RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548588.2

HECTD4-207, Transcript of HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 3

Gene HECTD4, Length 1,030 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4-207ENST00000548588 DIXDC1Q155Q3 683 aa14.76□□□□□ -0.05
HECTD4-207ENST00000548588 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
HECTD4-207ENST00000548588 FKBP1CQ5VVH2 108 aa14.76□□□□□ -0.05
HECTD4-207ENST00000548588 CCDC102BQ68D86 513 aa14.76□□□□□ -0.05
HECTD4-207ENST00000548588 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa14.76□□□□□ -0.05
HECTD4-207ENST00000548588 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP14.76□□□□□ -0.05
HECTD4-207ENST00000548588 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa14.76□□□□□ -0.05
HECTD4-207ENST00000548588 SALL1Q9NSC2 1324 aa14.75□□□□□ -0.05
HECTD4-207ENST00000548588 RGS19P49795 217 aa14.75□□□□□ -0.05
HECTD4-207ENST00000548588 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa14.75□□□□□ -0.05
HECTD4-207ENST00000548588 HOOK2Q96ED9 719 aa14.75□□□□□ -0.05
HECTD4-207ENST00000548588 AKAP2Q9Y2D5 859 aa14.75□□□□□ -0.05
HECTD4-207ENST00000548588 ARAP2Q8WZ64 1704 aa14.75□□□□□ -0.05
HECTD4-207ENST00000548588 A0A1B0GUL7 405 aa14.74□□□□□ -0.05
HECTD4-207ENST00000548588 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
HECTD4-207ENST00000548588 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa14.74□□□□□ -0.05
HECTD4-207ENST00000548588 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
HECTD4-207ENST00000548588 TMEM57Q8N5G2 664 aa14.74□□□□□ -0.05
HECTD4-207ENST00000548588 OTUD5Q96G74 571 aa14.74□□□□□ -0.05
HECTD4-207ENST00000548588 XAGE2Q96GT9 111 aa14.74□□□□□ -0.05
HECTD4-207ENST00000548588 WRNIP1Q96S55 665 aa14.74□□□□□ -0.05
HECTD4-207ENST00000548588 PTPN18Q99952 460 aa14.74□□□□□ -0.05
HECTD4-207ENST00000548588 HPS5Q9UPZ3 1129 aa14.74□□□□□ -0.05
HECTD4-207ENST00000548588 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa14.73□□□□□ -0.05
HECTD4-207ENST00000548588 SOX10P56693 466 aa14.73□□□□□ -0.05
HECTD4-207ENST00000548588 TCP10Q12799 353 aa14.73□□□□□ -0.05
HECTD4-207ENST00000548588 CRHR2Q13324 411 aa14.73□□□□□ -0.05
HECTD4-207ENST00000548588 RASGRF1Q13972 1273 aa14.73□□□□□ -0.05
HECTD4-207ENST00000548588 MVPQ14764 893 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
HECTD4-207ENST00000548588 DCAF15Q66K64 600 aa14.73□□□□□ -0.05
HECTD4-207ENST00000548588 FAM151AQ8WW52 585 aa14.73□□□□□ -0.05
HECTD4-207ENST00000548588 MS4A4AQ96JQ5 239 aa14.73□□□□□ -0.05
HECTD4-207ENST00000548588 NEUROD6Q96NK8 337 aa14.73□□□□□ -0.05
HECTD4-207ENST00000548588 USP40Q9NVE5 1235 aa14.73□□□□□ -0.05
HECTD4-207ENST00000548588 ABCF2Q9UG63 623 aa14.73□□□□□ -0.05
HECTD4-207ENST00000548588 ECM29Q5VYK3 1845 aa14.73□□□□□ -0.05
HECTD4-207ENST00000548588 AKAP11Q9UKA4 1901 aa14.72□□□□□ -0.05
HECTD4-207ENST00000548588 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa14.72□□□□□ -0.05
HECTD4-207ENST00000548588 SPDYE5A6NIY4 337 aa14.72□□□□□ -0.05
HECTD4-207ENST00000548588 GTF2A2P52657 109 aa14.72□□□□□ -0.05
HECTD4-207ENST00000548588 NFIAQ12857 509 aa14.72□□□□□ -0.05
HECTD4-207ENST00000548588 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP14.72□□□□□ -0.05
HECTD4-207ENST00000548588 CCL15Q16663 113 aa14.72□□□□□ -0.05
HECTD4-207ENST00000548588 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
HECTD4-207ENST00000548588 MIGA2Q7L4E1 593 aa14.72□□□□□ -0.05
HECTD4-207ENST00000548588 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
HECTD4-207ENST00000548588 BRI3BPQ8WY22 251 aa14.72□□□□□ -0.05
HECTD4-207ENST00000548588 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
HECTD4-207ENST00000548588 ZNF341Q9BYN7 854 aa14.72□□□□□ -0.05
HECTD4-207ENST00000548588 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa14.72□□□□□ -0.05
HECTD4-207ENST00000548588 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
HECTD4-207ENST00000548588 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
HECTD4-207ENST00000548588 GORABQ5T7V8 394 aa14.71□□□□□ -0.05
HECTD4-207ENST00000548588 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
HECTD4-207ENST00000548588 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
HECTD4-207ENST00000548588 ERO1BQ86YB8 467 aa14.7□□□□□ -0.06
HECTD4-207ENST00000548588 SLF2Q8IX21 1173 aa14.7□□□□□ -0.06
HECTD4-207ENST00000548588 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
HECTD4-207ENST00000548588 FAM198AQ9UFP1 575 aa14.7□□□□□ -0.06
HECTD4-207ENST00000548588 TRIM17Q9Y577 477 aa14.7□□□□□ -0.06
HECTD4-207ENST00000548588 GAKO14976 1311 aa14.69□□□□□ -0.06
HECTD4-207ENST00000548588 INPP5BP32019 993 aa14.69□□□□□ -0.06
HECTD4-207ENST00000548588 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
HECTD4-207ENST00000548588 ERICH6Q7L0X2 663 aa14.69□□□□□ -0.06
HECTD4-207ENST00000548588 ITPRIPQ8IWB1 547 aa14.69□□□□□ -0.06
HECTD4-207ENST00000548588 ERO1AQ96HE7 468 aa14.69□□□□□ -0.06
HECTD4-207ENST00000548588 IRF6O14896 467 aa14.68□□□□□ -0.06
HECTD4-207ENST00000548588 CETPP11597 493 aa14.68□□□□□ -0.06
HECTD4-207ENST00000548588 BTDP43251 543 aa14.68□□□□□ -0.06
HECTD4-207ENST00000548588 RGS3P49796 1198 aa14.68□□□□□ -0.06
HECTD4-207ENST00000548588 SP3Q02447 781 aa14.68□□□□□ -0.06
HECTD4-207ENST00000548588 PPIL2Q13356 520 aa14.68□□□□□ -0.06
HECTD4-207ENST00000548588 SNAPC2Q13487 334 aa14.68□□□□□ -0.06
HECTD4-207ENST00000548588 OTOP1Q7RTM1 612 aa14.68□□□□□ -0.06
HECTD4-207ENST00000548588 ZFPM1Q8IX07 1006 aa14.68□□□□□ -0.06
HECTD4-207ENST00000548588 FAM43AQ8N2R8 423 aa14.68□□□□□ -0.06
HECTD4-207ENST00000548588 SPATA5Q8NB90 893 aa14.68□□□□□ -0.06
HECTD4-207ENST00000548588 CD99L2Q8TCZ2 262 aa14.68□□□□□ -0.06
HECTD4-207ENST00000548588 C1orf115Q9H7X2 142 aa14.68□□□□□ -0.06
HECTD4-207ENST00000548588 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa14.68□□□□□ -0.06
HECTD4-207ENST00000548588 HMG20BQ9P0W2 317 aa14.68□□□□□ -0.06
HECTD4-207ENST00000548588 ENTPD3O75355 529 aa14.67□□□□□ -0.06
HECTD4-207ENST00000548588 MECOMQ03112 1051 aa14.67□□□□□ -0.06
HECTD4-207ENST00000548588 PPATQ06203 517 aa14.67□□□□□ -0.06
HECTD4-207ENST00000548588 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
HECTD4-207ENST00000548588 POLA2Q14181 598 aa14.67□□□□□ -0.06
HECTD4-207ENST00000548588 PI16Q6UXB8 463 aa14.67□□□□□ -0.06
HECTD4-207ENST00000548588 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
HECTD4-207ENST00000548588 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
HECTD4-207ENST00000548588 IDI2Q9BXS1 227 aa14.67□□□□□ -0.06
HECTD4-207ENST00000548588 ZNF112Q9UJU3 913 aa14.67□□□□□ -0.06
HECTD4-207ENST00000548588 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa14.66□□□□□ -0.06
HECTD4-207ENST00000548588 ZBED9Q6R2W3 1325 aa14.66□□□□□ -0.06
HECTD4-207ENST00000548588 BTBD19C9JJ37 291 aa14.66□□□□□ -0.06
HECTD4-207ENST00000548588 SURF6O75683 361 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
HECTD4-207ENST00000548588 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
HECTD4-207ENST00000548588 RLBP1P12271 317 aa14.66□□□□□ -0.06
HECTD4-207ENST00000548588 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
HECTD4-207ENST00000548588 ATP8B2P98198 1209 aa14.66□□□□□ -0.06
HECTD4-207ENST00000548588 PICALMQ13492 652 aa14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.7 ms