RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504927.5

DDR1-255, Transcript of discoidin domain receptor tyrosine kinase 1, humanhuman

TSL 4

Gene DDR1, Length 542 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1-255ENST00000504927 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
DDR1-255ENST00000504927 ATP5JP18859 108 aa25.19■■□□□ 1.62
DDR1-255ENST00000504927 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
DDR1-255ENST00000504927 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
DDR1-255ENST00000504927 ARMC9Q7Z3E5 817 aa25.19■■□□□ 1.62
DDR1-255ENST00000504927 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
DDR1-255ENST00000504927 ECM29Q5VYK3 1845 aa25.19■■□□□ 1.62
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DDR1-255ENST00000504927 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
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DDR1-255ENST00000504927 ZIC5Q96T25 663 aa25.07■■□□□ 1.6
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DDR1-255ENST00000504927 PDE6AP16499 860 aa25.05■■□□□ 1.6
DDR1-255ENST00000504927 PICALMQ13492 652 aa25.05■■□□□ 1.6
DDR1-255ENST00000504927 RASAL3Q86YV0 1011 aa25.05■■□□□ 1.6
DDR1-255ENST00000504927 ZFPM1Q8IX07 1006 aa25.05■■□□□ 1.6
DDR1-255ENST00000504927 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
DDR1-255ENST00000504927 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
DDR1-255ENST00000504927 RFX7Q2KHR2 1363 aa25.05■■□□□ 1.6
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