RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545193.5

GRSF1-208, Transcript of G-rich RNA sequence binding factor 1, human

TSL 2 BASIC

Gene GRSF1, Length 2,682 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GRSF1-208	ENST00000545193	GRAPL	Q8TC17	118 aa	Predicted RBP	18.4	■□□□□ 0.54
GRSF1-208	ENST00000545193	DDX11	Q96FC9	970 aa		18.4	■□□□□ 0.54
GRSF1-208	ENST00000545193	TTC12	Q9H892	705 aa	Predicted RBP	18.4	■□□□□ 0.54
GRSF1-208	ENST00000545193	NCOA5	Q9HCD5	579 aa	Known RBP	18.4	■□□□□ 0.54
GRSF1-208	ENST00000545193	TFCP2L1	Q9NZI6	479 aa		18.4	■□□□□ 0.54
GRSF1-208	ENST00000545193	WDR19	Q8NEZ3	1342 aa		18.4	■□□□□ 0.54
GRSF1-208	ENST00000545193	SEMA3E	O15041	775 aa		18.4	■□□□□ 0.54
GRSF1-208	ENST00000545193	CTDNEP1	O95476	244 aa		18.4	■□□□□ 0.54
GRSF1-208	ENST00000545193	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	18.4	■□□□□ 0.54
GRSF1-208	ENST00000545193	DNM1	Q05193	864 aa	Known RBP	18.4	■□□□□ 0.54
GRSF1-208	ENST00000545193	ADGRA1	Q86SQ6	560 aa		18.4	■□□□□ 0.54
GRSF1-208	ENST00000545193	SLC4A4	Q9Y6R1	1079 aa		18.4	■□□□□ 0.54
GRSF1-208	ENST00000545193	SERPINB2	P05120	415 aa		18.39	■□□□□ 0.54
GRSF1-208	ENST00000545193	CCDC183	Q5T5S1	534 aa		18.39	■□□□□ 0.54
GRSF1-208	ENST00000545193	ZNF772	Q68DY9	489 aa	Predicted RBP	18.39	■□□□□ 0.54
GRSF1-208	ENST00000545193	FERMT3	Q86UX7	667 aa		18.39	■□□□□ 0.54
GRSF1-208	ENST00000545193	ADCY5	O95622	1261 aa		18.39	■□□□□ 0.53
GRSF1-208	ENST00000545193	SASS6	Q6UVJ0	657 aa		18.39	■□□□□ 0.53
GRSF1-208	ENST00000545193	FAM184A	Q8NB25	1140 aa		18.38	■□□□□ 0.53
GRSF1-208	ENST00000545193	NKX2-3	Q8TAU0	364 aa		18.38	■□□□□ 0.53
GRSF1-208	ENST00000545193	NACAP1	Q9BZK3	213 aa		18.38	■□□□□ 0.53
GRSF1-208	ENST00000545193	PTPDC1	A2A3K4	754 aa		18.38	■□□□□ 0.53
GRSF1-208	ENST00000545193	GIMAP6	Q6P9H5	292 aa		18.38	■□□□□ 0.53
GRSF1-208	ENST00000545193	TXNRD3	Q86VQ6	643 aa		18.38	■□□□□ 0.53
GRSF1-208	ENST00000545193	ST5	P78524	1137 aa		18.37	■□□□□ 0.53
GRSF1-208	ENST00000545193	HMGN5	P82970	282 aa	Known RBP	18.37	■□□□□ 0.53
GRSF1-208	ENST00000545193	TSC1	Q92574	1164 aa		18.37	■□□□□ 0.53
GRSF1-208	ENST00000545193	CHMP4C	Q96CF2	233 aa		18.37	■□□□□ 0.53
GRSF1-208	ENST00000545193	ANKIB1	Q9P2G1	1089 aa		18.37	■□□□□ 0.53
GRSF1-208	ENST00000545193	KLF18	A0A0U1RQI7	1052 aa		18.37	■□□□□ 0.53
GRSF1-208	ENST00000545193		B4E1Z4	1266 aa		18.37	■□□□□ 0.53
GRSF1-208	ENST00000545193	TDO2	P48775	406 aa		18.37	■□□□□ 0.53
GRSF1-208	ENST00000545193	CYB5R4	Q7L1T6	521 aa		18.37	■□□□□ 0.53
GRSF1-208	ENST00000545193	SLC51A	Q86UW1	340 aa		18.37	■□□□□ 0.53
GRSF1-208	ENST00000545193	RPGR	Q92834	1020 aa	Known RBP	18.37	■□□□□ 0.53
GRSF1-208	ENST00000545193	NEDD4	P46934	1319 aa		18.37	■□□□□ 0.53
GRSF1-208	ENST00000545193	PDS5A	Q29RF7	1337 aa	Known RBP	18.37	■□□□□ 0.53
GRSF1-208	ENST00000545193	MAGEB6P1	A0A0J9YX57	407 aa		18.36	■□□□□ 0.53
GRSF1-208	ENST00000545193	CTDSPL2	Q05D32	466 aa		18.36	■□□□□ 0.53
GRSF1-208	ENST00000545193	CRY2	Q49AN0	593 aa		18.36	■□□□□ 0.53
GRSF1-208	ENST00000545193	IRS2	Q9Y4H2	1338 aa		18.36	■□□□□ 0.53
GRSF1-208	ENST00000545193	ZNF384	Q8TF68	577 aa		18.36	■□□□□ 0.53
GRSF1-208	ENST00000545193	INCENP	Q9NQS7	918 aa		18.36	■□□□□ 0.53
GRSF1-208	ENST00000545193	SALL1	Q9NSC2	1324 aa		18.36	■□□□□ 0.53
GRSF1-208	ENST00000545193	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	18.36	■□□□□ 0.53
GRSF1-208	ENST00000545193	UBE2H	P62256	183 aa		18.36	■□□□□ 0.53
GRSF1-208	ENST00000545193	NAA16	Q6N069	864 aa	Predicted RBP	18.36	■□□□□ 0.53
GRSF1-208	ENST00000545193	ANGEL1	Q9UNK9	670 aa	Known RBP	18.36	■□□□□ 0.53
GRSF1-208	ENST00000545193	HPS5	Q9UPZ3	1129 aa		18.36	■□□□□ 0.53
GRSF1-208	ENST00000545193	GOLGA8B	A8MQT2	603 aa		18.35	■□□□□ 0.53
GRSF1-208	ENST00000545193		H3BQV1	296 aa		18.35	■□□□□ 0.53
GRSF1-208	ENST00000545193	DYNC1I1	O14576	645 aa		18.35	■□□□□ 0.53
GRSF1-208	ENST00000545193	DDR1	Q08345	913 aa		18.35	■□□□□ 0.53
GRSF1-208	ENST00000545193	IFFO2	Q5TF58	517 aa		18.35	■□□□□ 0.53
GRSF1-208	ENST00000545193	FAM173B	Q6P4H8	233 aa		18.35	■□□□□ 0.53
GRSF1-208	ENST00000545193	RIOK1	Q9BRS2	568 aa	Known RBP	18.35	■□□□□ 0.53
GRSF1-208	ENST00000545193	LEMD3	Q9Y2U8	911 aa		18.35	■□□□□ 0.53
GRSF1-208	ENST00000545193	KIF3A	Q9Y496	699 aa		18.35	■□□□□ 0.53
GRSF1-208	ENST00000545193	AKNAD1	Q5T1N1	836 aa		18.35	■□□□□ 0.53
GRSF1-208	ENST00000545193	POLRMT	O00411	1230 aa	Known RBP	18.34	■□□□□ 0.53
GRSF1-208	ENST00000545193	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	18.34	■□□□□ 0.53
GRSF1-208	ENST00000545193	SDR42E1	Q8WUS8	393 aa		18.34	■□□□□ 0.53
GRSF1-208	ENST00000545193	TACC3	Q9Y6A5	838 aa		18.34	■□□□□ 0.53
GRSF1-208	ENST00000545193	CACNA1S	Q13698	1873 aa		18.34	■□□□□ 0.53
GRSF1-208	ENST00000545193	XDH	P47989	1333 aa		18.34	■□□□□ 0.53
GRSF1-208	ENST00000545193	SH2B2	O14492	632 aa	Predicted RBP	18.34	■□□□□ 0.53
GRSF1-208	ENST00000545193	PLSCR1	O15162	318 aa		18.34	■□□□□ 0.53
GRSF1-208	ENST00000545193	PPFIA3	O75145	1194 aa		18.34	■□□□□ 0.53
GRSF1-208	ENST00000545193	KRT85	P78386	507 aa		18.34	■□□□□ 0.53
GRSF1-208	ENST00000545193	NSUN4	Q96CB9	384 aa	Known RBP	18.34	■□□□□ 0.53
GRSF1-208	ENST00000545193	CNNM2	Q9H8M5	875 aa		18.34	■□□□□ 0.53
GRSF1-208	ENST00000545193	PRDM4	Q9UKN5	801 aa		18.34	■□□□□ 0.53
GRSF1-208	ENST00000545193	DHX16	O60231	1041 aa	Known RBP	18.33	■□□□□ 0.53
GRSF1-208	ENST00000545193	MECOM	Q03112	1051 aa		18.33	■□□□□ 0.53
GRSF1-208	ENST00000545193	UVSSA	Q2YD98	709 aa		18.33	■□□□□ 0.53
GRSF1-208	ENST00000545193	MFSD6	Q6ZSS7	791 aa		18.33	■□□□□ 0.53
GRSF1-208	ENST00000545193	TMEM87B	Q96K49	555 aa		18.33	■□□□□ 0.53
GRSF1-208	ENST00000545193	ZSWIM5	Q9P217	1185 aa		18.33	■□□□□ 0.53
GRSF1-208	ENST00000545193	APBA3	O96018	575 aa		18.33	■□□□□ 0.52
GRSF1-208	ENST00000545193	NOLC1	Q14978	699 aa	Known RBP eCLIP	18.33	■□□□□ 0.52
GRSF1-208	ENST00000545193	IGDCC4	Q8TDY8	1250 aa		18.33	■□□□□ 0.52
GRSF1-208	ENST00000545193	STAG1	Q8WVM7	1258 aa		18.33	■□□□□ 0.52
GRSF1-208	ENST00000545193	RBM17	Q96I25	401 aa	Known RBP	18.33	■□□□□ 0.52
GRSF1-208	ENST00000545193	KDM4A	O75164	1064 aa		18.32	■□□□□ 0.52
GRSF1-208	ENST00000545193	DYNLL1	P63167	89 aa	Known RBP	18.32	■□□□□ 0.52
GRSF1-208	ENST00000545193	ZNF827	Q17R98	1081 aa		18.32	■□□□□ 0.52
GRSF1-208	ENST00000545193	RAB11FIP4	Q86YS3	637 aa		18.32	■□□□□ 0.52
GRSF1-208	ENST00000545193	KRT23	Q9C075	422 aa		18.32	■□□□□ 0.52
GRSF1-208	ENST00000545193	ZBTB22	O15209	634 aa		18.32	■□□□□ 0.52
GRSF1-208	ENST00000545193	FDPS	P14324	419 aa	Known RBP	18.32	■□□□□ 0.52
GRSF1-208	ENST00000545193	PRDX5	P30044	214 aa		18.32	■□□□□ 0.52
GRSF1-208	ENST00000545193	REST	Q13127	1097 aa		18.32	■□□□□ 0.52
GRSF1-208	ENST00000545193	AP5Z1	O43299	807 aa		18.31	■□□□□ 0.52
GRSF1-208	ENST00000545193	PIBF1	Q8WXW3	757 aa		18.31	■□□□□ 0.52
GRSF1-208	ENST00000545193	ZSCAN16	Q9H4T2	348 aa	Predicted RBP	18.31	■□□□□ 0.52
GRSF1-208	ENST00000545193	JAG2	Q9Y219	1238 aa		18.31	■□□□□ 0.52
GRSF1-208	ENST00000545193	FOSB	P53539	338 aa		18.31	■□□□□ 0.52
GRSF1-208	ENST00000545193	PPARA	Q07869	468 aa		18.31	■□□□□ 0.52
GRSF1-208	ENST00000545193	SENP2	Q9HC62	589 aa		18.31	■□□□□ 0.52
GRSF1-208	ENST00000545193	TIAM2	Q8IVF5	1701 aa		18.31	■□□□□ 0.52

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