RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511412.1

ALYREF-203, Transcript of Aly/REF export factor, humanhuman

TSL 3

Gene ALYREF, Length 533 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREF-203ENST00000511412 ZBTB22O15209 634 aa30.58■■■□□ 2.49
ALYREF-203ENST00000511412 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP30.58■■■□□ 2.49
ALYREF-203ENST00000511412 MS4A4AQ96JQ5 239 aa30.58■■■□□ 2.49
ALYREF-203ENST00000511412 SPDYE5A6NIY4 337 aa30.57■■■□□ 2.48
ALYREF-203ENST00000511412 GTF2A2P52657 109 aa30.57■■■□□ 2.48
ALYREF-203ENST00000511412 FAM151AQ8WW52 585 aa30.57■■■□□ 2.48
ALYREF-203ENST00000511412 CLUAP1Q96AJ1 413 aa30.57■■■□□ 2.48
ALYREF-203ENST00000511412 AKAP2Q9Y2D5 859 aa30.57■■■□□ 2.48
ALYREF-203ENST00000511412 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa30.57■■■□□ 2.48
ALYREF-203ENST00000511412 A0A1B0GUL7 405 aa30.56■■■□□ 2.48
ALYREF-203ENST00000511412 GNAI2P04899 355 aa30.56■■■□□ 2.48
ALYREF-203ENST00000511412 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa30.56■■■□□ 2.48
ALYREF-203ENST00000511412 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP30.55■■■□□ 2.48
ALYREF-203ENST00000511412 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa30.55■■■□□ 2.48
ALYREF-203ENST00000511412 TIMM10P62072 90 aa30.55■■■□□ 2.48
ALYREF-203ENST00000511412 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP30.55■■■□□ 2.48
ALYREF-203ENST00000511412 TFCP2Q12800 502 aa30.55■■■□□ 2.48
ALYREF-203ENST00000511412 RASGRF1Q13972 1273 aa30.55■■■□□ 2.48
ALYREF-203ENST00000511412 CCL15Q16663 113 aa30.55■■■□□ 2.48
ALYREF-203ENST00000511412 BRI3BPQ8WY22 251 aa30.55■■■□□ 2.48
ALYREF-203ENST00000511412 TRIM17Q9Y577 477 aa30.55■■■□□ 2.48
ALYREF-203ENST00000511412 MYH2Q9UKX2 1941 aa30.55■■■□□ 2.48
ALYREF-203ENST00000511412 ERO1BQ86YB8 467 aa30.54■■■□□ 2.48
ALYREF-203ENST00000511412 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP30.54■■■□□ 2.48
ALYREF-203ENST00000511412 ERO1AQ96HE7 468 aa30.54■■■□□ 2.48
ALYREF-203ENST00000511412 ZNF341Q9BYN7 854 aa30.54■■■□□ 2.48
ALYREF-203ENST00000511412 AK9Q5TCS8 1911 aa30.53■■■□□ 2.48
ALYREF-203ENST00000511412 TCP10Q12799 353 aa30.53■■■□□ 2.48
ALYREF-203ENST00000511412 NFIAQ12857 509 aa30.53■■■□□ 2.48
ALYREF-203ENST00000511412 MVPQ14764 893 aaKnown RBP30.53■■■□□ 2.48
ALYREF-203ENST00000511412 XAGE2Q96GT9 111 aa30.53■■■□□ 2.48
ALYREF-203ENST00000511412 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa30.52■■■□□ 2.48
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ALYREF-203ENST00000511412 USP40Q9NVE5 1235 aa30.52■■■□□ 2.48
ALYREF-203ENST00000511412 DOCK2Q92608 1830 aa30.52■■■□□ 2.48
ALYREF-203ENST00000511412 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP30.51■■■□□ 2.47
ALYREF-203ENST00000511412 MIGA2Q7L4E1 593 aa30.51■■■□□ 2.47
ALYREF-203ENST00000511412 OTOP1Q7RTM1 612 aa30.51■■■□□ 2.47
ALYREF-203ENST00000511412 MIER1Q8N108 512 aa30.51■■■□□ 2.47
ALYREF-203ENST00000511412 ABCF2Q9UG63 623 aa30.51■■■□□ 2.47
ALYREF-203ENST00000511412 TMEM57Q8N5G2 664 aa30.5■■■□□ 2.47
ALYREF-203ENST00000511412 CD99L2Q8TCZ2 262 aa30.5■■■□□ 2.47
ALYREF-203ENST00000511412 FAM198AQ9UFP1 575 aa30.5■■■□□ 2.47
ALYREF-203ENST00000511412 GAKO14976 1311 aa30.49■■■□□ 2.47
ALYREF-203ENST00000511412 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa30.49■■■□□ 2.47
ALYREF-203ENST00000511412 CETPP11597 493 aa30.49■■■□□ 2.47
ALYREF-203ENST00000511412 SP3Q02447 781 aa30.49■■■□□ 2.47
ALYREF-203ENST00000511412 PPIL2Q13356 520 aa30.49■■■□□ 2.47
ALYREF-203ENST00000511412 NEUROD6Q96NK8 337 aa30.49■■■□□ 2.47
ALYREF-203ENST00000511412 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa30.49■■■□□ 2.47
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ALYREF-203ENST00000511412 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP30.48■■■□□ 2.47
ALYREF-203ENST00000511412 SLF2Q8IX21 1173 aa30.48■■■□□ 2.47
ALYREF-203ENST00000511412 FAM43AQ8N2R8 423 aa30.48■■■□□ 2.47
ALYREF-203ENST00000511412 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP30.48■■■□□ 2.47
ALYREF-203ENST00000511412 IRF6O14896 467 aa30.47■■■□□ 2.47
ALYREF-203ENST00000511412 INPP5BP32019 993 aa30.47■■■□□ 2.47
ALYREF-203ENST00000511412 SNAPC2Q13487 334 aa30.47■■■□□ 2.47
ALYREF-203ENST00000511412 RFX7Q2KHR2 1363 aa30.46■■■□□ 2.47
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ALYREF-203ENST00000511412 IDI2Q9BXS1 227 aa30.45■■■□□ 2.47
ALYREF-203ENST00000511412 EFCC1Q9HA90 598 aa30.45■■■□□ 2.47
ALYREF-203ENST00000511412 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP30.45■■■□□ 2.47
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ALYREF-203ENST00000511412 RGS3P49796 1198 aa30.44■■■□□ 2.46
ALYREF-203ENST00000511412 ERICH6Q7L0X2 663 aa30.44■■■□□ 2.46
ALYREF-203ENST00000511412 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP30.44■■■□□ 2.46
ALYREF-203ENST00000511412 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa30.44■■■□□ 2.46
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ALYREF-203ENST00000511412 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP30.43■■■□□ 2.46
ALYREF-203ENST00000511412 PTPN22Q9Y2R2 807 aa30.43■■■□□ 2.46
ALYREF-203ENST00000511412 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP30.42■■■□□ 2.46
ALYREF-203ENST00000511412 ATRNL1Q5VV63 1379 aa30.42■■■□□ 2.46
ALYREF-203ENST00000511412 BTBD19C9JJ37 291 aa30.42■■■□□ 2.46
ALYREF-203ENST00000511412 BTDP43251 543 aa30.42■■■□□ 2.46
ALYREF-203ENST00000511412 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP30.42■■■□□ 2.46
ALYREF-203ENST00000511412 ZFPM1Q8IX07 1006 aa30.42■■■□□ 2.46
ALYREF-203ENST00000511412 HMG20BQ9P0W2 317 aa30.42■■■□□ 2.46
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ALYREF-203ENST00000511412 SPATA5Q8NB90 893 aa30.41■■■□□ 2.46
ALYREF-203ENST00000511412 HTTP42858 3142 aa30.41■■■□□ 2.46
ALYREF-203ENST00000511412 PI16Q6UXB8 463 aa30.4■■■□□ 2.46
ALYREF-203ENST00000511412 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP30.4■■■□□ 2.46
ALYREF-203ENST00000511412 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP30.4■■■□□ 2.46
ALYREF-203ENST00000511412 POLA2Q14181 598 aa30.39■■■□□ 2.46
ALYREF-203ENST00000511412 ARHGEF6Q15052 776 aa30.39■■■□□ 2.46
ALYREF-203ENST00000511412 TLR2O60603 784 aa30.38■■■□□ 2.45
ALYREF-203ENST00000511412 CAP1Q01518 475 aa30.38■■■□□ 2.45
ALYREF-203ENST00000511412 PICALMQ13492 652 aa30.38■■■□□ 2.45
ALYREF-203ENST00000511412 ITPRIPQ8IWB1 547 aa30.38■■■□□ 2.45
ALYREF-203ENST00000511412 KCNH4Q9UQ05 1017 aa30.38■■■□□ 2.45
ALYREF-203ENST00000511412 MAST2Q6P0Q8 1798 aa30.38■■■□□ 2.45
ALYREF-203ENST00000511412 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa30.37■■■□□ 2.45
ALYREF-203ENST00000511412 GSTO1P78417 241 aa30.37■■■□□ 2.45
ALYREF-203ENST00000511412 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP30.37■■■□□ 2.45
ALYREF-203ENST00000511412 SSH3Q8TE77 659 aa30.37■■■□□ 2.45
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