RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548588.2

HECTD4-207, Transcript of HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 3

Gene HECTD4, Length 1,030 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4-207ENST00000548588 NISCHQ9Y2I1 1504 aa29.46■■■□□ 2.31
HECTD4-207ENST00000548588 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa26.28■■□□□ 1.8
HECTD4-207ENST00000548588 ABCC9O60706 1549 aa26.24■■□□□ 1.79
HECTD4-207ENST00000548588 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP25.62■■□□□ 1.69
HECTD4-207ENST00000548588 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa25■■□□□ 1.59
HECTD4-207ENST00000548588 DCAF8L2P0C7V8 631 aa24.92■■□□□ 1.58
HECTD4-207ENST00000548588 NACADO15069 1562 aa24.87■■□□□ 1.57
HECTD4-207ENST00000548588 MYO15BQ96JP2 1530 aa24.58■■□□□ 1.53
HECTD4-207ENST00000548588 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP24.51■■□□□ 1.51
HECTD4-207ENST00000548588 DNAJC5BQ9UF47 199 aa24.5■■□□□ 1.51
HECTD4-207ENST00000548588 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.51
HECTD4-207ENST00000548588 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa24.32■■□□□ 1.48
HECTD4-207ENST00000548588 UNC13AQ9UPW8 1703 aa24.29■■□□□ 1.48
HECTD4-207ENST00000548588 BICRAQ9NZM4 1560 aa24.24■■□□□ 1.47
HECTD4-207ENST00000548588 CHIC1Q5VXU3 224 aa24.15■■□□□ 1.46
HECTD4-207ENST00000548588 SCRIBQ14160 1630 aa24.02■■□□□ 1.44
HECTD4-207ENST00000548588 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa23.96■■□□□ 1.43
HECTD4-207ENST00000548588 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
HECTD4-207ENST00000548588 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa23.66■■□□□ 1.38
HECTD4-207ENST00000548588 CECR2Q9BXF3 1484 aa23.62■■□□□ 1.37
HECTD4-207ENST00000548588 NCAPD3P42695 1498 aa22.99■■□□□ 1.27
HECTD4-207ENST00000548588 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa22.95■■□□□ 1.26
HECTD4-207ENST00000548588 SMARCA4P51532 1647 aa22.91■■□□□ 1.26
HECTD4-207ENST00000548588 SMARCA2P51531 1590 aa22.87■■□□□ 1.25
HECTD4-207ENST00000548588 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
HECTD4-207ENST00000548588 HMGXB3Q12766 1538 aa22.79■■□□□ 1.24
HECTD4-207ENST00000548588 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
HECTD4-207ENST00000548588 MROH2BQ7Z745 1585 aa22.72■■□□□ 1.23
HECTD4-207ENST00000548588 PEG3Q9GZU2 1588 aa22.68■■□□□ 1.22
HECTD4-207ENST00000548588 ERCC6Q03468 1493 aa22.66■■□□□ 1.22
HECTD4-207ENST00000548588 NESP48681 1621 aa22.57■■□□□ 1.2
HECTD4-207ENST00000548588 CUX2O14529 1486 aa22.53■■□□□ 1.2
HECTD4-207ENST00000548588 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.41■■□□□ 1.18
HECTD4-207ENST00000548588 WIZO95785 1651 aa22.39■■□□□ 1.18
HECTD4-207ENST00000548588 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa22.38■■□□□ 1.17
HECTD4-207ENST00000548588 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
HECTD4-207ENST00000548588 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.33■■□□□ 1.17
HECTD4-207ENST00000548588 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.33■■□□□ 1.17
HECTD4-207ENST00000548588 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
HECTD4-207ENST00000548588 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.19■■□□□ 1.14
HECTD4-207ENST00000548588 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
HECTD4-207ENST00000548588 MRC2Q9UBG0 1479 aa22.11■■□□□ 1.13
HECTD4-207ENST00000548588 CFTRP13569 1480 aa22.09■■□□□ 1.13
HECTD4-207ENST00000548588 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.06■■□□□ 1.12
HECTD4-207ENST00000548588 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.06■■□□□ 1.12
HECTD4-207ENST00000548588 WDR62O43379 1518 aa22.02■■□□□ 1.12
HECTD4-207ENST00000548588 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
HECTD4-207ENST00000548588 CCDC88BA6NC98 1476 aa21.94■■□□□ 1.1
HECTD4-207ENST00000548588 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
HECTD4-207ENST00000548588 PRDM2Q13029 1718 aa21.69■■□□□ 1.06
HECTD4-207ENST00000548588 TOPBP1Q92547 1522 aa21.64■■□□□ 1.05
HECTD4-207ENST00000548588 IFT140Q96RY7 1462 aa21.63■■□□□ 1.05
HECTD4-207ENST00000548588 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
HECTD4-207ENST00000548588 ABCC8Q09428 1581 aa21.61■■□□□ 1.05
HECTD4-207ENST00000548588 OSCARQ8IYS5 282 aa21.59■■□□□ 1.05
HECTD4-207ENST00000548588 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
HECTD4-207ENST00000548588 DNMBPQ6XZF7 1577 aa21.55■■□□□ 1.04
HECTD4-207ENST00000548588 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
HECTD4-207ENST00000548588 TRIM41Q8WV44 630 aa21.51■■□□□ 1.03
HECTD4-207ENST00000548588 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
HECTD4-207ENST00000548588 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP21.41■■□□□ 1.02
HECTD4-207ENST00000548588 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
HECTD4-207ENST00000548588 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
HECTD4-207ENST00000548588 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.38■■□□□ 1.01
HECTD4-207ENST00000548588 SOGA1O94964 1423 aa21.38■■□□□ 1.01
HECTD4-207ENST00000548588 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21.33■■□□□ 1.01
HECTD4-207ENST00000548588 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1
HECTD4-207ENST00000548588 CUX1P39880 1505 aa21.32■■□□□ 1
HECTD4-207ENST00000548588 FBLN2P98095 1184 aa21.3■■□□□ 1
HECTD4-207ENST00000548588 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa21.19■□□□□ 0.98
HECTD4-207ENST00000548588 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa21.19■□□□□ 0.98
HECTD4-207ENST00000548588 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa21.19■□□□□ 0.98
HECTD4-207ENST00000548588 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.19■□□□□ 0.98
HECTD4-207ENST00000548588 ARHGEF11O15085 1522 aa21.18■□□□□ 0.98
HECTD4-207ENST00000548588 WDR97A6NE52 1622 aa21.18■□□□□ 0.98
HECTD4-207ENST00000548588 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.16■□□□□ 0.98
HECTD4-207ENST00000548588 CHD1O14646 1710 aa21.15■□□□□ 0.98
HECTD4-207ENST00000548588 GRIN2BQ13224 1484 aa21.15■□□□□ 0.98
HECTD4-207ENST00000548588 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP21.13■□□□□ 0.97
HECTD4-207ENST00000548588 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.1■□□□□ 0.97
HECTD4-207ENST00000548588 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.09■□□□□ 0.97
HECTD4-207ENST00000548588 CYB5RLQ6IPT4 315 aa21.09■□□□□ 0.97
HECTD4-207ENST00000548588 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP21.07■□□□□ 0.96
HECTD4-207ENST00000548588 SYNJ2O15056 1496 aa21.06■□□□□ 0.96
HECTD4-207ENST00000548588 SYNJ1O43426 1573 aa21.01■□□□□ 0.95
HECTD4-207ENST00000548588 ARAP1Q96P48 1450 aa21■□□□□ 0.95
HECTD4-207ENST00000548588 TOP2BQ02880 1626 aa21■□□□□ 0.95
HECTD4-207ENST00000548588 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21■□□□□ 0.95
HECTD4-207ENST00000548588 CLASP1Q7Z460 1538 aa20.99■□□□□ 0.95
HECTD4-207ENST00000548588 PBRM1Q86U86 1689 aa20.96■□□□□ 0.95
HECTD4-207ENST00000548588 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa20.96■□□□□ 0.95
HECTD4-207ENST00000548588 GRIN2AQ12879 1464 aa20.87■□□□□ 0.93
HECTD4-207ENST00000548588 FHAD1B1AJZ9 1412 aa20.85■□□□□ 0.93
HECTD4-207ENST00000548588 ADAMTS12P58397 1594 aa20.85■□□□□ 0.93
HECTD4-207ENST00000548588 TRHP20396 242 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
HECTD4-207ENST00000548588 ERICH3Q5RHP9 1530 aa20.81■□□□□ 0.92
HECTD4-207ENST00000548588 NUP160Q12769 1436 aa20.79■□□□□ 0.92
HECTD4-207ENST00000548588 CEP170Q5SW79 1584 aa20.76■□□□□ 0.91
HECTD4-207ENST00000548588 ERCC6L2Q5T890 1561 aa20.68■□□□□ 0.9
HECTD4-207ENST00000548588 KIF27Q86VH2 1401 aa20.67■□□□□ 0.9
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