RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550376.5

PRDM4-205, Transcript of PR/SET domain 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRDM4, Length 2,591 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM4-205ENST00000550376 EVCP57679 992 aa24.61■■□□□ 1.53
PRDM4-205ENST00000550376 UBE2HP62256 183 aa24.61■■□□□ 1.53
PRDM4-205ENST00000550376 MECOMQ03112 1051 aa24.61■■□□□ 1.53
PRDM4-205ENST00000550376 COL24A1Q17RW2 1714 aa24.6■■□□□ 1.53
PRDM4-205ENST00000550376 ADRA2BP18089 450 aa24.6■■□□□ 1.53
PRDM4-205ENST00000550376 KRT85P78386 507 aa24.6■■□□□ 1.53
PRDM4-205ENST00000550376 RESTQ13127 1097 aa24.6■■□□□ 1.53
PRDM4-205ENST00000550376 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa24.6■■□□□ 1.53
PRDM4-205ENST00000550376 SLC27A3Q5K4L6 730 aa24.6■■□□□ 1.53
PRDM4-205ENST00000550376 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
PRDM4-205ENST00000550376 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
PRDM4-205ENST00000550376 MICU3Q86XE3 530 aa24.6■■□□□ 1.53
PRDM4-205ENST00000550376 FBXL16Q8N461 479 aa24.6■■□□□ 1.53
PRDM4-205ENST00000550376 RNF214Q8ND24 703 aa24.6■■□□□ 1.53
PRDM4-205ENST00000550376 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
PRDM4-205ENST00000550376 NACAP1Q9BZK3 213 aa24.6■■□□□ 1.53
PRDM4-205ENST00000550376 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa24.59■■□□□ 1.53
PRDM4-205ENST00000550376 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
PRDM4-205ENST00000550376 ZNF827Q17R98 1081 aa24.59■■□□□ 1.53
PRDM4-205ENST00000550376 AKNAD1Q5T1N1 836 aa24.59■■□□□ 1.53
PRDM4-205ENST00000550376 MFSD6Q6ZSS7 791 aa24.59■■□□□ 1.53
PRDM4-205ENST00000550376 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa24.59■■□□□ 1.53
PRDM4-205ENST00000550376 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP24.59■■□□□ 1.53
PRDM4-205ENST00000550376 SALL1Q9NSC2 1324 aa24.59■■□□□ 1.53
PRDM4-205ENST00000550376 NFXL1Q6ZNB6 911 aa24.59■■□□□ 1.53
PRDM4-205ENST00000550376 DOCK2Q92608 1830 aa24.59■■□□□ 1.53
PRDM4-205ENST00000550376 TMEM67Q5HYA8 995 aa24.58■■□□□ 1.53
PRDM4-205ENST00000550376 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
PRDM4-205ENST00000550376 CPLX1O14810 134 aa24.58■■□□□ 1.53
PRDM4-205ENST00000550376 APBA3O96018 575 aa24.58■■□□□ 1.53
PRDM4-205ENST00000550376 AIFM3Q96NN9 605 aa24.58■■□□□ 1.53
PRDM4-205ENST00000550376 UBE2Q2LH0YL09 131 aa24.57■■□□□ 1.52
PRDM4-205ENST00000550376 CDC27P30260 824 aa24.57■■□□□ 1.52
PRDM4-205ENST00000550376 GPSM2P81274 684 aa24.57■■□□□ 1.52
PRDM4-205ENST00000550376 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
PRDM4-205ENST00000550376 GRIK5Q16478 980 aa24.57■■□□□ 1.52
PRDM4-205ENST00000550376 A0A1B0GUL6 1792 aa24.57■■□□□ 1.52
PRDM4-205ENST00000550376 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
PRDM4-205ENST00000550376 PRDM1O75626 825 aa24.57■■□□□ 1.52
PRDM4-205ENST00000550376 GNAT2P19087 354 aa24.57■■□□□ 1.52
PRDM4-205ENST00000550376 NASPP49321 788 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
PRDM4-205ENST00000550376 LRSAM1Q6UWE0 723 aa24.57■■□□□ 1.52
PRDM4-205ENST00000550376 SPATA32Q96LK8 384 aa24.57■■□□□ 1.52
PRDM4-205ENST00000550376 PPARAQ07869 468 aa24.56■■□□□ 1.52
PRDM4-205ENST00000550376 PHKBQ93100 1093 aa24.56■■□□□ 1.52
PRDM4-205ENST00000550376 LY9Q9HBG7 655 aa24.56■■□□□ 1.52
PRDM4-205ENST00000550376 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
PRDM4-205ENST00000550376 ST5P78524 1137 aa24.55■■□□□ 1.52
PRDM4-205ENST00000550376 APOA5Q6Q788 366 aa24.55■■□□□ 1.52
PRDM4-205ENST00000550376 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
PRDM4-205ENST00000550376 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
PRDM4-205ENST00000550376 IRS2Q9Y4H2 1338 aa24.55■■□□□ 1.52
PRDM4-205ENST00000550376 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
PRDM4-205ENST00000550376 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP24.54■■□□□ 1.52
PRDM4-205ENST00000550376 UBR3Q6ZT12 1888 aa24.54■■□□□ 1.52
PRDM4-205ENST00000550376 LIG1P18858 919 aa24.54■■□□□ 1.52
PRDM4-205ENST00000550376 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
PRDM4-205ENST00000550376 CCDC82Q8N4S0 544 aa24.54■■□□□ 1.52
PRDM4-205ENST00000550376 GIMAP6Q6P9H5 292 aa24.53■■□□□ 1.52
PRDM4-205ENST00000550376 OLFM4Q6UX06 510 aa24.53■■□□□ 1.52
PRDM4-205ENST00000550376 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
PRDM4-205ENST00000550376 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
PRDM4-205ENST00000550376 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
PRDM4-205ENST00000550376 UFL1O94874 794 aa24.52■■□□□ 1.52
PRDM4-205ENST00000550376 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
PRDM4-205ENST00000550376 CACNA1SQ13698 1873 aa24.52■■□□□ 1.52
PRDM4-205ENST00000550376 DIXDC1Q155Q3 683 aa24.52■■□□□ 1.52
PRDM4-205ENST00000550376 CAMK4Q16566 473 aa24.52■■□□□ 1.52
PRDM4-205ENST00000550376 MSL1Q68DK7 614 aa24.52■■□□□ 1.52
PRDM4-205ENST00000550376 STAG1Q8WVM7 1258 aa24.52■■□□□ 1.52
PRDM4-205ENST00000550376 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
PRDM4-205ENST00000550376 PGBD1Q96JS3 809 aa24.52■■□□□ 1.52
PRDM4-205ENST00000550376 USP17L12C9JPN9 530 aa24.51■■□□□ 1.51
PRDM4-205ENST00000550376 USP17L21D6R901 530 aa24.51■■□□□ 1.51
PRDM4-205ENST00000550376 ZBTB43O43298 467 aa24.51■■□□□ 1.51
PRDM4-205ENST00000550376 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
PRDM4-205ENST00000550376 CRY2Q49AN0 593 aa24.51■■□□□ 1.51
PRDM4-205ENST00000550376 ZMYM6O95789 1325 aa24.51■■□□□ 1.51
PRDM4-205ENST00000550376 XDHP47989 1333 aa24.51■■□□□ 1.51
PRDM4-205ENST00000550376 WDR19Q8NEZ3 1342 aa24.51■■□□□ 1.51
PRDM4-205ENST00000550376 SEMA3EO15041 775 aa24.51■■□□□ 1.51
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PRDM4-205ENST00000550376 C8orf76Q96K31 380 aa24.51■■□□□ 1.51
PRDM4-205ENST00000550376 TMEM87BQ96K49 555 aa24.51■■□□□ 1.51
PRDM4-205ENST00000550376 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
PRDM4-205ENST00000550376 KRT23Q9C075 422 aa24.5■■□□□ 1.51
PRDM4-205ENST00000550376 SLC12A7Q9Y666 1083 aa24.5■■□□□ 1.51
PRDM4-205ENST00000550376 CCDC183Q5T5S1 534 aa24.5■■□□□ 1.51
PRDM4-205ENST00000550376 CTR9Q6PD62 1173 aa24.5■■□□□ 1.51
PRDM4-205ENST00000550376 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
PRDM4-205ENST00000550376 USP28Q96RU2 1077 aa24.5■■□□□ 1.51
PRDM4-205ENST00000550376 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
PRDM4-205ENST00000550376 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
PRDM4-205ENST00000550376 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa24.49■■□□□ 1.51
PRDM4-205ENST00000550376 CNNM2Q9H8M5 875 aa24.49■■□□□ 1.51
PRDM4-205ENST00000550376 CCDC69A6NI79 296 aa24.49■■□□□ 1.51
PRDM4-205ENST00000550376 GOLGA8AA7E2F4 631 aa24.49■■□□□ 1.51
PRDM4-205ENST00000550376 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
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