RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523628.5

HDAC2-216, Transcript of histone deacetylase 2, humanhuman

TSL 4

Gene HDAC2, Length 549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC2-216ENST00000523628 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa6.52□□□□□ -1.37
HDAC2-216ENST00000523628 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa6.52□□□□□ -1.37
HDAC2-216ENST00000523628 ELP3Q9H9T3 547 aa6.52□□□□□ -1.37
HDAC2-216ENST00000523628 SEC31BQ9NQW1 1179 aa6.52□□□□□ -1.37
HDAC2-216ENST00000523628 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
HDAC2-216ENST00000523628 LMTK3Q96Q04 1460 aa6.52□□□□□ -1.37
HDAC2-216ENST00000523628 ATP7AQ04656 1500 aa6.51□□□□□ -1.37
HDAC2-216ENST00000523628 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa6.51□□□□□ -1.37
HDAC2-216ENST00000523628 FAM177BA6PVY3 158 aa6.51□□□□□ -1.37
HDAC2-216ENST00000523628 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
HDAC2-216ENST00000523628 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
HDAC2-216ENST00000523628 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa6.51□□□□□ -1.37
HDAC2-216ENST00000523628 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
HDAC2-216ENST00000523628 KLHDC7BQ96G42 594 aa6.51□□□□□ -1.37
HDAC2-216ENST00000523628 MYRFLQ96LU7 910 aa6.51□□□□□ -1.37
HDAC2-216ENST00000523628 C7orf69Q9H7B7 122 aa6.51□□□□□ -1.37
HDAC2-216ENST00000523628 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa6.51□□□□□ -1.37
HDAC2-216ENST00000523628 TMEM63CQ9P1W3 806 aa6.51□□□□□ -1.37
HDAC2-216ENST00000523628 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
HDAC2-216ENST00000523628 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
HDAC2-216ENST00000523628 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
HDAC2-216ENST00000523628 YEATS2Q9ULM3 1422 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC2-216ENST00000523628 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC2-216ENST00000523628 PLXNC1O60486 1568 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC2-216ENST00000523628 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC2-216ENST00000523628 ADAM11O75078 769 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC2-216ENST00000523628 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
HDAC2-216ENST00000523628 RNF43Q68DV7 783 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF438Q7Z4V0 828 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC2-216ENST00000523628 TRIM42Q8IWZ5 723 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC2-216ENST00000523628 UBASH3BQ8TF42 649 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC2-216ENST00000523628 FBXO41Q8TF61 875 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC2-216ENST00000523628 WNT8BQ93098 351 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC2-216ENST00000523628 OSGEPQ9NPF4 335 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC2-216ENST00000523628 CNTN3Q9P232 1028 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC2-216ENST00000523628 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
HDAC2-216ENST00000523628 SALL4Q9UJQ4 1053 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC2-216ENST00000523628 ABCA6Q8N139 1617 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC2-216ENST00000523628 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
HDAC2-216ENST00000523628 MIA2Q96PC5 1412 aa6.5□□□□□ -1.37
HDAC2-216ENST00000523628 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa6.49□□□□□ -1.37
HDAC2-216ENST00000523628 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
HDAC2-216ENST00000523628 ARHGEF5Q12774 1597 aa6.49□□□□□ -1.37
HDAC2-216ENST00000523628 HMX2A2RU54 273 aa6.49□□□□□ -1.37
HDAC2-216ENST00000523628 H3BRJ5 948 aa6.49□□□□□ -1.37
HDAC2-216ENST00000523628 PAX4O43316 350 aa6.49□□□□□ -1.37
HDAC2-216ENST00000523628 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
HDAC2-216ENST00000523628 GRIK1P39086 918 aa6.49□□□□□ -1.37
HDAC2-216ENST00000523628 IRAK1P51617 712 aa6.49□□□□□ -1.37
HDAC2-216ENST00000523628 CABP4P57796 275 aa6.49□□□□□ -1.37
HDAC2-216ENST00000523628 PIP4K2BP78356 416 aa6.49□□□□□ -1.37
HDAC2-216ENST00000523628 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
HDAC2-216ENST00000523628 XKR5Q6UX68 686 aa6.49□□□□□ -1.37
HDAC2-216ENST00000523628 NPAS4Q8IUM7 802 aa6.49□□□□□ -1.37
HDAC2-216ENST00000523628 CLEC10AQ8IUN9 316 aa6.49□□□□□ -1.37
HDAC2-216ENST00000523628 DBNDD2Q9BQY9 259 aa6.49□□□□□ -1.37
HDAC2-216ENST00000523628 KANSL3Q9P2N6 904 aa6.49□□□□□ -1.37
HDAC2-216ENST00000523628 SYCP2Q9BX26 1530 aa6.49□□□□□ -1.37
HDAC2-216ENST00000523628 PTPRTO14522 1441 aa6.49□□□□□ -1.37
HDAC2-216ENST00000523628 VPS8Q8N3P4 1428 aa6.49□□□□□ -1.37
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
HDAC2-216ENST00000523628 A2MP01023 1474 aa6.48□□□□□ -1.37
HDAC2-216ENST00000523628 PLA2R1Q13018 1463 aa6.48□□□□□ -1.37
HDAC2-216ENST00000523628 CCDC141Q6ZP82 1450 aa6.48□□□□□ -1.37
HDAC2-216ENST00000523628 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
HDAC2-216ENST00000523628 PRR19A6NJB7 356 aa6.48□□□□□ -1.37
HDAC2-216ENST00000523628 NFKBIEO00221 500 aa6.48□□□□□ -1.37
HDAC2-216ENST00000523628 FAM13AO94988 1023 aa6.48□□□□□ -1.37
HDAC2-216ENST00000523628 SPINK2P20155 84 aa6.48□□□□□ -1.37
HDAC2-216ENST00000523628 GP2P55259 537 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
HDAC2-216ENST00000523628 ANKRD34AQ69YU3 496 aa6.48□□□□□ -1.37
HDAC2-216ENST00000523628 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
HDAC2-216ENST00000523628 FAM20CQ8IXL6 584 aa6.48□□□□□ -1.37
HDAC2-216ENST00000523628 C1orf127Q8N9H9 656 aa6.48□□□□□ -1.37
HDAC2-216ENST00000523628 FAM83CQ9BQN1 747 aa6.48□□□□□ -1.37
HDAC2-216ENST00000523628 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
HDAC2-216ENST00000523628 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
HDAC2-216ENST00000523628 TIAM1Q13009 1591 aa6.48□□□□□ -1.37
HDAC2-216ENST00000523628 A6NHS1 94 aa6.47□□□□□ -1.37
HDAC2-216ENST00000523628 SART1O43290 800 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
HDAC2-216ENST00000523628 TSPY4P0CV99 314 aa6.47□□□□□ -1.37
HDAC2-216ENST00000523628 TSPY10P0CW01 314 aa6.47□□□□□ -1.37
HDAC2-216ENST00000523628 ACPPP15309 386 aa6.47□□□□□ -1.37
HDAC2-216ENST00000523628 TMC7Q7Z402 723 aa6.47□□□□□ -1.37
HDAC2-216ENST00000523628 EDEM1Q92611 657 aa6.47□□□□□ -1.37
HDAC2-216ENST00000523628 RNF208Q9H0X6 261 aa6.47□□□□□ -1.37
HDAC2-216ENST00000523628 GGNBP2Q9H3C7 697 aa6.47□□□□□ -1.37
HDAC2-216ENST00000523628 DCTN4Q9UJW0 460 aa6.47□□□□□ -1.37
HDAC2-216ENST00000523628 POLIQ9UNA4 740 aa6.47□□□□□ -1.37
HDAC2-216ENST00000523628 KDM5DQ9BY66 1539 aa6.46□□□□□ -1.37
HDAC2-216ENST00000523628 C3P01024 1663 aa6.46□□□□□ -1.37
HDAC2-216ENST00000523628 ANKRD33BA6NCL7 494 aa6.46□□□□□ -1.38
HDAC2-216ENST00000523628 PDGFAP04085 211 aa6.46□□□□□ -1.38
HDAC2-216ENST00000523628 BMP3P12645 472 aa6.46□□□□□ -1.38
HDAC2-216ENST00000523628 CES1P23141 567 aa6.46□□□□□ -1.38
HDAC2-216ENST00000523628 FMNL2Q96PY5 1086 aa6.46□□□□□ -1.38
HDAC2-216ENST00000523628 RUSC1Q9BVN2 902 aa6.46□□□□□ -1.38
HDAC2-216ENST00000523628 RBCK1Q9BYM8 510 aa6.46□□□□□ -1.38
HDAC2-216ENST00000523628 KCNF1Q9H3M0 494 aa6.46□□□□□ -1.38
HDAC2-216ENST00000523628 DZANK1Q9NVP4 752 aa6.46□□□□□ -1.38
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