RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504994.1

HERC3-209, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 341 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-209ENST00000504994 DDAH1O94760 285 aa6.89□□□□□ -1.31
HERC3-209ENST00000504994 ASMTLO95671 621 aa6.89□□□□□ -1.31
HERC3-209ENST00000504994 VIL1P09327 827 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
HERC3-209ENST00000504994 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
HERC3-209ENST00000504994 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
HERC3-209ENST00000504994 ZNF423Q2M1K9 1284 aa6.89□□□□□ -1.31
HERC3-209ENST00000504994 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
HERC3-209ENST00000504994 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa6.89□□□□□ -1.31
HERC3-209ENST00000504994 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
HERC3-209ENST00000504994 CERS3Q8IU89 383 aa6.89□□□□□ -1.31
HERC3-209ENST00000504994 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
HERC3-209ENST00000504994 BSNDQ8WZ55 320 aa6.89□□□□□ -1.31
HERC3-209ENST00000504994 ABHD17AQ96GS6 310 aa6.89□□□□□ -1.31
HERC3-209ENST00000504994 ZFP42Q96MM3 310 aa6.89□□□□□ -1.31
HERC3-209ENST00000504994 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
HERC3-209ENST00000504994 CBX8Q9HC52 389 aa6.89□□□□□ -1.31
HERC3-209ENST00000504994 ZMYM5Q9UJ78 669 aa6.89□□□□□ -1.31
HERC3-209ENST00000504994 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa6.88□□□□□ -1.31
HERC3-209ENST00000504994 LRRC14Q15048 493 aa6.88□□□□□ -1.31
HERC3-209ENST00000504994 TCEA2Q15560 299 aa6.88□□□□□ -1.31
HERC3-209ENST00000504994 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa6.88□□□□□ -1.31
HERC3-209ENST00000504994 TAF7LQ5H9L4 462 aa6.88□□□□□ -1.31
HERC3-209ENST00000504994 VN1R5Q7Z5H4 357 aa6.88□□□□□ -1.31
HERC3-209ENST00000504994 TTC6Q86TZ1 520 aa6.88□□□□□ -1.31
HERC3-209ENST00000504994 FAM178BQ8IXR5 827 aa6.88□□□□□ -1.31
HERC3-209ENST00000504994 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
HERC3-209ENST00000504994 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
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HERC3-209ENST00000504994 SELPP16109 830 aa6.87□□□□□ -1.31
HERC3-209ENST00000504994 ARNTP27540 789 aa6.87□□□□□ -1.31
HERC3-209ENST00000504994 CDK8P49336 464 aa6.87□□□□□ -1.31
HERC3-209ENST00000504994 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP6.87□□□□□ -1.31
HERC3-209ENST00000504994 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
HERC3-209ENST00000504994 IER2Q9BTL4 223 aa6.87□□□□□ -1.31
HERC3-209ENST00000504994 SOX13Q9UN79 622 aa6.87□□□□□ -1.31
HERC3-209ENST00000504994 FAN1Q9Y2M0 1017 aa6.87□□□□□ -1.31
HERC3-209ENST00000504994 MEIS3P2A8K0S8 358 aa6.86□□□□□ -1.31
HERC3-209ENST00000504994 GHRHP01286 108 aa6.86□□□□□ -1.31
HERC3-209ENST00000504994 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
HERC3-209ENST00000504994 GUCY2CP25092 1073 aa6.86□□□□□ -1.31
HERC3-209ENST00000504994 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
HERC3-209ENST00000504994 DBN1Q16643 649 aa6.86□□□□□ -1.31
HERC3-209ENST00000504994 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa6.86□□□□□ -1.31
HERC3-209ENST00000504994 CEP135Q66GS9 1140 aa6.86□□□□□ -1.31
HERC3-209ENST00000504994 KRT26Q7Z3Y9 468 aa6.86□□□□□ -1.31
HERC3-209ENST00000504994 PDZD3Q86UT5 571 aa6.86□□□□□ -1.31
HERC3-209ENST00000504994 JAMLQ86YT9 394 aa6.86□□□□□ -1.31
HERC3-209ENST00000504994 JDP2Q8WYK2 163 aa6.86□□□□□ -1.31
HERC3-209ENST00000504994 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP6.85□□□□□ -1.31
HERC3-209ENST00000504994 FAM153BP0C7A2 387 aa6.85□□□□□ -1.31
HERC3-209ENST00000504994 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
HERC3-209ENST00000504994 EVA1CP58658 441 aa6.85□□□□□ -1.31
HERC3-209ENST00000504994 ODR4Q5SWX8 454 aa6.85□□□□□ -1.31
HERC3-209ENST00000504994 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
HERC3-209ENST00000504994 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa6.85□□□□□ -1.31
HERC3-209ENST00000504994 IGFLR1Q9H665 355 aa6.85□□□□□ -1.31
HERC3-209ENST00000504994 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
HERC3-209ENST00000504994 PLAAQ9Y263 795 aa6.85□□□□□ -1.31
HERC3-209ENST00000504994 SLC35F4A4IF30 521 aa6.84□□□□□ -1.31
HERC3-209ENST00000504994 SOBPA7XYQ1 873 aa6.84□□□□□ -1.31
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HERC3-209ENST00000504994 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
HERC3-209ENST00000504994 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa6.84□□□□□ -1.31
HERC3-209ENST00000504994 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
HERC3-209ENST00000504994 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
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HERC3-209ENST00000504994 FERMT3Q86UX7 667 aa6.84□□□□□ -1.31
HERC3-209ENST00000504994 THNSL2Q86YJ6 484 aa6.84□□□□□ -1.31
HERC3-209ENST00000504994 FMNL3Q8IVF7 1028 aa6.84□□□□□ -1.31
HERC3-209ENST00000504994 SYNPOQ8N3V7 929 aa6.84□□□□□ -1.31
HERC3-209ENST00000504994 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa6.84□□□□□ -1.31
HERC3-209ENST00000504994 TMEM40Q8WWA1 233 aa6.84□□□□□ -1.31
HERC3-209ENST00000504994 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
HERC3-209ENST00000504994 TM9SF2Q99805 663 aa6.84□□□□□ -1.31
HERC3-209ENST00000504994 KCNQ2O43526 872 aa6.83□□□□□ -1.32
HERC3-209ENST00000504994 ADCY3O60266 1144 aa6.83□□□□□ -1.32
HERC3-209ENST00000504994 HTR3BO95264 441 aa6.83□□□□□ -1.32
HERC3-209ENST00000504994 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
HERC3-209ENST00000504994 ACRP10323 421 aa6.83□□□□□ -1.32
HERC3-209ENST00000504994 PTSQ03393 145 aa6.83□□□□□ -1.32
HERC3-209ENST00000504994 TM4SF20Q53R12 229 aa6.83□□□□□ -1.32
HERC3-209ENST00000504994 TMEM67Q5HYA8 995 aa6.83□□□□□ -1.32
HERC3-209ENST00000504994 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa6.83□□□□□ -1.32
HERC3-209ENST00000504994 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
HERC3-209ENST00000504994 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
HERC3-209ENST00000504994 RBSNQ9H1K0 784 aa6.83□□□□□ -1.32
HERC3-209ENST00000504994 HOMER2Q9NSB8 354 aa6.83□□□□□ -1.32
HERC3-209ENST00000504994 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa6.83□□□□□ -1.32
HERC3-209ENST00000504994 NAGPAQ9UK23 515 aa6.83□□□□□ -1.32
HERC3-209ENST00000504994 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
HERC3-209ENST00000504994 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
HERC3-209ENST00000504994 CORINQ9Y5Q5 1042 aa6.83□□□□□ -1.32
HERC3-209ENST00000504994 PRR36Q9H6K5 1346 aa6.82□□□□□ -1.32
HERC3-209ENST00000504994 LTBP3Q9NS15 1303 aa6.82□□□□□ -1.32
HERC3-209ENST00000504994 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa6.82□□□□□ -1.32
HERC3-209ENST00000504994 H7C1W4 665 aa6.82□□□□□ -1.32
HERC3-209ENST00000504994 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
HERC3-209ENST00000504994 MAN1A2O60476 641 aa6.82□□□□□ -1.32
HERC3-209ENST00000504994 PTPRAP18433 802 aa6.82□□□□□ -1.32
HERC3-209ENST00000504994 FGFR3P22607 806 aa6.82□□□□□ -1.32
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