26.76■■□□□ 1.87
CIPC-208ENST00000557115 C1orf115Q9H7X2 142 aa26.76■■□□□ 1.87
CIPC-208ENST00000557115 HMG20BQ9P0W2 317 aa26.76■■□□□ 1.87
CIPC-208ENST00000557115 IRF6O14896 467 aa26.75■■□□□ 1.87
CIPC-208ENST00000557115 BTDP43251 543 aa26.75■■□□□ 1.87
CIPC-208ENST00000557115 ATP8B2P98198 1209 aa26.75■■□□□ 1.87
CIPC-208ENST00000557115 PPIL2Q13356 520 aa26.75■■□□□ 1.87
CIPC-208ENST00000557115 ZFPM1Q8IX07 1006 aa26.75■■□□□ 1.87
CIPC-208ENST00000557115 CD99L2Q8TCZ2 262 aa26.75■■□□□ 1.87
CIPC-208ENST00000557115 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP26.75■■□□□ 1.87
CIPC-208ENST00000557115 ENTPD3O75355 529 aa26.74■■□□□ 1.87
CIPC-208ENST00000557115 SURF6O75683 361 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
CIPC-208ENST00000557115 MECOMQ03112 1051 aa26.74■■□□□ 1.87
CIPC-208ENST00000557115 PPATQ06203 517 aa26.74■■□□□ 1.87
CIPC-208ENST00000557115 POLA2Q14181 598 aa26.74■■□□□ 1.87
CIPC-208ENST00000557115 PI16Q6UXB8 463 aa26.74■■□□□ 1.87
CIPC-208ENST00000557115 OTOP1Q7RTM1 612 aa26.74■■□□□ 1.87
CIPC-208ENST00000557115 FAM43AQ8N2R8 423 aa26.74■■□□□ 1.87
CIPC-208ENST00000557115 IDI2Q9BXS1 227 aa26.74■■□□□ 1.87
CIPC-208ENST00000557115 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa26.73■■□□□ 1.87
CIPC-208ENST00000557115 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa26.73■■□□□ 1.87
CIPC-208ENST00000557115 RLBP1P12271 317 aa26.73■■□□□ 1.87
CIPC-208ENST00000557115 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
CIPC-208ENST00000557115 GSTO1P78417 241 aa26.73■■□□□ 1.87
CIPC-208ENST00000557115 PICALMQ13492 652 aa26.73■■□□□ 1.87
CIPC-208ENST00000557115 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa26.73■■□□□ 1.87
CIPC-208ENST00000557115 SSH3Q8TE77 659 aa26.73■■□□□ 1.87
CIPC-208ENST00000557115 RAI14Q9P0K7 980 aa26.73■■□□□ 1.87
CIPC-208ENST00000557115 LDHCP07864 332 aa26.72■■□□□ 1.87
CIPC-208ENST00000557115 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
CIPC-208ENST00000557115 EFCC1Q9HA90 598 aa26.72■■□□□ 1.87
CIPC-208ENST00000557115 ZNF112Q9UJU3 913 aa26.72■■□□□ 1.87
CIPC-208ENST00000557115 LAMB1P07942 1786 aa26.71■■□□□ 1.87
CIPC-208ENST00000557115 BTBD19C9JJ37 291 aa26.71■■□□□ 1.87
CIPC-208ENST00000557115 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP26.71■■□□□ 1.87
CIPC-208ENST00000557115 CCDC158Q5M9N0 1113 aa26.71■■□□□ 1.87
CIPC-208ENST00000557115 TTC39AQ5SRH9 613 aa26.71■■□□□ 1.87
CIPC-208ENST00000557115 LRP2BPQ9P2M1 347 aa26.71■■□□□ 1.87
CIPC-208ENST00000557115 ARHGEF6Q15052 776 aa26.7■■□□□ 1.86
CIPC-208ENST00000557115 TNNI3KQ59H18 835 aa26.7■■□□□ 1.86
CIPC-208ENST00000557115 GPR108Q9NPR9 543 aa26.7■■□□□ 1.86
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