RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546447.1

CYCSP30-201, Transcript of cytochrome c, somatic pseudogene 30, humanhuman

BASIC

Gene CYCSP30, Length 172 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYCSP30-201ENST00000546447 NEUROD6Q96NK8 337 aa4.77□□□□□ -1.65
CYCSP30-201ENST00000546447 IDI2Q9BXS1 227 aa4.77□□□□□ -1.65
CYCSP30-201ENST00000546447 ZNF341Q9BYN7 854 aa4.77□□□□□ -1.65
CYCSP30-201ENST00000546447 TBC1D2Q9BYX2 928 aa4.77□□□□□ -1.65
CYCSP30-201ENST00000546447 MCOLN1Q9GZU1 580 aa4.77□□□□□ -1.65
CYCSP30-201ENST00000546447 TAOK2Q9UL54 1235 aa4.77□□□□□ -1.65
CYCSP30-201ENST00000546447 DDX19BQ9UMR2 479 aa4.77□□□□□ -1.65
CYCSP30-201ENST00000546447 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
CYCSP30-201ENST00000546447 JAG2Q9Y219 1238 aa4.77□□□□□ -1.65
CYCSP30-201ENST00000546447 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
CYCSP30-201ENST00000546447 GAKO14976 1311 aa4.76□□□□□ -1.65
CYCSP30-201ENST00000546447 CXCL11O14625 94 aa4.76□□□□□ -1.65
CYCSP30-201ENST00000546447 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
CYCSP30-201ENST00000546447 SURF6O75683 361 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
CYCSP30-201ENST00000546447 CAPN2P17655 700 aa4.76□□□□□ -1.65
CYCSP30-201ENST00000546447 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
CYCSP30-201ENST00000546447 PRDX5P30044 214 aa4.76□□□□□ -1.65
CYCSP30-201ENST00000546447 PHKA1P46020 1223 aa4.76□□□□□ -1.65
CYCSP30-201ENST00000546447 RGS19P49795 217 aa4.76□□□□□ -1.65
CYCSP30-201ENST00000546447 PRMT2P55345 433 aa4.76□□□□□ -1.65
CYCSP30-201ENST00000546447 TIMM10P62072 90 aa4.76□□□□□ -1.65
CYCSP30-201ENST00000546447 TFCP2Q12800 502 aa4.76□□□□□ -1.65
CYCSP30-201ENST00000546447 PPIL2Q13356 520 aa4.76□□□□□ -1.65
CYCSP30-201ENST00000546447 RASGRF1Q13972 1273 aa4.76□□□□□ -1.65
CYCSP30-201ENST00000546447 PRKG1Q13976 671 aa4.76□□□□□ -1.65
CYCSP30-201ENST00000546447 POLA2Q14181 598 aa4.76□□□□□ -1.65
CYCSP30-201ENST00000546447 PDE3AQ14432 1141 aa4.76□□□□□ -1.65
CYCSP30-201ENST00000546447 KIF22Q14807 665 aa4.76□□□□□ -1.65
CYCSP30-201ENST00000546447 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
CYCSP30-201ENST00000546447 MOB2Q70IA6 237 aa4.76□□□□□ -1.65
CYCSP30-201ENST00000546447 TMEM57Q8N5G2 664 aa4.76□□□□□ -1.65
CYCSP30-201ENST00000546447 SPATA5Q8NB90 893 aa4.76□□□□□ -1.65
CYCSP30-201ENST00000546447 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
CYCSP30-201ENST00000546447 WRNIP1Q96S55 665 aa4.76□□□□□ -1.65
CYCSP30-201ENST00000546447 ZIC5Q96T25 663 aa4.76□□□□□ -1.65
CYCSP30-201ENST00000546447 TMEM39BQ9GZU3 492 aa4.76□□□□□ -1.65
CYCSP30-201ENST00000546447 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
CYCSP30-201ENST00000546447 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa4.76□□□□□ -1.65
CYCSP30-201ENST00000546447 GINM1Q9NU53 330 aa4.76□□□□□ -1.65
CYCSP30-201ENST00000546447 USP40Q9NVE5 1235 aa4.76□□□□□ -1.65
CYCSP30-201ENST00000546447 LRP2BPQ9P2M1 347 aa4.76□□□□□ -1.65
CYCSP30-201ENST00000546447 ABCF2Q9UG63 623 aa4.76□□□□□ -1.65
CYCSP30-201ENST00000546447 ZNF112Q9UJU3 913 aa4.76□□□□□ -1.65
CYCSP30-201ENST00000546447 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
CYCSP30-201ENST00000546447 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa4.76□□□□□ -1.65
CYCSP30-201ENST00000546447 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa4.75□□□□□ -1.65
CYCSP30-201ENST00000546447 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa4.75□□□□□ -1.65
CYCSP30-201ENST00000546447 CCDC85CA6NKD9 419 aa4.75□□□□□ -1.65
CYCSP30-201ENST00000546447 TBC1D12O60347 775 aa4.75□□□□□ -1.65
CYCSP30-201ENST00000546447 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
CYCSP30-201ENST00000546447 RAB11FIP3O75154 756 aa4.75□□□□□ -1.65
CYCSP30-201ENST00000546447 CAPN15O75808 1086 aa4.75□□□□□ -1.65
CYCSP30-201ENST00000546447 SP3Q02447 781 aa4.75□□□□□ -1.65
CYCSP30-201ENST00000546447 MAP3K10Q02779 954 aa4.75□□□□□ -1.65
CYCSP30-201ENST00000546447 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
CYCSP30-201ENST00000546447 VGLL4Q14135 290 aa4.75□□□□□ -1.65
CYCSP30-201ENST00000546447 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
CYCSP30-201ENST00000546447 CCL15Q16663 113 aa4.75□□□□□ -1.65
CYCSP30-201ENST00000546447 TNNI3KQ59H18 835 aa4.75□□□□□ -1.65
CYCSP30-201ENST00000546447 TTC39AQ5SRH9 613 aa4.75□□□□□ -1.65
CYCSP30-201ENST00000546447 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
CYCSP30-201ENST00000546447 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa4.75□□□□□ -1.65
CYCSP30-201ENST00000546447 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
CYCSP30-201ENST00000546447 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
CYCSP30-201ENST00000546447 NBPF11Q86T75 865 aa4.75□□□□□ -1.65
CYCSP30-201ENST00000546447 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
CYCSP30-201ENST00000546447 OPTNQ96CV9 577 aa4.75□□□□□ -1.65
CYCSP30-201ENST00000546447 MS4A4AQ96JQ5 239 aa4.75□□□□□ -1.65
CYCSP30-201ENST00000546447 ELP3Q9H9T3 547 aa4.75□□□□□ -1.65
CYCSP30-201ENST00000546447 PICK1Q9NRD5 415 aa4.75□□□□□ -1.65
CYCSP30-201ENST00000546447 RAI14Q9P0K7 980 aa4.75□□□□□ -1.65
CYCSP30-201ENST00000546447 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
CYCSP30-201ENST00000546447 TSKSQ9UJT2 592 aa4.75□□□□□ -1.65
CYCSP30-201ENST00000546447 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa4.75□□□□□ -1.65
CYCSP30-201ENST00000546447 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa4.75□□□□□ -1.65
CYCSP30-201ENST00000546447 MYH3P11055 1940 aa4.75□□□□□ -1.65
CYCSP30-201ENST00000546447 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa4.74□□□□□ -1.65
CYCSP30-201ENST00000546447 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa4.74□□□□□ -1.65
CYCSP30-201ENST00000546447 TLR2O60603 784 aa4.74□□□□□ -1.65
CYCSP30-201ENST00000546447 TBC1D8O95759 1140 aa4.74□□□□□ -1.65
CYCSP30-201ENST00000546447 HOXD10P28358 340 aa4.74□□□□□ -1.65
CYCSP30-201ENST00000546447 BTDP43251 543 aa4.74□□□□□ -1.65
CYCSP30-201ENST00000546447 RGS3P49796 1198 aa4.74□□□□□ -1.65
CYCSP30-201ENST00000546447 PPP4CP60510 307 aa4.74□□□□□ -1.65
CYCSP30-201ENST00000546447 MECOMQ03112 1051 aa4.74□□□□□ -1.65
CYCSP30-201ENST00000546447 MAP3K12Q12852 859 aa4.74□□□□□ -1.65
CYCSP30-201ENST00000546447 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP4.74□□□□□ -1.65
CYCSP30-201ENST00000546447 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
CYCSP30-201ENST00000546447 DIXDC1Q155Q3 683 aa4.74□□□□□ -1.65
CYCSP30-201ENST00000546447 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
CYCSP30-201ENST00000546447 CEP85Q6P2H3 762 aa4.74□□□□□ -1.65
CYCSP30-201ENST00000546447 ANKRD23Q86SG2 305 aa4.74□□□□□ -1.65
CYCSP30-201ENST00000546447 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
CYCSP30-201ENST00000546447 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
CYCSP30-201ENST00000546447 SCYL3Q8IZE3 742 aa4.74□□□□□ -1.65
CYCSP30-201ENST00000546447 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
CYCSP30-201ENST00000546447 KIF1BPQ96EK5 621 aa4.74□□□□□ -1.65
CYCSP30-201ENST00000546447 OTUD5Q96G74 571 aa4.74□□□□□ -1.65
CYCSP30-201ENST00000546447 CLMNQ96JQ2 1002 aa4.74□□□□□ -1.65
CYCSP30-201ENST00000546447 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.7 ms