RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525081.1

NSD3-204, Transcript of nuclear receptor binding SET domain protein 3, human

TSL 2

Gene NSD3, Length 1,581 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NSD3-204	ENST00000525081	BCAR3	O75815	825 aa		13.62	□□□□□ -0.23
NSD3-204	ENST00000525081	LDHB	P07195	334 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
NSD3-204	ENST00000525081	CAP1	Q01518	475 aa		13.62	□□□□□ -0.23
NSD3-204	ENST00000525081	NFIA	Q12857	509 aa		13.62	□□□□□ -0.23
NSD3-204	ENST00000525081	CCL15	Q16663	113 aa		13.62	□□□□□ -0.23
NSD3-204	ENST00000525081	CDC42EP5	Q6NZY7	148 aa		13.62	□□□□□ -0.23
NSD3-204	ENST00000525081	MIGA2	Q7L4E1	593 aa		13.62	□□□□□ -0.23
NSD3-204	ENST00000525081	CD99L2	Q8TCZ2	262 aa		13.62	□□□□□ -0.23
NSD3-204	ENST00000525081	GNL3L	Q9NVN8	582 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
NSD3-204	ENST00000525081	RPAP1	Q9BWH6	1393 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
NSD3-204	ENST00000525081	SPDYE5	A6NIY4	337 aa		13.61	□□□□□ -0.23
NSD3-204	ENST00000525081	SRGAP3	O43295	1099 aa		13.61	□□□□□ -0.23
NSD3-204	ENST00000525081	GNAI3	P08754	354 aa		13.61	□□□□□ -0.23
NSD3-204	ENST00000525081	TRIM27	P14373	513 aa		13.61	□□□□□ -0.23
NSD3-204	ENST00000525081	GTF2A2	P52657	109 aa		13.61	□□□□□ -0.23
NSD3-204	ENST00000525081	TIMM10	P62072	90 aa		13.61	□□□□□ -0.23
NSD3-204	ENST00000525081	TCP10	Q12799	353 aa		13.61	□□□□□ -0.23
NSD3-204	ENST00000525081	CCDC102B	Q68D86	513 aa		13.61	□□□□□ -0.23
NSD3-204	ENST00000525081	FAM43A	Q8N2R8	423 aa		13.61	□□□□□ -0.23
NSD3-204	ENST00000525081	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		13.61	□□□□□ -0.23
NSD3-204	ENST00000525081	SALL1	Q9NSC2	1324 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NSD3-204	ENST00000525081	HOXD11	P31277	338 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
NSD3-204	ENST00000525081	TFCP2	Q12800	502 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NSD3-204	ENST00000525081	RASGRF1	Q13972	1273 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NSD3-204	ENST00000525081	FAM151A	Q8WW52	585 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NSD3-204	ENST00000525081	FRAT1	Q92837	279 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
NSD3-204	ENST00000525081	ERO1A	Q96HE7	468 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NSD3-204	ENST00000525081	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
NSD3-204	ENST00000525081	IRF6	O14896	467 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NSD3-204	ENST00000525081	SEMA3E	O15041	775 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NSD3-204	ENST00000525081	SP3	Q02447	781 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NSD3-204	ENST00000525081	MTX1	Q13505	466 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NSD3-204	ENST00000525081	TAF1C	Q15572	869 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
NSD3-204	ENST00000525081	DCAF15	Q66K64	600 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NSD3-204	ENST00000525081	ERO1B	Q86YB8	467 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NSD3-204	ENST00000525081	CLUAP1	Q96AJ1	413 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NSD3-204	ENST00000525081	HOOK2	Q96ED9	719 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NSD3-204	ENST00000525081	USP40	Q9NVE5	1235 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NSD3-204	ENST00000525081	FAM198A	Q9UFP1	575 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NSD3-204	ENST00000525081		A0A1B0GUL7	405 aa		13.58	□□□□□ -0.23
NSD3-204	ENST00000525081	IPO8	O15397	1037 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.23
NSD3-204	ENST00000525081	INPP5B	P32019	993 aa		13.58	□□□□□ -0.23
NSD3-204	ENST00000525081	ATF7IP	Q6VMQ6	1270 aa		13.58	□□□□□ -0.23
NSD3-204	ENST00000525081	ZFPM1	Q8IX07	1006 aa		13.58	□□□□□ -0.23
NSD3-204	ENST00000525081	ZNF341	Q9BYN7	854 aa		13.58	□□□□□ -0.23
NSD3-204	ENST00000525081	XAGE2	Q96GT9	111 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NSD3-204	ENST00000525081	EFCC1	Q9HA90	598 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NSD3-204	ENST00000525081	ZFYVE28	Q9HCC9	887 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NSD3-204	ENST00000525081	ABCF2	Q9UG63	623 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NSD3-204	ENST00000525081	PTPN22	Q9Y2R2	807 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NSD3-204	ENST00000525081	PNMA6E	A0A0J9YXQ4	647 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NSD3-204	ENST00000525081	BTBD19	C9JJ37	291 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NSD3-204	ENST00000525081	CETP	P11597	493 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NSD3-204	ENST00000525081	PPIL2	Q13356	520 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NSD3-204	ENST00000525081	SNAPC2	Q13487	334 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NSD3-204	ENST00000525081	GAK	O14976	1311 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NSD3-204	ENST00000525081	ZBTB22	O15209	634 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NSD3-204	ENST00000525081	GNAI2	P04899	355 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NSD3-204	ENST00000525081	DZIP1	Q86YF9	867 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
NSD3-204	ENST00000525081	ZGPAT	Q8N5A5	531 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
NSD3-204	ENST00000525081	GOLGA6L2	Q8N9W4	650 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
NSD3-204	ENST00000525081	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NSD3-204	ENST00000525081	ZNF112	Q9UJU3	913 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NSD3-204	ENST00000525081	AKAP2	Q9Y2D5	859 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NSD3-204	ENST00000525081	KIAA0100	Q14667	2235 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
NSD3-204	ENST00000525081	PDS5A	Q29RF7	1337 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
NSD3-204	ENST00000525081	RGS3	P49796	1198 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NSD3-204	ENST00000525081	PPAT	Q06203	517 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NSD3-204	ENST00000525081	MVP	Q14764	893 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
NSD3-204	ENST00000525081	PI16	Q6UXB8	463 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NSD3-204	ENST00000525081	TMEM57	Q8N5G2	664 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NSD3-204	ENST00000525081	ATRNL1	Q5VV63	1379 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NSD3-204	ENST00000525081	TLR2	O60603	784 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NSD3-204	ENST00000525081	SH3BP5L	Q7L8J4	393 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NSD3-204	ENST00000525081	MIER1	Q8N108	512 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NSD3-204	ENST00000525081	ZNF384	Q8TF68	577 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NSD3-204	ENST00000525081	IDI2	Q9BXS1	227 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NSD3-204	ENST00000525081	HMG20B	Q9P0W2	317 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NSD3-204	ENST00000525081	RFX7	Q2KHR2	1363 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NSD3-204	ENST00000525081	AK9	Q5TCS8	1911 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NSD3-204	ENST00000525081	MYH2	Q9UKX2	1941 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NSD3-204	ENST00000525081	POTEF	A5A3E0	1075 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NSD3-204	ENST00000525081	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
NSD3-204	ENST00000525081	SLURP2	P0DP57	97 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NSD3-204	ENST00000525081	BTD	P43251	543 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NSD3-204	ENST00000525081	HNRNPU	Q00839	825 aa	Known RBP eCLIP	13.54	□□□□□ -0.24
NSD3-204	ENST00000525081	MECOM	Q03112	1051 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NSD3-204	ENST00000525081	ARHGAP39	Q9C0H5	1083 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NSD3-204	ENST00000525081	DDX4	Q9NQI0	724 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
NSD3-204	ENST00000525081	RNF216	Q9NWF9	866 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
NSD3-204	ENST00000525081	KCNH4	Q9UQ05	1017 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NSD3-204	ENST00000525081	MROH7-TTC4	A0A0A0MT08	1334 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NSD3-204	ENST00000525081	DDTL	A6NHG4	134 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
NSD3-204	ENST00000525081	ENTPD3	O75355	529 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NSD3-204	ENST00000525081	PICALM	Q13492	652 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NSD3-204	ENST00000525081	NOL9	Q5SY16	702 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
NSD3-204	ENST00000525081	GORAB	Q5T7V8	394 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NSD3-204	ENST00000525081	ZKSCAN2	Q63HK3	967 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NSD3-204	ENST00000525081	SPTY2D1	Q68D10	685 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
NSD3-204	ENST00000525081	TBC1D9	Q6ZT07	1266 aa		13.53	□□□□□ -0.24

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