RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531995.1

PUF60-218, Transcript of poly(U) binding splicing factor 60, humanhuman

TSL 3

Gene PUF60, Length 631 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60-218ENST00000531995 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
PUF60-218ENST00000531995 TMEM39BQ9GZU3 492 aa22.91■■□□□ 1.26
PUF60-218ENST00000531995 ELP3Q9H9T3 547 aa22.91■■□□□ 1.26
PUF60-218ENST00000531995 GPR108Q9NPR9 543 aa22.91■■□□□ 1.26
PUF60-218ENST00000531995 BRCA2P51587 3418 aa22.9■■□□□ 1.26
PUF60-218ENST00000531995 A0A1B0GUL7 405 aa22.9■■□□□ 1.26
PUF60-218ENST00000531995 ALDH1A1P00352 501 aa22.9■■□□□ 1.26
PUF60-218ENST00000531995 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
PUF60-218ENST00000531995 SLC5A1P13866 664 aa22.9■■□□□ 1.26
PUF60-218ENST00000531995 CACNB3P54284 484 aa22.9■■□□□ 1.26
PUF60-218ENST00000531995 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
PUF60-218ENST00000531995 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
PUF60-218ENST00000531995 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa22.89■■□□□ 1.25
PUF60-218ENST00000531995 RHPN1Q8TCX5 695 aa22.89■■□□□ 1.25
PUF60-218ENST00000531995 TEPSINQ96N21 525 aa22.89■■□□□ 1.25
PUF60-218ENST00000531995 AKAP2Q9Y2D5 859 aa22.89■■□□□ 1.25
PUF60-218ENST00000531995 RAB11FIP3O75154 756 aa22.88■■□□□ 1.25
PUF60-218ENST00000531995 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
PUF60-218ENST00000531995 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa22.88■■□□□ 1.25
PUF60-218ENST00000531995 TNNI3KQ59H18 835 aa22.88■■□□□ 1.25
PUF60-218ENST00000531995 CAVIN4Q5BKX8 364 aa22.88■■□□□ 1.25
PUF60-218ENST00000531995 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa22.88■■□□□ 1.25
PUF60-218ENST00000531995 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
PUF60-218ENST00000531995 OPTNQ96CV9 577 aa22.88■■□□□ 1.25
PUF60-218ENST00000531995 XAGE2Q96GT9 111 aa22.88■■□□□ 1.25
PUF60-218ENST00000531995 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa22.88■■□□□ 1.25
PUF60-218ENST00000531995 IGHDP01880 384 aa22.87■■□□□ 1.25
PUF60-218ENST00000531995 CRHR2Q13324 411 aa22.87■■□□□ 1.25
PUF60-218ENST00000531995 ERC1Q8IUD2 1116 aa22.87■■□□□ 1.25
PUF60-218ENST00000531995 TRIM17Q9Y577 477 aa22.87■■□□□ 1.25
PUF60-218ENST00000531995 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
PUF60-218ENST00000531995 APBB1O00213 710 aa22.86■■□□□ 1.25
PUF60-218ENST00000531995 SLC34A2O95436 690 aa22.86■■□□□ 1.25
PUF60-218ENST00000531995 VGLL4Q14135 290 aa22.86■■□□□ 1.25
PUF60-218ENST00000531995 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa22.85■■□□□ 1.25
PUF60-218ENST00000531995 UNCXA6NJT0 531 aa22.85■■□□□ 1.25
PUF60-218ENST00000531995 PHKA1P46020 1223 aa22.85■■□□□ 1.25
PUF60-218ENST00000531995 TNNI2P48788 182 aa22.85■■□□□ 1.25
PUF60-218ENST00000531995 INHBEP58166 350 aa22.85■■□□□ 1.25
PUF60-218ENST00000531995 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa22.85■■□□□ 1.25
PUF60-218ENST00000531995 TEKT1Q969V4 418 aa22.85■■□□□ 1.25
PUF60-218ENST00000531995 KIF1BPQ96EK5 621 aa22.85■■□□□ 1.25
PUF60-218ENST00000531995 NEUROD6Q96NK8 337 aa22.85■■□□□ 1.25
PUF60-218ENST00000531995 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa22.85■■□□□ 1.25
PUF60-218ENST00000531995 CCDC102BQ68D86 513 aa22.84■■□□□ 1.25
PUF60-218ENST00000531995 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
PUF60-218ENST00000531995 CD99L2Q8TCZ2 262 aa22.84■■□□□ 1.25
PUF60-218ENST00000531995 PTPN18Q99952 460 aa22.84■■□□□ 1.25
PUF60-218ENST00000531995 DBNDD2Q9BQY9 259 aa22.84■■□□□ 1.25
PUF60-218ENST00000531995 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
PUF60-218ENST00000531995 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
PUF60-218ENST00000531995 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
PUF60-218ENST00000531995 ZBTB22O15209 634 aa22.83■■□□□ 1.25
PUF60-218ENST00000531995 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
PUF60-218ENST00000531995 OTOP1Q7RTM1 612 aa22.83■■□□□ 1.25
PUF60-218ENST00000531995 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
PUF60-218ENST00000531995 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP22.82■■□□□ 1.24
PUF60-218ENST00000531995 OTUD5Q96G74 571 aa22.82■■□□□ 1.24
PUF60-218ENST00000531995 AK9Q5TCS8 1911 aa22.82■■□□□ 1.24
PUF60-218ENST00000531995 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa22.81■■□□□ 1.24
PUF60-218ENST00000531995 TMOD2Q9NZR1 351 aa22.81■■□□□ 1.24
PUF60-218ENST00000531995 CSADQ9Y600 493 aa22.81■■□□□ 1.24
PUF60-218ENST00000531995 MAST3O60307 1309 aa22.81■■□□□ 1.24
PUF60-218ENST00000531995 DOCK2Q92608 1830 aa22.8■■□□□ 1.24
PUF60-218ENST00000531995 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
PUF60-218ENST00000531995 BRI3BPQ8WY22 251 aa22.8■■□□□ 1.24
PUF60-218ENST00000531995 MS4A4AQ96JQ5 239 aa22.8■■□□□ 1.24
PUF60-218ENST00000531995 ZDHHC15Q96MV8 337 aa22.8■■□□□ 1.24
PUF60-218ENST00000531995 LRRCC1Q9C099 1032 aa22.8■■□□□ 1.24
PUF60-218ENST00000531995 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa22.79■■□□□ 1.24
PUF60-218ENST00000531995 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
PUF60-218ENST00000531995 MAP3K9P80192 1104 aa22.79■■□□□ 1.24
PUF60-218ENST00000531995 CAP1Q01518 475 aa22.79■■□□□ 1.24
PUF60-218ENST00000531995 CCL15Q16663 113 aa22.79■■□□□ 1.24
PUF60-218ENST00000531995 AACSQ86V21 672 aa22.79■■□□□ 1.24
PUF60-218ENST00000531995 ERO1AQ96HE7 468 aa22.79■■□□□ 1.24
PUF60-218ENST00000531995 WRNIP1Q96S55 665 aa22.79■■□□□ 1.24
PUF60-218ENST00000531995 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
PUF60-218ENST00000531995 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
PUF60-218ENST00000531995 SMC5Q8IY18 1101 aa22.78■■□□□ 1.24
PUF60-218ENST00000531995 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
PUF60-218ENST00000531995 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa22.78■■□□□ 1.24
PUF60-218ENST00000531995 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
PUF60-218ENST00000531995 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
PUF60-218ENST00000531995 RASGRF1Q13972 1273 aa22.77■■□□□ 1.24
PUF60-218ENST00000531995 GCC1Q96CN9 775 aa22.77■■□□□ 1.24
PUF60-218ENST00000531995 MYH2Q9UKX2 1941 aa22.76■■□□□ 1.23
PUF60-218ENST00000531995 SEMA3EO15041 775 aa22.76■■□□□ 1.23
PUF60-218ENST00000531995 GTF2A2P52657 109 aa22.76■■□□□ 1.23
PUF60-218ENST00000531995 SP3Q02447 781 aa22.76■■□□□ 1.23
PUF60-218ENST00000531995 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
PUF60-218ENST00000531995 DIXDC1Q155Q3 683 aa22.76■■□□□ 1.23
PUF60-218ENST00000531995 FAM43AQ8N2R8 423 aa22.76■■□□□ 1.23
PUF60-218ENST00000531995 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
PUF60-218ENST00000531995 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
PUF60-218ENST00000531995 SPDYE5A6NIY4 337 aa22.75■■□□□ 1.23
PUF60-218ENST00000531995 PRDX5P30044 214 aa22.75■■□□□ 1.23
PUF60-218ENST00000531995 GORABQ5T7V8 394 aa22.75■■□□□ 1.23
PUF60-218ENST00000531995 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
PUF60-218ENST00000531995 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
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