RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524481.5

PTPRK-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, human

TSL 2

Gene PTPRK, Length 3,157 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRK-216	ENST00000524481	PFKFB2	O60825	505 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PTPRK-216	ENST00000524481	LIG1	P18858	919 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PTPRK-216	ENST00000524481	MECOM	Q03112	1051 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PTPRK-216	ENST00000524481	MCM9	Q9NXL9	1143 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PTPRK-216	ENST00000524481	PPP1R1B	Q9UD71	204 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
PTPRK-216	ENST00000524481	ANGEL1	Q9UNK9	670 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
PTPRK-216	ENST00000524481	CNTNAP4	Q9C0A0	1308 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PTPRK-216	ENST00000524481	CYP2D6	P10635	497 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PTPRK-216	ENST00000524481	DACT1	Q9NYF0	836 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PTPRK-216	ENST00000524481	TAF1	P21675	1872 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PTPRK-216	ENST00000524481	BAZ2B	Q9UIF8	2168 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
PTPRK-216	ENST00000524481	GYS1	P13807	737 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PTPRK-216	ENST00000524481	UBE2H	P62256	183 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PTPRK-216	ENST00000524481	DOK7	Q18PE1	504 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PTPRK-216	ENST00000524481	CPLX2	Q6PUV4	134 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
PTPRK-216	ENST00000524481	KLHL34	Q8N239	644 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PTPRK-216	ENST00000524481	DHX16	O60231	1041 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
PTPRK-216	ENST00000524481	TCRBV5S4A2T	A0A5A2	114 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PTPRK-216	ENST00000524481	FSD2	A1L4K1	749 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PTPRK-216	ENST00000524481	NMT2	O60551	498 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PTPRK-216	ENST00000524481	MARCKS	P29966	332 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
PTPRK-216	ENST00000524481	SART3	Q15020	963 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
PTPRK-216	ENST00000524481	AKNAD1	Q5T1N1	836 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PTPRK-216	ENST00000524481	RC3H1	Q5TC82	1133 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
PTPRK-216	ENST00000524481	NBPF3	Q9H094	633 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PTPRK-216	ENST00000524481	TSPY26P	Q9H489	355 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PTPRK-216	ENST00000524481	TCHH	Q07283	1943 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PTPRK-216	ENST00000524481	NUP98	P52948	1817 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PTPRK-216	ENST00000524481	WTAP	Q15007	396 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PTPRK-216	ENST00000524481	CSPP1	Q1MSJ5	1256 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PTPRK-216	ENST00000524481	ALG1	Q9BT22	464 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PTPRK-216	ENST00000524481	PLCH1	Q4KWH8	1693 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PTPRK-216	ENST00000524481	LAMB4	A4D0S4	1761 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PTPRK-216	ENST00000524481	PPARA	Q07869	468 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PTPRK-216	ENST00000524481	ISM2	Q6H9L7	571 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PTPRK-216	ENST00000524481	CLEC17A	Q6ZS10	378 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PTPRK-216	ENST00000524481	MB21D2	Q8IYB1	491 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
PTPRK-216	ENST00000524481	CDC27	P30260	824 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PTPRK-216	ENST00000524481	IARS	P41252	1262 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
PTPRK-216	ENST00000524481	TRIM29	Q14134	588 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PTPRK-216	ENST00000524481	GRIK5	Q16478	980 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PTPRK-216	ENST00000524481	ANKRD2	Q9GZV1	360 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PTPRK-216	ENST00000524481	LDHB	P07195	334 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
PTPRK-216	ENST00000524481	USP17L8	P0C7I0	530 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PTPRK-216	ENST00000524481	HMGN5	P82970	282 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
PTPRK-216	ENST00000524481	PICALM	Q13492	652 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PTPRK-216	ENST00000524481	STK38	Q15208	465 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PTPRK-216	ENST00000524481	MAPKAPK5	Q8IW41	473 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PTPRK-216	ENST00000524481	USP28	Q96RU2	1077 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PTPRK-216	ENST00000524481	NOL10	Q9BSC4	688 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
PTPRK-216	ENST00000524481	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
PTPRK-216	ENST00000524481	KCNJ14	Q9UNX9	436 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PTPRK-216	ENST00000524481	UBR2	Q8IWV8	1755 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PTPRK-216	ENST00000524481	LRSAM1	Q6UWE0	723 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PTPRK-216	ENST00000524481	PROM2	Q8N271	834 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PTPRK-216	ENST00000524481	TGFBRAP1	Q8WUH2	860 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PTPRK-216	ENST00000524481	LEO1	Q8WVC0	666 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
PTPRK-216	ENST00000524481	MXD3	Q9BW11	206 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PTPRK-216	ENST00000524481	GTF2I	P78347	998 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PTPRK-216	ENST00000524481	GPSM2	P81274	684 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PTPRK-216	ENST00000524481	AKAP17A	Q02040	695 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
PTPRK-216	ENST00000524481	DYNLL2	Q96FJ2	89 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PTPRK-216	ENST00000524481	TNMD	Q9H2S6	317 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PTPRK-216	ENST00000524481	TSPY2	A6NKD2	308 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PTPRK-216	ENST00000524481	MMP10	P09238	476 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PTPRK-216	ENST00000524481	FDPS	P14324	419 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
PTPRK-216	ENST00000524481	APOA5	Q6Q788	366 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PTPRK-216	ENST00000524481	ZNF274	Q96GC6	653 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
PTPRK-216	ENST00000524481	SCAND2P	Q9GZW5	306 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
PTPRK-216	ENST00000524481	MKNK2	Q9HBH9	465 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PTPRK-216	ENST00000524481	USP25	Q9UHP3	1055 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PTPRK-216	ENST00000524481	STX8	Q9UNK0	236 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PTPRK-216	ENST00000524481	TACC3	Q9Y6A5	838 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PTPRK-216	ENST00000524481	NR1I2	O75469	434 aa		13.71	□□□□□ -0.22
PTPRK-216	ENST00000524481	RBM5	P52756	815 aa	Known RBP eCLIP	13.71	□□□□□ -0.22
PTPRK-216	ENST00000524481	GRAP	Q13588	217 aa		13.71	□□□□□ -0.22
PTPRK-216	ENST00000524481	GRAPL	Q8TC17	118 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.22
PTPRK-216	ENST00000524481	SDF4	Q9BRK5	362 aa		13.71	□□□□□ -0.22
PTPRK-216	ENST00000524481	TM4SF1	P30408	202 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PTPRK-216	ENST00000524481	SCNN1D	P51172	638 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PTPRK-216	ENST00000524481	ATP2B2	Q01814	1243 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PTPRK-216	ENST00000524481	SPECC1	Q5M775	1068 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PTPRK-216	ENST00000524481	CCDC183	Q5T5S1	534 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PTPRK-216	ENST00000524481	GGA1	Q9UJY5	639 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PTPRK-216	ENST00000524481	CFAP45	Q9UL16	551 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PTPRK-216	ENST00000524481	N4BP2	Q86UW6	1770 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
PTPRK-216	ENST00000524481		A0A1B0GVL5	298 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PTPRK-216	ENST00000524481	DDR1	Q08345	913 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PTPRK-216	ENST00000524481	SLC10A5	Q5PT55	438 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PTPRK-216	ENST00000524481	SLC44A5	Q8NCS7	719 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PTPRK-216	ENST00000524481	IL17RA	Q96F46	866 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PTPRK-216	ENST00000524481	NUP62CL	Q9H1M0	184 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PTPRK-216	ENST00000524481	HPS5	Q9UPZ3	1129 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PTPRK-216	ENST00000524481	EN1	Q05925	392 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
PTPRK-216	ENST00000524481	MFSD14B	Q5SR56	506 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PTPRK-216	ENST00000524481	COL23A1	Q86Y22	540 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
PTPRK-216	ENST00000524481	CRNKL1	Q9BZJ0	848 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
PTPRK-216	ENST00000524481	TJP1	Q07157	1748 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PTPRK-216	ENST00000524481	IFIT1B	Q5T764	474 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
PTPRK-216	ENST00000524481	CCAR1	Q8IX12	1150 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22

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