RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528045.5

SYBU-216, Transcript of syntabulin, human

TSL 4

Gene SYBU, Length 564 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SYBU-216	ENST00000528045	LRRCC1	Q9C099	1032 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SYBU-216	ENST00000528045	ZNF395	Q9H8N7	513 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SYBU-216	ENST00000528045	ZNF330	Q9Y3S2	320 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SYBU-216	ENST00000528045	RREB1	Q92766	1687 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SYBU-216	ENST00000528045	UTY	O14607	1347 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SYBU-216	ENST00000528045	AFF2	P51816	1311 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SYBU-216	ENST00000528045	IBTK	Q9P2D0	1353 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SYBU-216	ENST00000528045	SPEF2	Q9C093	1822 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SYBU-216	ENST00000528045		A0A087WZG4	1122 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SYBU-216	ENST00000528045	PNMA6E	A0A0J9YXQ4	647 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SYBU-216	ENST00000528045	ATP5J2-PTCD1	G3V325	749 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SYBU-216	ENST00000528045	SMARCA5	O60264	1052 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SYBU-216	ENST00000528045	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SYBU-216	ENST00000528045	ANP32A	P39687	249 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SYBU-216	ENST00000528045	ERVK-9	P63128	1117 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SYBU-216	ENST00000528045	TCIRG1	Q13488	830 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SYBU-216	ENST00000528045	RNF20	Q5VTR2	975 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SYBU-216	ENST00000528045	TTLL7	Q6ZT98	887 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SYBU-216	ENST00000528045	PLEKHM2	Q8IWE5	1019 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SYBU-216	ENST00000528045	C16orf71	Q8IYS4	520 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SYBU-216	ENST00000528045	CCDC155	Q8N6L0	562 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SYBU-216	ENST00000528045	QTRT2	Q9H974	415 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SYBU-216	ENST00000528045	CWC25	Q9NXE8	425 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SYBU-216	ENST00000528045	TRPC5	Q9UL62	973 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SYBU-216	ENST00000528045	EXOC6B	Q9Y2D4	811 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SYBU-216	ENST00000528045	BCOR	Q6W2J9	1755 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SYBU-216	ENST00000528045	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SYBU-216	ENST00000528045	FAM181B	A6NEQ2	426 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SYBU-216	ENST00000528045		H7C1W4	665 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SYBU-216	ENST00000528045	KCNQ2	O43526	872 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SYBU-216	ENST00000528045	EIF5B	O60841	1220 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SYBU-216	ENST00000528045	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SYBU-216	ENST00000528045	SIK1	P57059	783 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SYBU-216	ENST00000528045	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	4.89	□□□□□ -1.63
SYBU-216	ENST00000528045	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SYBU-216	ENST00000528045	MTX1	Q13505	466 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SYBU-216	ENST00000528045	BMP2KL	Q5H9B9	411 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SYBU-216	ENST00000528045	CC2D2B	Q6DHV5	1058 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SYBU-216	ENST00000528045	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SYBU-216	ENST00000528045	CCDC191	Q8NCU4	936 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SYBU-216	ENST00000528045	NANOS1	Q8WY41	292 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SYBU-216	ENST00000528045	JARID2	Q92833	1246 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SYBU-216	ENST00000528045	KIF1BP	Q96EK5	621 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SYBU-216	ENST00000528045	SUCLG2	Q96I99	432 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SYBU-216	ENST00000528045	SLC4A9	Q96Q91	983 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SYBU-216	ENST00000528045	UPF2	Q9HAU5	1272 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SYBU-216	ENST00000528045	CCDC87	Q9NVE4	849 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SYBU-216	ENST00000528045	TBC1D2B	Q9UPU7	963 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SYBU-216	ENST00000528045	MAP3K15	Q6ZN16	1313 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SYBU-216	ENST00000528045	LAMB2	P55268	1798 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SYBU-216	ENST00000528045	ERVV-1	B6SEH8	477 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SYBU-216	ENST00000528045	ITGA6	P23229	1130 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SYBU-216	ENST00000528045	SCTR	P47872	440 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SYBU-216	ENST00000528045	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SYBU-216	ENST00000528045	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SYBU-216	ENST00000528045	TTC22	Q5TAA0	569 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SYBU-216	ENST00000528045	CASC1	Q6TDU7	716 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SYBU-216	ENST00000528045	ERC1	Q8IUD2	1116 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SYBU-216	ENST00000528045	GPR161	Q8N6U8	529 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SYBU-216	ENST00000528045	RHPN1	Q8TCX5	695 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SYBU-216	ENST00000528045	KAZALD1	Q96I82	304 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SYBU-216	ENST00000528045	ISCA1	Q9BUE6	129 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SYBU-216	ENST00000528045	BICC1	Q9H694	974 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SYBU-216	ENST00000528045	NOP58	Q9Y2X3	529 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SYBU-216	ENST00000528045	PCDHB11	Q9Y5F2	797 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SYBU-216	ENST00000528045	DDX60	Q8IY21	1712 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SYBU-216	ENST00000528045	PALLD	Q8WX93	1383 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SYBU-216	ENST00000528045	ATRN	O75882	1429 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SYBU-216	ENST00000528045	MYH7	P12883	1935 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SYBU-216	ENST00000528045	CDC45	O75419	566 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SYBU-216	ENST00000528045	IFIT2	P09913	472 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SYBU-216	ENST00000528045	MX1	P20591	662 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SYBU-216	ENST00000528045	GPC1	P35052	558 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SYBU-216	ENST00000528045	CRKL	P46109	303 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SYBU-216	ENST00000528045	RNF144A	P50876	292 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SYBU-216	ENST00000528045	PDE1A	P54750	535 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SYBU-216	ENST00000528045	EIF5	P55010	431 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SYBU-216	ENST00000528045	CASP7	P55210	303 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SYBU-216	ENST00000528045	FOXO4	P98177	505 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SYBU-216	ENST00000528045	KRT76	Q01546	638 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SYBU-216	ENST00000528045	ITPK1	Q13572	414 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SYBU-216	ENST00000528045	HLF	Q16534	295 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SYBU-216	ENST00000528045	EPHA10	Q5JZY3	1008 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SYBU-216	ENST00000528045	FAM182B	Q5T319	152 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SYBU-216	ENST00000528045	INTS5	Q6P9B9	1019 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SYBU-216	ENST00000528045	LYSMD3	Q7Z3D4	306 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SYBU-216	ENST00000528045	CYP2U1	Q7Z449	544 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SYBU-216	ENST00000528045	CLASRP	Q8N2M8	674 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SYBU-216	ENST00000528045	OTUD7A	Q8TE49	926 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SYBU-216	ENST00000528045	IPO9	Q96P70	1041 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SYBU-216	ENST00000528045	OSBPL3	Q9H4L5	887 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SYBU-216	ENST00000528045	IL1RAPL2	Q9NP60	686 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SYBU-216	ENST00000528045	COPRS	Q9NQ92	184 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SYBU-216	ENST00000528045	STAP2	Q9UGK3	403 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SYBU-216	ENST00000528045	ZBTB1	Q9Y2K1	713 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SYBU-216	ENST00000528045	CHMP3	Q9Y3E7	222 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SYBU-216	ENST00000528045	TAF1	P21675	1872 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SYBU-216	ENST00000528045	COL15A1	P39059	1388 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SYBU-216	ENST00000528045	C4A	P0C0L4	1744 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SYBU-216	ENST00000528045	C4B	P0C0L5	1744 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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