RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516584.1

RNU6-1004P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1004, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1004P, Length 111 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PRR20AP86496 221 aa6.77□□□□□ -1.33
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZNF423Q2M1K9 1284 aa6.77□□□□□ -1.33
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
RNU6-1004P-201ENST00000516584 IFFO2Q5TF58 517 aa6.77□□□□□ -1.33
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CEP135Q66GS9 1140 aa6.77□□□□□ -1.33
RNU6-1004P-201ENST00000516584 POTEGQ6S5H5 508 aa6.77□□□□□ -1.33
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TTC6Q86TZ1 520 aa6.77□□□□□ -1.33
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FERMT3Q86UX7 667 aa6.77□□□□□ -1.33
RNU6-1004P-201ENST00000516584 JMYQ8N9B5 988 aa6.77□□□□□ -1.33
RNU6-1004P-201ENST00000516584 BSNDQ8WZ55 320 aa6.77□□□□□ -1.33
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ABHD17AQ96GS6 310 aa6.77□□□□□ -1.33
RNU6-1004P-201ENST00000516584 EHMT1Q9H9B1 1298 aa6.77□□□□□ -1.33
RNU6-1004P-201ENST00000516584 EFCC1Q9HA90 598 aa6.77□□□□□ -1.33
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FAN1Q9Y2M0 1017 aa6.77□□□□□ -1.33
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa6.76□□□□□ -1.33
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GPLD1P80108 840 aa6.76□□□□□ -1.33
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa6.76□□□□□ -1.33
RNU6-1004P-201ENST00000516584 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa6.76□□□□□ -1.33
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FMNL3Q8IVF7 1028 aa6.76□□□□□ -1.33
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
RNU6-1004P-201ENST00000516584 IER2Q9BTL4 223 aa6.76□□□□□ -1.33
RNU6-1004P-201ENST00000516584 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa6.76□□□□□ -1.33
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RBSNQ9H1K0 784 aa6.76□□□□□ -1.33
RNU6-1004P-201ENST00000516584 HOMER2Q9NSB8 354 aa6.76□□□□□ -1.33
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP6.75□□□□□ -1.33
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
RNU6-1004P-201ENST00000516584 B3GALT4O96024 378 aa6.75□□□□□ -1.33
RNU6-1004P-201ENST00000516584 VIL1P09327 827 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
RNU6-1004P-201ENST00000516584 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NEUROD1Q13562 356 aa6.75□□□□□ -1.33
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP6.75□□□□□ -1.33
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ODR4Q5SWX8 454 aa6.75□□□□□ -1.33
RNU6-1004P-201ENST00000516584 KRT26Q7Z3Y9 468 aa6.75□□□□□ -1.33
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TRIM46Q7Z4K8 759 aa6.75□□□□□ -1.33
RNU6-1004P-201ENST00000516584 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZFP42Q96MM3 310 aa6.75□□□□□ -1.33
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CEP89Q96ST8 783 aa6.75□□□□□ -1.33
RNU6-1004P-201ENST00000516584 A0A0G2JS52 829 aa6.74□□□□□ -1.33
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ATE1O95260 518 aa6.74□□□□□ -1.33
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FAM153BP0C7A2 387 aa6.74□□□□□ -1.33
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GUCY2CP25092 1073 aa6.74□□□□□ -1.33
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CDK8P49336 464 aa6.74□□□□□ -1.33
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa6.74□□□□□ -1.33
RNU6-1004P-201ENST00000516584 VN1R5Q7Z5H4 357 aa6.74□□□□□ -1.33
RNU6-1004P-201ENST00000516584 JAMLQ86YT9 394 aa6.74□□□□□ -1.33
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SYNPOQ8N3V7 929 aa6.74□□□□□ -1.33
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa6.74□□□□□ -1.33
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa6.74□□□□□ -1.33
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NDFIP2Q9NV92 336 aa6.74□□□□□ -1.33
RNU6-1004P-201ENST00000516584 UPK3BL1B0FP48 263 aa6.73□□□□□ -1.33
RNU6-1004P-201ENST00000516584 UPK3BL2E5RIL1 263 aa6.73□□□□□ -1.33
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa6.73□□□□□ -1.33
RNU6-1004P-201ENST00000516584 EEPD1Q7L9B9 569 aa6.73□□□□□ -1.33
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MICALL1Q8N3F8 863 aa6.73□□□□□ -1.33
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PSMD1Q99460 953 aa6.73□□□□□ -1.33
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TM9SF2Q99805 663 aa6.73□□□□□ -1.33
RNU6-1004P-201ENST00000516584 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
RNU6-1004P-201ENST00000516584 LACRTQ9GZZ8 138 aa6.73□□□□□ -1.33
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GABBR1Q9UBS5 961 aa6.73□□□□□ -1.33
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PLAAQ9Y263 795 aa6.73□□□□□ -1.33
RNU6-1004P-201ENST00000516584 H7C1W4 665 aa6.72□□□□□ -1.33
RNU6-1004P-201ENST00000516584 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MAN1A2O60476 641 aa6.72□□□□□ -1.33
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CPB1P15086 417 aa6.72□□□□□ -1.33
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PTPRAP18433 802 aa6.72□□□□□ -1.33
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DBN1Q16643 649 aa6.72□□□□□ -1.33
RNU6-1004P-201ENST00000516584 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TMEM67Q5HYA8 995 aa6.72□□□□□ -1.33
RNU6-1004P-201ENST00000516584 VHLLQ6RSH7 139 aa6.72□□□□□ -1.33
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TMEM40Q8WWA1 233 aa6.72□□□□□ -1.33
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MFSD3Q96ES6 412 aa6.72□□□□□ -1.33
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SPATA9Q9BWV2 254 aa6.72□□□□□ -1.33
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SOX13Q9UN79 622 aa6.72□□□□□ -1.33
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa6.72□□□□□ -1.33
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa6.72□□□□□ -1.33
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa6.71□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FAM86C2PA6NEL3 165 aa6.71□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MEIS3P2A8K0S8 358 aa6.71□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PEX14O75381 377 aa6.71□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 HTR3BO95264 441 aa6.71□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 HGSNATQ68CP4 663 aa6.71□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FAM35AQ86V20 835 aa6.71□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NIM1KQ8IY84 436 aa6.71□□□□□ -1.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CHAC2Q8WUX2 184 aa6.71□□□□□ -1.34
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