RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551473.5

CS-228, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 797 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-228ENST00000551473 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP15.07■□□□□ 0
CS-228ENST00000551473 ZDHHC15Q96MV8 337 aa15.07■□□□□ 0
CS-228ENST00000551473 KCNH4Q9UQ05 1017 aa15.07■□□□□ 0
CS-228ENST00000551473 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP15.06■□□□□ 0
CS-228ENST00000551473 SGPL1O95470 568 aa15.06■□□□□ 0
CS-228ENST00000551473 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP15.06■□□□□ 0
CS-228ENST00000551473 CACNB3P54284 484 aa15.06■□□□□ 0
CS-228ENST00000551473 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP15.06■□□□□ 0
CS-228ENST00000551473 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP15.06■□□□□ 0
CS-228ENST00000551473 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP15.06■□□□□ 0
CS-228ENST00000551473 ADGRA2Q96PE1 1338 aa15.06■□□□□ 0
CS-228ENST00000551473 CTGFP29279 349 aa15.05■□□□□ -0
CS-228ENST00000551473 PRKCZQ05513 592 aa15.05■□□□□ -0
CS-228ENST00000551473 HHIPL2Q6UWX4 724 aa15.05■□□□□ -0
CS-228ENST00000551473 FBXO33Q7Z6M2 555 aa15.05■□□□□ -0
CS-228ENST00000551473 CEP290O15078 2479 aa15.04■□□□□ -0
CS-228ENST00000551473 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa15.04■□□□□ -0
CS-228ENST00000551473 EPHA10Q5JZY3 1008 aa15.04■□□□□ -0
CS-228ENST00000551473 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP15.04■□□□□ -0
CS-228ENST00000551473 GPR153Q6NV75 609 aa15.04■□□□□ -0
CS-228ENST00000551473 WWC1Q8IX03 1113 aa15.04■□□□□ -0
CS-228ENST00000551473 CXCL11O14625 94 aa15.03■□□□□ -0
CS-228ENST00000551473 ALDH1L1O75891 902 aa15.03■□□□□ -0
CS-228ENST00000551473 BCRP11274 1271 aa15.03■□□□□ -0
CS-228ENST00000551473 INPP5BP32019 993 aa15.03■□□□□ -0
CS-228ENST00000551473 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
CS-228ENST00000551473 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
CS-228ENST00000551473 MIGA2Q7L4E1 593 aa15.03■□□□□ -0
CS-228ENST00000551473 PXYLP1Q8TE99 480 aa15.03■□□□□ -0
CS-228ENST00000551473 FAM151AQ8WW52 585 aa15.03■□□□□ -0
CS-228ENST00000551473 UNC93B1Q9H1C4 597 aa15.03■□□□□ -0
CS-228ENST00000551473 ZNF112Q9UJU3 913 aa15.03■□□□□ -0
CS-228ENST00000551473 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP15.03■□□□□ -0
CS-228ENST00000551473 SZT2Q5T011 3432 aa15.02■□□□□ -0
CS-228ENST00000551473 F6X3S4 739 aa15.02■□□□□ -0
CS-228ENST00000551473 ADCY3O60266 1144 aa15.02■□□□□ -0
CS-228ENST00000551473 TFRCP02786 760 aaKnown RBP15.02■□□□□ -0
CS-228ENST00000551473 GRIK5Q16478 980 aa15.02■□□□□ -0
CS-228ENST00000551473 METTL24Q5JXM2 366 aa15.02■□□□□ -0
CS-228ENST00000551473 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP15.02■□□□□ -0
CS-228ENST00000551473 CACNA1FO60840 1977 aa15.02□□□□□ -0.01
CS-228ENST00000551473 KIF16BQ96L93 1317 aa15.01□□□□□ -0.01
CS-228ENST00000551473 VAMP4O75379 141 aa15.01□□□□□ -0.01
CS-228ENST00000551473 IRF5Q13568 498 aa15.01□□□□□ -0.01
CS-228ENST00000551473 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
CS-228ENST00000551473 FANCIQ9NVI1 1328 aa15□□□□□ -0.01
CS-228ENST00000551473 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
CS-228ENST00000551473 INHAP05111 366 aa15□□□□□ -0.01
CS-228ENST00000551473 BMP8BP34820 402 aa15□□□□□ -0.01
CS-228ENST00000551473 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
CS-228ENST00000551473 MOGSQ13724 837 aa15□□□□□ -0.01
CS-228ENST00000551473 WDR66Q8TBY9 1149 aa15□□□□□ -0.01
CS-228ENST00000551473 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa15□□□□□ -0.01
CS-228ENST00000551473 STAP2Q9UGK3 403 aa15□□□□□ -0.01
CS-228ENST00000551473 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa15□□□□□ -0.01
CS-228ENST00000551473 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
CS-228ENST00000551473 PDE8BO95263 885 aa14.99□□□□□ -0.01
CS-228ENST00000551473 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
CS-228ENST00000551473 CYP2C8P10632 490 aa14.99□□□□□ -0.01
CS-228ENST00000551473 FLT3LGP49771 235 aa14.99□□□□□ -0.01
CS-228ENST00000551473 BCAMP50895 628 aa14.99□□□□□ -0.01
CS-228ENST00000551473 NECAB2Q7Z6G3 386 aa14.99□□□□□ -0.01
CS-228ENST00000551473 ANKLE1Q8NAG6 615 aa14.99□□□□□ -0.01
CS-228ENST00000551473 LRCH3Q96II8 777 aa14.99□□□□□ -0.01
CS-228ENST00000551473 DEFB118Q96PH6 123 aa14.99□□□□□ -0.01
CS-228ENST00000551473 PICK1Q9NRD5 415 aa14.99□□□□□ -0.01
CS-228ENST00000551473 GABRQQ9UN88 632 aa14.99□□□□□ -0.01
CS-228ENST00000551473 GPAT2Q6NUI2 795 aa14.98□□□□□ -0.01
CS-228ENST00000551473 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
CS-228ENST00000551473 COA7Q96BR5 231 aa14.98□□□□□ -0.01
CS-228ENST00000551473 SUCLG2Q96I99 432 aa14.98□□□□□ -0.01
CS-228ENST00000551473 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
CS-228ENST00000551473 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
CS-228ENST00000551473 TCP10Q12799 353 aa14.97□□□□□ -0.01
CS-228ENST00000551473 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
CS-228ENST00000551473 SLC4A10Q6U841 1118 aa14.97□□□□□ -0.01
CS-228ENST00000551473 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
CS-228ENST00000551473 SCYL3Q8IZE3 742 aa14.97□□□□□ -0.01
CS-228ENST00000551473 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa14.97□□□□□ -0.01
CS-228ENST00000551473 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa14.97□□□□□ -0.01
CS-228ENST00000551473 ELNP15502 786 aa14.96□□□□□ -0.01
CS-228ENST00000551473 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
CS-228ENST00000551473 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
CS-228ENST00000551473 GADL1Q6ZQY3 521 aa14.96□□□□□ -0.01
CS-228ENST00000551473 WDR63Q8IWG1 891 aa14.96□□□□□ -0.01
CS-228ENST00000551473 VGLL2Q8N8G2 317 aa14.96□□□□□ -0.01
CS-228ENST00000551473 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
CS-228ENST00000551473 GDF15Q99988 308 aa14.96□□□□□ -0.01
CS-228ENST00000551473 PNMA3Q9UL41 463 aa14.96□□□□□ -0.01
CS-228ENST00000551473 ZHX2Q9Y6X8 837 aa14.96□□□□□ -0.01
CS-228ENST00000551473 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
CS-228ENST00000551473 LRIT3Q3SXY7 679 aa14.95□□□□□ -0.02
CS-228ENST00000551473 LRRC24Q50LG9 513 aa14.95□□□□□ -0.02
CS-228ENST00000551473 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa14.95□□□□□ -0.02
CS-228ENST00000551473 DEFB123Q8N688 67 aa14.95□□□□□ -0.02
CS-228ENST00000551473 TAOK2Q9UL54 1235 aa14.95□□□□□ -0.02
CS-228ENST00000551473 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa14.95□□□□□ -0.02
CS-228ENST00000551473 UTYO14607 1347 aa14.94□□□□□ -0.02
CS-228ENST00000551473 SLC5A1P13866 664 aa14.94□□□□□ -0.02
CS-228ENST00000551473 PTPRAP18433 802 aa14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.9 ms