RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543190.5

LTBR-211, Transcript of lymphotoxin beta receptor, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene LTBR, Length 785 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBR-211ENST00000543190 GNAI3P08754 354 aa23.22■■□□□ 1.31
LTBR-211ENST00000543190 ZNF112Q9UJU3 913 aa23.22■■□□□ 1.31
LTBR-211ENST00000543190 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa23.22■■□□□ 1.31
LTBR-211ENST00000543190 SP3Q02447 781 aa23.21■■□□□ 1.31
LTBR-211ENST00000543190 MEIS3Q99687 375 aa23.21■■□□□ 1.31
LTBR-211ENST00000543190 DOCK2Q92608 1830 aa23.2■■□□□ 1.3
LTBR-211ENST00000543190 PRDX5P30044 214 aa23.2■■□□□ 1.3
LTBR-211ENST00000543190 CACNB3P54284 484 aa23.2■■□□□ 1.3
LTBR-211ENST00000543190 PPIL2Q13356 520 aa23.2■■□□□ 1.3
LTBR-211ENST00000543190 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
LTBR-211ENST00000543190 PTPN22Q9Y2R2 807 aa23.2■■□□□ 1.3
LTBR-211ENST00000543190 TRIM17Q9Y577 477 aa23.2■■□□□ 1.3
LTBR-211ENST00000543190 GAKO14976 1311 aa23.19■■□□□ 1.3
LTBR-211ENST00000543190 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa23.19■■□□□ 1.3
LTBR-211ENST00000543190 CETPP11597 493 aa23.19■■□□□ 1.3
LTBR-211ENST00000543190 PPATQ06203 517 aa23.19■■□□□ 1.3
LTBR-211ENST00000543190 CCL15Q16663 113 aa23.19■■□□□ 1.3
LTBR-211ENST00000543190 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa23.19■■□□□ 1.3
LTBR-211ENST00000543190 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa23.19■■□□□ 1.3
LTBR-211ENST00000543190 ARMC5Q96C12 935 aa23.19■■□□□ 1.3
LTBR-211ENST00000543190 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
LTBR-211ENST00000543190 WRNIP1Q96S55 665 aa23.19■■□□□ 1.3
LTBR-211ENST00000543190 SIL1Q9H173 461 aa23.19■■□□□ 1.3
LTBR-211ENST00000543190 RFX7Q2KHR2 1363 aa23.18■■□□□ 1.3
LTBR-211ENST00000543190 LDHBP07195 334 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
LTBR-211ENST00000543190 ARHGEF6Q15052 776 aa23.18■■□□□ 1.3
LTBR-211ENST00000543190 IDI2Q9BXS1 227 aa23.18■■□□□ 1.3
LTBR-211ENST00000543190 ZNF341Q9BYN7 854 aa23.18■■□□□ 1.3
LTBR-211ENST00000543190 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa23.18■■□□□ 1.3
LTBR-211ENST00000543190 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
LTBR-211ENST00000543190 PHKA1P46020 1223 aa23.17■■□□□ 1.3
LTBR-211ENST00000543190 MAP3K10Q02779 954 aa23.17■■□□□ 1.3
LTBR-211ENST00000543190 SNAPC2Q13487 334 aa23.17■■□□□ 1.3
LTBR-211ENST00000543190 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
LTBR-211ENST00000543190 CCDC102BQ68D86 513 aa23.17■■□□□ 1.3
LTBR-211ENST00000543190 FAM43AQ8N2R8 423 aa23.17■■□□□ 1.3
LTBR-211ENST00000543190 OTUD5Q96G74 571 aa23.17■■□□□ 1.3
LTBR-211ENST00000543190 ATRNL1Q5VV63 1379 aa23.16■■□□□ 1.3
LTBR-211ENST00000543190 PTPRFP10586 1907 aa23.16■■□□□ 1.3
LTBR-211ENST00000543190 IRF6O14896 467 aa23.16■■□□□ 1.3
LTBR-211ENST00000543190 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
LTBR-211ENST00000543190 DIXDC1Q155Q3 683 aa23.16■■□□□ 1.3
LTBR-211ENST00000543190 EFCC1Q9HA90 598 aa23.16■■□□□ 1.3
LTBR-211ENST00000543190 KCNH4Q9UQ05 1017 aa23.16■■□□□ 1.3
LTBR-211ENST00000543190 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
LTBR-211ENST00000543190 AKAP2Q9Y2D5 859 aa23.16■■□□□ 1.3
LTBR-211ENST00000543190 TLR2O60603 784 aa23.15■■□□□ 1.3
LTBR-211ENST00000543190 GNRH1P01148 92 aa23.15■■□□□ 1.3
LTBR-211ENST00000543190 CD99L2Q8TCZ2 262 aa23.15■■□□□ 1.3
LTBR-211ENST00000543190 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
LTBR-211ENST00000543190 FAM198AQ9UFP1 575 aa23.15■■□□□ 1.3
LTBR-211ENST00000543190 ENTPD3O75355 529 aa23.14■■□□□ 1.29
LTBR-211ENST00000543190 NPM3O75607 178 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
LTBR-211ENST00000543190 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
LTBR-211ENST00000543190 TRIM27P14373 513 aa23.14■■□□□ 1.29
LTBR-211ENST00000543190 CAP1Q01518 475 aa23.14■■□□□ 1.29
LTBR-211ENST00000543190 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
LTBR-211ENST00000543190 SRGAP3O43295 1099 aa23.13■■□□□ 1.29
LTBR-211ENST00000543190 NFIAQ12857 509 aa23.13■■□□□ 1.29
LTBR-211ENST00000543190 RASGRF1Q13972 1273 aa23.13■■□□□ 1.29
LTBR-211ENST00000543190 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa23.13■■□□□ 1.29
LTBR-211ENST00000543190 SLF2Q8IX21 1173 aa23.13■■□□□ 1.29
LTBR-211ENST00000543190 PHIPQ8WWQ0 1821 aa23.12■■□□□ 1.29
LTBR-211ENST00000543190 BTBD19C9JJ37 291 aa23.12■■□□□ 1.29
LTBR-211ENST00000543190 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
LTBR-211ENST00000543190 MVPQ14764 893 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
LTBR-211ENST00000543190 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
LTBR-211ENST00000543190 A0A1B0GUL7 405 aa23.11■■□□□ 1.29
LTBR-211ENST00000543190 ADORA1P30542 326 aa23.11■■□□□ 1.29
LTBR-211ENST00000543190 ANKRD23Q86SG2 305 aa23.11■■□□□ 1.29
LTBR-211ENST00000543190 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
LTBR-211ENST00000543190 INPP5BP32019 993 aa23.1■■□□□ 1.29
LTBR-211ENST00000543190 TIMM10P62072 90 aa23.1■■□□□ 1.29
LTBR-211ENST00000543190 XAGE2Q96GT9 111 aa23.1■■□□□ 1.29
LTBR-211ENST00000543190 USP40Q9NVE5 1235 aa23.1■■□□□ 1.29
LTBR-211ENST00000543190 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
LTBR-211ENST00000543190 DOCK1Q14185 1865 aa23.1■■□□□ 1.29
LTBR-211ENST00000543190 ADGRA2Q96PE1 1338 aa23.09■■□□□ 1.29
LTBR-211ENST00000543190 PHF20L1A8MW92 1017 aa23.09■■□□□ 1.29
LTBR-211ENST00000543190 IGSF3O75054 1194 aa23.09■■□□□ 1.29
LTBR-211ENST00000543190 GNAI2P04899 355 aa23.09■■□□□ 1.29
LTBR-211ENST00000543190 PRMT2P55345 433 aa23.09■■□□□ 1.29
LTBR-211ENST00000543190 MOGSQ13724 837 aa23.09■■□□□ 1.29
LTBR-211ENST00000543190 MIGA2Q7L4E1 593 aa23.09■■□□□ 1.29
LTBR-211ENST00000543190 CXCL11O14625 94 aa23.08■■□□□ 1.29
LTBR-211ENST00000543190 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
LTBR-211ENST00000543190 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
LTBR-211ENST00000543190 TCP10Q12799 353 aa23.08■■□□□ 1.29
LTBR-211ENST00000543190 TFCP2Q12800 502 aa23.08■■□□□ 1.29
LTBR-211ENST00000543190 C17orf99Q6UX52 265 aa23.08■■□□□ 1.29
LTBR-211ENST00000543190 ZNF333Q96JL9 665 aa23.08■■□□□ 1.29
LTBR-211ENST00000543190 MGAMO43451 1857 aa23.08■■□□□ 1.29
LTBR-211ENST00000543190 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa23.07■■□□□ 1.28
LTBR-211ENST00000543190 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa23.07■■□□□ 1.28
LTBR-211ENST00000543190 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa23.07■■□□□ 1.28
LTBR-211ENST00000543190 TBC1D12O60347 775 aa23.06■■□□□ 1.28
LTBR-211ENST00000543190 RGS3P49796 1198 aa23.06■■□□□ 1.28
LTBR-211ENST00000543190 NBPF11Q86T75 865 aa23.06■■□□□ 1.28
LTBR-211ENST00000543190 GPR108Q9NPR9 543 aa23.06■■□□□ 1.28
LTBR-211ENST00000543190 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
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