RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514141.5

POLK-215, Transcript of DNA polymerase kappa, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene POLK, Length 4,345 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLK-215ENST00000514141 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
POLK-215ENST00000514141 PLCB2Q00722 1185 aa6.7□□□□□ -1.34
POLK-215ENST00000514141 CETN1Q12798 172 aa6.7□□□□□ -1.34
POLK-215ENST00000514141 SLC10A5Q5PT55 438 aa6.7□□□□□ -1.34
POLK-215ENST00000514141 VPS36Q86VN1 386 aa6.7□□□□□ -1.34
POLK-215ENST00000514141 PPFIBP1Q86W92 1011 aa6.7□□□□□ -1.34
POLK-215ENST00000514141 EXOC8Q8IYI6 725 aa6.7□□□□□ -1.34
POLK-215ENST00000514141 TIGD1Q96MW7 591 aa6.7□□□□□ -1.34
POLK-215ENST00000514141 H0YCG3 227 aa6.7□□□□□ -1.34
POLK-215ENST00000514141 CYP27B1O15528 508 aa6.7□□□□□ -1.34
POLK-215ENST00000514141 KIF4AO95239 1232 aa6.7□□□□□ -1.34
POLK-215ENST00000514141 POTEJP0CG39 1038 aa6.7□□□□□ -1.34
POLK-215ENST00000514141 CRKLP46109 303 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
POLK-215ENST00000514141 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
POLK-215ENST00000514141 DCAF15Q66K64 600 aa6.7□□□□□ -1.34
POLK-215ENST00000514141 KRT27Q7Z3Y8 459 aa6.7□□□□□ -1.34
POLK-215ENST00000514141 SPEF2Q9C093 1822 aa6.7□□□□□ -1.34
POLK-215ENST00000514141 TRIM75PA6NK02 468 aa6.7□□□□□ -1.34
POLK-215ENST00000514141 C6orf229H3BNL8 230 aa6.7□□□□□ -1.34
POLK-215ENST00000514141 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
POLK-215ENST00000514141 KRT2P35908 639 aa6.7□□□□□ -1.34
POLK-215ENST00000514141 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
POLK-215ENST00000514141 GRAPQ13588 217 aa6.7□□□□□ -1.34
POLK-215ENST00000514141 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa6.7□□□□□ -1.34
POLK-215ENST00000514141 LRSAM1Q6UWE0 723 aa6.7□□□□□ -1.34
POLK-215ENST00000514141 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
POLK-215ENST00000514141 JDP2Q8WYK2 163 aa6.7□□□□□ -1.34
POLK-215ENST00000514141 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
POLK-215ENST00000514141 AS3MTQ9HBK9 375 aa6.7□□□□□ -1.34
POLK-215ENST00000514141 A0A1W2PQ27 194 aa6.69□□□□□ -1.34
POLK-215ENST00000514141 A0A1W2PQ64 194 aa6.69□□□□□ -1.34
POLK-215ENST00000514141 A0A1W2PQD8 194 aa6.69□□□□□ -1.34
POLK-215ENST00000514141 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
POLK-215ENST00000514141 CSF1RP07333 972 aa6.69□□□□□ -1.34
POLK-215ENST00000514141 TSPY3P0CV98 308 aa6.69□□□□□ -1.34
POLK-215ENST00000514141 TSPY8P0CW00 308 aa6.69□□□□□ -1.34
POLK-215ENST00000514141 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
POLK-215ENST00000514141 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
POLK-215ENST00000514141 EPS15P42566 896 aa6.69□□□□□ -1.34
POLK-215ENST00000514141 ZNF445P59923 1031 aa6.69□□□□□ -1.34
POLK-215ENST00000514141 SEPT2Q15019 361 aa6.69□□□□□ -1.34
POLK-215ENST00000514141 AKNAD1Q5T1N1 836 aa6.69□□□□□ -1.34
POLK-215ENST00000514141 FCHSD1Q86WN1 690 aa6.69□□□□□ -1.34
POLK-215ENST00000514141 FBXL16Q8N461 479 aa6.69□□□□□ -1.34
POLK-215ENST00000514141 TMEM87AQ8NBN3 555 aa6.69□□□□□ -1.34
POLK-215ENST00000514141 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP6.69□□□□□ -1.344e-7■□□□□ 8.7
POLK-215ENST00000514141 NDC80O14777 642 aa6.69□□□□□ -1.34
POLK-215ENST00000514141 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
POLK-215ENST00000514141 NLRP5P59047 1200 aa6.69□□□□□ -1.34
POLK-215ENST00000514141 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP6.69□□□□□ -1.34
POLK-215ENST00000514141 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
POLK-215ENST00000514141 FKBP15Q5T1M5 1219 aa6.69□□□□□ -1.34
POLK-215ENST00000514141 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
POLK-215ENST00000514141 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
POLK-215ENST00000514141 SNRKQ9NRH2 765 aa6.69□□□□□ -1.34
POLK-215ENST00000514141 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
POLK-215ENST00000514141 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa6.69□□□□□ -1.34
POLK-215ENST00000514141 RIC1Q4ADV7 1423 aa6.69□□□□□ -1.34
POLK-215ENST00000514141 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa6.69□□□□□ -1.34
POLK-215ENST00000514141 GPTP24298 496 aa6.69□□□□□ -1.34
POLK-215ENST00000514141 TERF1P54274 439 aa6.69□□□□□ -1.34
POLK-215ENST00000514141 PPP2R3AQ06190 1150 aa6.69□□□□□ -1.34
POLK-215ENST00000514141 FAM81BQ96LP2 452 aa6.69□□□□□ -1.34
POLK-215ENST00000514141 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
POLK-215ENST00000514141 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
POLK-215ENST00000514141 BCL9O00512 1426 aa6.69□□□□□ -1.34
POLK-215ENST00000514141 ASPRV1Q53RT3 343 aa6.69□□□□□ -1.34
POLK-215ENST00000514141 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
POLK-215ENST00000514141 FAM200AQ8TCP9 573 aa6.69□□□□□ -1.34
POLK-215ENST00000514141 IWS1Q96ST2 819 aa6.69□□□□□ -1.34
POLK-215ENST00000514141 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
POLK-215ENST00000514141 SNX14Q9Y5W7 946 aa6.69□□□□□ -1.34
POLK-215ENST00000514141 ADCY9O60503 1353 aa6.68□□□□□ -1.34
POLK-215ENST00000514141 RXRBP28702 533 aa6.68□□□□□ -1.34
POLK-215ENST00000514141 PRPHP41219 470 aa6.68□□□□□ -1.34
POLK-215ENST00000514141 SMYD5Q6GMV2 418 aa6.68□□□□□ -1.34
POLK-215ENST00000514141 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
POLK-215ENST00000514141 CABLES1Q8TDN4 633 aa6.68□□□□□ -1.34
POLK-215ENST00000514141 FBXW7Q969H0 707 aa6.68□□□□□ -1.34
POLK-215ENST00000514141 AK8Q96MA6 479 aa6.68□□□□□ -1.34
POLK-215ENST00000514141 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
POLK-215ENST00000514141 RGPD1P0DJD0 1748 aa6.68□□□□□ -1.34
POLK-215ENST00000514141 EIF5P55010 431 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
POLK-215ENST00000514141 HAUS3Q68CZ6 603 aa6.68□□□□□ -1.34
POLK-215ENST00000514141 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
POLK-215ENST00000514141 ZNF34Q8IZ26 560 aa6.68□□□□□ -1.34
POLK-215ENST00000514141 NUP133Q8WUM0 1156 aa6.68□□□□□ -1.34
POLK-215ENST00000514141 ALG1Q9BT22 464 aa6.68□□□□□ -1.34
POLK-215ENST00000514141 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa6.68□□□□□ -1.34
POLK-215ENST00000514141 IMPACTQ9P2X3 320 aa6.68□□□□□ -1.34
POLK-215ENST00000514141 ALS2Q96Q42 1657 aa6.68□□□□□ -1.34
POLK-215ENST00000514141 GPAA1O43292 621 aa6.68□□□□□ -1.34
POLK-215ENST00000514141 BRD1O95696 1058 aa6.68□□□□□ -1.34
POLK-215ENST00000514141 CETN2P41208 172 aa6.68□□□□□ -1.34
POLK-215ENST00000514141 IKQ13123 557 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
POLK-215ENST00000514141 BICDL1Q6ZP65 573 aa6.68□□□□□ -1.34
POLK-215ENST00000514141 MPNDQ8N594 471 aa6.68□□□□□ -1.34
POLK-215ENST00000514141 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
POLK-215ENST00000514141 GTF3C6Q969F1 213 aa6.68□□□□□ -1.34
POLK-215ENST00000514141 LTN1O94822 1766 aa6.68□□□□□ -1.34
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