RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522928.1

CLVS1-209, Transcript of clavesin 1, humanhuman

TSL 2

Gene CLVS1, Length 464 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS1-209ENST00000522928 ANKRD34AQ69YU3 496 aa6.72□□□□□ -1.33
CLVS1-209ENST00000522928 MYRFLQ96LU7 910 aa6.72□□□□□ -1.33
CLVS1-209ENST00000522928 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
CLVS1-209ENST00000522928 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
CLVS1-209ENST00000522928 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa6.72□□□□□ -1.33
CLVS1-209ENST00000522928 AOC2O75106 756 aa6.71□□□□□ -1.34
CLVS1-209ENST00000522928 ADH5P11766 374 aa6.71□□□□□ -1.34
CLVS1-209ENST00000522928 LIG1P18858 919 aa6.71□□□□□ -1.34
CLVS1-209ENST00000522928 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
CLVS1-209ENST00000522928 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
CLVS1-209ENST00000522928 PSMD2Q13200 908 aa6.71□□□□□ -1.34
CLVS1-209ENST00000522928 LCE1DQ5T752 114 aa6.71□□□□□ -1.34
CLVS1-209ENST00000522928 NUTM2GQ5VZR2 741 aa6.71□□□□□ -1.34
CLVS1-209ENST00000522928 PRR23CQ6ZRP0 262 aa6.71□□□□□ -1.34
CLVS1-209ENST00000522928 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
CLVS1-209ENST00000522928 CORO1BQ9BR76 489 aa6.71□□□□□ -1.34
CLVS1-209ENST00000522928 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa6.71□□□□□ -1.34
CLVS1-209ENST00000522928 USP31Q70CQ4 1352 aa6.7□□□□□ -1.34
CLVS1-209ENST00000522928 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CLVS1-209ENST00000522928 PPP2R3AQ06190 1150 aa6.7□□□□□ -1.34
CLVS1-209ENST00000522928 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa6.7□□□□□ -1.34
CLVS1-209ENST00000522928 SV2BQ7L1I2 683 aa6.7□□□□□ -1.34
CLVS1-209ENST00000522928 FAM20CQ8IXL6 584 aa6.7□□□□□ -1.34
CLVS1-209ENST00000522928 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
CLVS1-209ENST00000522928 CEP41Q9BYV8 373 aa6.7□□□□□ -1.34
CLVS1-209ENST00000522928 CEP44Q9C0F1 390 aa6.7□□□□□ -1.34
CLVS1-209ENST00000522928 SEMA6BQ9H3T3 888 aa6.7□□□□□ -1.34
CLVS1-209ENST00000522928 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CLVS1-209ENST00000522928 FGD1P98174 961 aa6.69□□□□□ -1.34
CLVS1-209ENST00000522928 CDPF1Q6NVV7 123 aa6.69□□□□□ -1.34
CLVS1-209ENST00000522928 SHISA5Q8N114 240 aa6.69□□□□□ -1.34
CLVS1-209ENST00000522928 KRT82Q9NSB4 513 aa6.69□□□□□ -1.34
CLVS1-209ENST00000522928 ACTL7BQ9Y614 415 aa6.69□□□□□ -1.34
CLVS1-209ENST00000522928 SORBS3O60504 671 aa6.68□□□□□ -1.34
CLVS1-209ENST00000522928 BMP3P12645 472 aa6.68□□□□□ -1.34
CLVS1-209ENST00000522928 ST13P50502 369 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CLVS1-209ENST00000522928 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
CLVS1-209ENST00000522928 UVSSAQ2YD98 709 aa6.68□□□□□ -1.34
CLVS1-209ENST00000522928 SGO2Q562F6 1265 aa6.68□□□□□ -1.34
CLVS1-209ENST00000522928 PCNX4Q63HM2 1172 aa6.68□□□□□ -1.34
CLVS1-209ENST00000522928 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CLVS1-209ENST00000522928 GPBAR1Q8TDU6 330 aa6.68□□□□□ -1.34
CLVS1-209ENST00000522928 CRELD1Q96HD1 420 aa6.68□□□□□ -1.34
CLVS1-209ENST00000522928 DISC1Q9NRI5 854 aa6.68□□□□□ -1.34
CLVS1-209ENST00000522928 FAM105AQ9NUU6 356 aa6.68□□□□□ -1.34
CLVS1-209ENST00000522928 CRIM1Q9NZV1 1036 aa6.68□□□□□ -1.34
CLVS1-209ENST00000522928 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa6.67□□□□□ -1.34
CLVS1-209ENST00000522928 HMX2A2RU54 273 aa6.67□□□□□ -1.34
CLVS1-209ENST00000522928 TMPRSS2O15393 492 aa6.67□□□□□ -1.34
CLVS1-209ENST00000522928 NTF4P34130 210 aa6.67□□□□□ -1.34
CLVS1-209ENST00000522928 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
CLVS1-209ENST00000522928 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
CLVS1-209ENST00000522928 PRSS36Q5K4E3 855 aa6.67□□□□□ -1.34
CLVS1-209ENST00000522928 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
CLVS1-209ENST00000522928 FDX2Q6P4F2 183 aa6.67□□□□□ -1.34
CLVS1-209ENST00000522928 TRIM42Q8IWZ5 723 aa6.67□□□□□ -1.34
CLVS1-209ENST00000522928 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
CLVS1-209ENST00000522928 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
CLVS1-209ENST00000522928 GAL3ST3Q96A11 431 aa6.67□□□□□ -1.34
CLVS1-209ENST00000522928 C7orf69Q9H7B7 122 aa6.67□□□□□ -1.34
CLVS1-209ENST00000522928 CYP4F12Q9HCS2 524 aa6.67□□□□□ -1.34
CLVS1-209ENST00000522928 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
CLVS1-209ENST00000522928 UNCXA6NJT0 531 aa6.66□□□□□ -1.34
CLVS1-209ENST00000522928 CDK8P49336 464 aa6.66□□□□□ -1.34
CLVS1-209ENST00000522928 RING1Q06587 406 aa6.66□□□□□ -1.34
CLVS1-209ENST00000522928 PDE3AQ14432 1141 aa6.66□□□□□ -1.34
CLVS1-209ENST00000522928 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
CLVS1-209ENST00000522928 AKAP4Q5JQC9 854 aa6.66□□□□□ -1.34
CLVS1-209ENST00000522928 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa6.66□□□□□ -1.34
CLVS1-209ENST00000522928 FBLIM1Q8WUP2 373 aa6.66□□□□□ -1.34
CLVS1-209ENST00000522928 GATA6Q92908 595 aa6.66□□□□□ -1.34
CLVS1-209ENST00000522928 KCNB2Q92953 911 aa6.66□□□□□ -1.34
CLVS1-209ENST00000522928 ACSS3Q9H6R3 686 aa6.66□□□□□ -1.34
CLVS1-209ENST00000522928 RAXQ9Y2V3 346 aa6.66□□□□□ -1.34
CLVS1-209ENST00000522928 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa6.66□□□□□ -1.34
CLVS1-209ENST00000522928 DHX15O43143 795 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
CLVS1-209ENST00000522928 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
CLVS1-209ENST00000522928 NEFMP07197 916 aa6.65□□□□□ -1.34
CLVS1-209ENST00000522928 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
CLVS1-209ENST00000522928 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
CLVS1-209ENST00000522928 TTBK2Q6IQ55 1244 aa6.65□□□□□ -1.34
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CLVS1-209ENST00000522928 AGMOQ6ZNB7 445 aa6.65□□□□□ -1.34
CLVS1-209ENST00000522928 PHC3Q8NDX5 983 aa6.65□□□□□ -1.34
CLVS1-209ENST00000522928 FAM83CQ9BQN1 747 aa6.65□□□□□ -1.34
CLVS1-209ENST00000522928 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
CLVS1-209ENST00000522928 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa6.65□□□□□ -1.34
CLVS1-209ENST00000522928 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
CLVS1-209ENST00000522928 TLR6Q9Y2C9 796 aa6.65□□□□□ -1.34
CLVS1-209ENST00000522928 TRIM37O94972 964 aa6.64□□□□□ -1.35
CLVS1-209ENST00000522928 FSTP19883 344 aa6.64□□□□□ -1.35
CLVS1-209ENST00000522928 LIG3P49916 1009 aa6.64□□□□□ -1.35
CLVS1-209ENST00000522928 INPP5AQ14642 412 aa6.64□□□□□ -1.35
CLVS1-209ENST00000522928 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
CLVS1-209ENST00000522928 LLGL2Q6P1M3 1020 aa6.64□□□□□ -1.35
CLVS1-209ENST00000522928 BEND4Q6ZU67 534 aa6.64□□□□□ -1.35
CLVS1-209ENST00000522928 CLEC10AQ8IUN9 316 aa6.64□□□□□ -1.35
CLVS1-209ENST00000522928 FANCD2OSQ96PS1 177 aa6.64□□□□□ -1.35
CLVS1-209ENST00000522928 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa6.64□□□□□ -1.35
CLVS1-209ENST00000522928 SEMA6CQ9H3T2 930 aa6.64□□□□□ -1.35
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