RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555837.5

CDKN3-208, Transcript of cyclin dependent kinase inhibitor 3, human

TSL 2

Gene CDKN3, Length 689 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CDKN3-208	ENST00000555837	MROH7-TTC4	A0A0A0MT08	1334 aa		27.88	■■■□□ 2.05
CDKN3-208	ENST00000555837	IREB2	P48200	963 aa	Known RBP	27.87	■■■□□ 2.05
CDKN3-208	ENST00000555837	ZNF157	P51786	506 aa	Predicted RBP	27.87	■■■□□ 2.05
CDKN3-208	ENST00000555837	MAP3K12	Q12852	859 aa		27.87	■■■□□ 2.05
CDKN3-208	ENST00000555837	NAA16	Q6N069	864 aa	Predicted RBP	27.87	■■■□□ 2.05
CDKN3-208	ENST00000555837	REM2	Q8IYK8	340 aa	Predicted RBP	27.87	■■■□□ 2.05
CDKN3-208	ENST00000555837	NSUN4	Q96CB9	384 aa	Known RBP	27.87	■■■□□ 2.05
CDKN3-208	ENST00000555837	GCC1	Q96CN9	775 aa		27.87	■■■□□ 2.05
CDKN3-208	ENST00000555837	TLR7	Q9NYK1	1049 aa	Known RBP	27.87	■■■□□ 2.05
CDKN3-208	ENST00000555837	BEGAIN	Q9BUH8	593 aa		27.86	■■■□□ 2.05
CDKN3-208	ENST00000555837	SNRK	Q9NRH2	765 aa		27.86	■■■□□ 2.05
CDKN3-208	ENST00000555837	SCAF8	Q9UPN6	1271 aa	Known RBP	27.86	■■■□□ 2.05
CDKN3-208	ENST00000555837	PCDHB15	Q9Y5E8	787 aa		27.86	■■■□□ 2.05
CDKN3-208	ENST00000555837	ZAP70	P43403	619 aa		27.85	■■■□□ 2.05
CDKN3-208	ENST00000555837	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	27.85	■■■□□ 2.05
CDKN3-208	ENST00000555837	PRAMEF18	Q5VWM3	479 aa		27.85	■■■□□ 2.05
CDKN3-208	ENST00000555837	DCAF15	Q66K64	600 aa		27.85	■■■□□ 2.05
CDKN3-208	ENST00000555837	CYP4F22	Q6NT55	531 aa		27.85	■■■□□ 2.05
CDKN3-208	ENST00000555837	CDC42EP5	Q6NZY7	148 aa		27.85	■■■□□ 2.05
CDKN3-208	ENST00000555837	PI16	Q6UXB8	463 aa		27.85	■■■□□ 2.05
CDKN3-208	ENST00000555837	DLK2	Q6UY11	383 aa		27.85	■■■□□ 2.05
CDKN3-208	ENST00000555837	TBC1D9	Q6ZT07	1266 aa		27.85	■■■□□ 2.05
CDKN3-208	ENST00000555837	RWDD1	Q9H446	243 aa	Predicted RBP	27.85	■■■□□ 2.05
CDKN3-208	ENST00000555837	RPAP1	Q9BWH6	1393 aa	Predicted RBP	27.85	■■■□□ 2.05
CDKN3-208	ENST00000555837	GPR75-ASB3	A0A0A6YYF3	556 aa		27.84	■■■□□ 2.05
CDKN3-208	ENST00000555837	CYP2E1	P05181	493 aa	Predicted RBP	27.84	■■■□□ 2.05
CDKN3-208	ENST00000555837	GRM1	Q13255	1194 aa		27.84	■■■□□ 2.05
CDKN3-208	ENST00000555837	MAP3K11	Q16584	847 aa		27.84	■■■□□ 2.05
CDKN3-208	ENST00000555837	FAM151A	Q8WW52	585 aa		27.84	■■■□□ 2.05
CDKN3-208	ENST00000555837	AIDA	Q96BJ3	306 aa		27.84	■■■□□ 2.05
CDKN3-208	ENST00000555837	ENTPD3	O75355	529 aa		27.83	■■■□□ 2.05
CDKN3-208	ENST00000555837	BTD	P43251	543 aa		27.83	■■■□□ 2.05
CDKN3-208	ENST00000555837	IDI2	Q9BXS1	227 aa		27.83	■■■□□ 2.05
CDKN3-208	ENST00000555837	BCL11A	Q9H165	835 aa		27.83	■■■□□ 2.05
CDKN3-208	ENST00000555837	ANGEL1	Q9UNK9	670 aa	Known RBP	27.83	■■■□□ 2.05
CDKN3-208	ENST00000555837	MYH2	Q9UKX2	1941 aa		27.82	■■■□□ 2.04
CDKN3-208	ENST00000555837	ATP5J	P18859	108 aa		27.82	■■■□□ 2.04
CDKN3-208	ENST00000555837	NPM3	O75607	178 aa	Known RBP	27.81	■■■□□ 2.04
CDKN3-208	ENST00000555837	IDH1	O75874	414 aa	Known RBP	27.81	■■■□□ 2.04
CDKN3-208	ENST00000555837	NBPF12	Q5TAG4	269 aa	Predicted RBP	27.81	■■■□□ 2.04
CDKN3-208	ENST00000555837	ANKRD13A	Q8IZ07	590 aa		27.8	■■■□□ 2.04
CDKN3-208	ENST00000555837	TMEM39B	Q9GZU3	492 aa		27.8	■■■□□ 2.04
CDKN3-208	ENST00000555837	ECHDC1	Q9NTX5	307 aa		27.8	■■■□□ 2.04
CDKN3-208	ENST00000555837	AKAP11	Q9UKA4	1901 aa		27.79	■■■□□ 2.04
CDKN3-208	ENST00000555837	AOX1	Q06278	1338 aa		27.79	■■■□□ 2.04
CDKN3-208	ENST00000555837	UBE2Q2L	H0YL09	131 aa		27.79	■■■□□ 2.04
CDKN3-208	ENST00000555837	CACNB3	P54284	484 aa		27.79	■■■□□ 2.04
CDKN3-208	ENST00000555837	DDX24	Q9GZR7	859 aa	Known RBP eCLIP	27.79	■■■□□ 2.04
CDKN3-208	ENST00000555837	CA12	O43570	354 aa		27.78	■■■□□ 2.04
CDKN3-208	ENST00000555837	PRKG1	Q13976	671 aa		27.78	■■■□□ 2.04
CDKN3-208	ENST00000555837	LDLRAD1	Q5T700	205 aa		27.78	■■■□□ 2.04
CDKN3-208	ENST00000555837	SLC10A4	Q96EP9	437 aa		27.78	■■■□□ 2.04
CDKN3-208	ENST00000555837	TEPSIN	Q96N21	525 aa		27.78	■■■□□ 2.04
CDKN3-208	ENST00000555837	ERC2	O15083	957 aa		27.77	■■■□□ 2.04
CDKN3-208	ENST00000555837	SLC10A3	P09131	477 aa		27.77	■■■□□ 2.04
CDKN3-208	ENST00000555837	PPP4C	P60510	307 aa		27.77	■■■□□ 2.04
CDKN3-208	ENST00000555837	ZSCAN25	Q6NSZ9	544 aa		27.77	■■■□□ 2.04
CDKN3-208	ENST00000555837	DNAJC2	Q99543	621 aa	Known RBP	27.77	■■■□□ 2.04
CDKN3-208	ENST00000555837	MAST2	Q6P0Q8	1798 aa		27.76	■■■□□ 2.03
CDKN3-208	ENST00000555837	LRRFIP1	Q32MZ4	808 aa	Known RBP	27.76	■■■□□ 2.03
CDKN3-208	ENST00000555837	ZSCAN29	Q8IWY8	852 aa	Predicted RBP	27.76	■■■□□ 2.03
CDKN3-208	ENST00000555837	PIH1D3	Q9NQM4	214 aa	Known RBP	27.76	■■■□□ 2.03
CDKN3-208	ENST00000555837	PAG1	Q9NWQ8	432 aa		27.76	■■■□□ 2.03
CDKN3-208	ENST00000555837	CSAD	Q9Y600	493 aa		27.76	■■■□□ 2.03
CDKN3-208	ENST00000555837	TTC41P	Q6P2S7	1318 aa		27.75	■■■□□ 2.03
CDKN3-208	ENST00000555837	CYP7A1	P22680	504 aa		27.75	■■■□□ 2.03
CDKN3-208	ENST00000555837	RGS3	P49796	1198 aa		27.75	■■■□□ 2.03
CDKN3-208	ENST00000555837	TCP10	Q12799	353 aa		27.75	■■■□□ 2.03
CDKN3-208	ENST00000555837	HAUS7	Q99871	368 aa		27.75	■■■□□ 2.03
CDKN3-208	ENST00000555837	SMARCA5	O60264	1052 aa	Predicted RBP	27.74	■■■□□ 2.03
CDKN3-208	ENST00000555837	TEX11	Q8IYF3	940 aa		27.74	■■■□□ 2.03
CDKN3-208	ENST00000555837	EXOC6	Q8TAG9	804 aa		27.74	■■■□□ 2.03
CDKN3-208	ENST00000555837	ZNF341	Q9BYN7	854 aa		27.74	■■■□□ 2.03
CDKN3-208	ENST00000555837	BOLA2	Q9H3K6	86 aa		27.74	■■■□□ 2.03
CDKN3-208	ENST00000555837	GOLIM4	O00461	696 aa		27.73	■■■□□ 2.03
CDKN3-208	ENST00000555837	USP2	O75604	605 aa	Predicted RBP	27.73	■■■□□ 2.03
CDKN3-208	ENST00000555837	HSPA1A	P0DMV8	641 aa	Known RBP	27.73	■■■□□ 2.03
CDKN3-208	ENST00000555837	HSPA1B	P0DMV9	641 aa	Known RBP	27.73	■■■□□ 2.03
CDKN3-208	ENST00000555837	MAP3K9	P80192	1104 aa		27.73	■■■□□ 2.03
CDKN3-208	ENST00000555837	RASAL3	Q86YV0	1011 aa		27.73	■■■□□ 2.03
CDKN3-208	ENST00000555837	MAGEB6	Q8N7X4	407 aa		27.73	■■■□□ 2.03
CDKN3-208	ENST00000555837	WBP1L	Q9NX94	342 aa		27.73	■■■□□ 2.03
CDKN3-208	ENST00000555837	ZBTB48	P10074	688 aa	Predicted RBP	27.72	■■■□□ 2.03
CDKN3-208	ENST00000555837	INHBE	P58166	350 aa		27.72	■■■□□ 2.03
CDKN3-208	ENST00000555837	RHBDL3	P58872	404 aa		27.72	■■■□□ 2.03
CDKN3-208	ENST00000555837	SREBF2	Q12772	1141 aa		27.72	■■■□□ 2.03
CDKN3-208	ENST00000555837	NFIA	Q12857	509 aa		27.72	■■■□□ 2.03
CDKN3-208	ENST00000555837	ANKRD45	Q5TZF3	282 aa		27.72	■■■□□ 2.03
CDKN3-208	ENST00000555837	MOB2	Q70IA6	237 aa		27.72	■■■□□ 2.03
CDKN3-208	ENST00000555837	CSRNP1	Q96S65	589 aa		27.72	■■■□□ 2.03
CDKN3-208	ENST00000555837	DHX36	Q9H2U1	1008 aa	Known RBP	27.72	■■■□□ 2.03
CDKN3-208	ENST00000555837	AATF	Q9NY61	560 aa	Known RBP eCLIP	27.72	■■■□□ 2.03
CDKN3-208	ENST00000555837	FAM198A	Q9UFP1	575 aa		27.72	■■■□□ 2.03
CDKN3-208	ENST00000555837	THSD7B	Q9C0I4	1608 aa		27.71	■■■□□ 2.03
CDKN3-208	ENST00000555837	FAM155A	B1AL88	458 aa	Predicted RBP	27.71	■■■□□ 2.03
CDKN3-208	ENST00000555837	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	27.71	■■■□□ 2.03
CDKN3-208	ENST00000555837	PICALM	Q13492	652 aa		27.71	■■■□□ 2.03
CDKN3-208	ENST00000555837	SLC9C2	Q5TAH2	1124 aa		27.71	■■■□□ 2.03
CDKN3-208	ENST00000555837	ZNF384	Q8TF68	577 aa		27.71	■■■□□ 2.03
CDKN3-208	ENST00000555837	AOC2	O75106	756 aa		27.7	■■■□□ 2.02

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