RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498648.5

STRADB-210, Transcript of STE20-related kinase adaptor beta, humanhuman

TSL 3

Gene STRADB, Length 535 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADB-210ENST00000498648 OSMRQ99650 979 aa6.36□□□□□ -1.39
STRADB-210ENST00000498648 ZNF700Q9H0M5 742 aa6.36□□□□□ -1.39
STRADB-210ENST00000498648 CHST12Q9NRB3 414 aa6.36□□□□□ -1.39
STRADB-210ENST00000498648 WNT7AO00755 349 aa6.35□□□□□ -1.39
STRADB-210ENST00000498648 KIF4AO95239 1232 aa6.35□□□□□ -1.39
STRADB-210ENST00000498648 LONRF3Q496Y0 759 aa6.35□□□□□ -1.39
STRADB-210ENST00000498648 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa6.35□□□□□ -1.39
STRADB-210ENST00000498648 RASIP1Q5U651 963 aa6.35□□□□□ -1.39
STRADB-210ENST00000498648 HGSNATQ68CP4 663 aa6.35□□□□□ -1.39
STRADB-210ENST00000498648 TTC6Q86TZ1 520 aa6.35□□□□□ -1.39
STRADB-210ENST00000498648 ATL2Q8NHH9 583 aa6.35□□□□□ -1.39
STRADB-210ENST00000498648 RIN3Q8TB24 985 aa6.35□□□□□ -1.39
STRADB-210ENST00000498648 OTUD5Q96G74 571 aa6.35□□□□□ -1.39
STRADB-210ENST00000498648 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
STRADB-210ENST00000498648 ZNF576Q9H609 170 aa6.35□□□□□ -1.39
STRADB-210ENST00000498648 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
STRADB-210ENST00000498648 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa6.35□□□□□ -1.39
STRADB-210ENST00000498648 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
STRADB-210ENST00000498648 AKAP10O43572 662 aa6.34□□□□□ -1.39
STRADB-210ENST00000498648 MMP20O60882 483 aa6.34□□□□□ -1.39
STRADB-210ENST00000498648 KATNA1O75449 491 aa6.34□□□□□ -1.39
STRADB-210ENST00000498648 SASH3O75995 380 aa6.34□□□□□ -1.39
STRADB-210ENST00000498648 ATE1O95260 518 aa6.34□□□□□ -1.39
STRADB-210ENST00000498648 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
STRADB-210ENST00000498648 BPNT1O95861 308 aa6.34□□□□□ -1.39
STRADB-210ENST00000498648 ACPPP15309 386 aa6.34□□□□□ -1.39
STRADB-210ENST00000498648 GUCY2CP25092 1073 aa6.34□□□□□ -1.39
STRADB-210ENST00000498648 GGCXP38435 758 aa6.34□□□□□ -1.39
STRADB-210ENST00000498648 RAB27AP51159 221 aa6.34□□□□□ -1.39
STRADB-210ENST00000498648 NEK2P51955 445 aa6.34□□□□□ -1.39
STRADB-210ENST00000498648 BRD3Q15059 726 aa6.34□□□□□ -1.39
STRADB-210ENST00000498648 SPRED3Q2MJR0 410 aa6.34□□□□□ -1.39
STRADB-210ENST00000498648 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
STRADB-210ENST00000498648 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
STRADB-210ENST00000498648 PPP4R4Q6NUP7 873 aa6.34□□□□□ -1.39
STRADB-210ENST00000498648 CHPFQ8IZ52 775 aa6.34□□□□□ -1.39
STRADB-210ENST00000498648 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
STRADB-210ENST00000498648 TTC8Q8TAM2 541 aa6.34□□□□□ -1.39
STRADB-210ENST00000498648 KIF2CQ99661 725 aa6.34□□□□□ -1.39
STRADB-210ENST00000498648 TM9SF2Q99805 663 aa6.34□□□□□ -1.39
STRADB-210ENST00000498648 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
STRADB-210ENST00000498648 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
STRADB-210ENST00000498648 ZFAND3Q9H8U3 227 aa6.34□□□□□ -1.39
STRADB-210ENST00000498648 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
STRADB-210ENST00000498648 ZIM2Q9NZV7 527 aa6.34□□□□□ -1.39
STRADB-210ENST00000498648 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
STRADB-210ENST00000498648 A0A096LPE4 126 aa6.33□□□□□ -1.4
STRADB-210ENST00000498648 A0A1W2PPZ6 126 aa6.33□□□□□ -1.4
STRADB-210ENST00000498648 CCDC189A1A4V9 331 aa6.33□□□□□ -1.4
STRADB-210ENST00000498648 MEIS3P2A8K0S8 358 aa6.33□□□□□ -1.4
STRADB-210ENST00000498648 METTL12A8MUP2 240 aa6.33□□□□□ -1.4
STRADB-210ENST00000498648 PLD2O14939 933 aa6.33□□□□□ -1.4
STRADB-210ENST00000498648 EYA4O95677 639 aa6.33□□□□□ -1.4
STRADB-210ENST00000498648 BMP6P22004 513 aa6.33□□□□□ -1.4
STRADB-210ENST00000498648 PTPN5P54829 565 aa6.33□□□□□ -1.4
STRADB-210ENST00000498648 SLC10A6Q3KNW5 377 aa6.33□□□□□ -1.4
STRADB-210ENST00000498648 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
STRADB-210ENST00000498648 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
STRADB-210ENST00000498648 GAL3ST3Q96A11 431 aa6.33□□□□□ -1.4
STRADB-210ENST00000498648 EPN3Q9H201 632 aa6.33□□□□□ -1.4
STRADB-210ENST00000498648 BRD7Q9NPI1 651 aa6.33□□□□□ -1.4
STRADB-210ENST00000498648 TMEM39AQ9NV64 488 aa6.33□□□□□ -1.4
STRADB-210ENST00000498648 PNMA2Q9UL42 364 aa6.33□□□□□ -1.4
STRADB-210ENST00000498648 CYP8B1Q9UNU6 501 aa6.33□□□□□ -1.4
STRADB-210ENST00000498648 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
STRADB-210ENST00000498648 SAMM50Q9Y512 469 aa6.33□□□□□ -1.4
STRADB-210ENST00000498648 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa6.32□□□□□ -1.4
STRADB-210ENST00000498648 A0A1W2PNR3 127 aa6.32□□□□□ -1.4
STRADB-210ENST00000498648 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
STRADB-210ENST00000498648 NCAPHQ15003 741 aa6.32□□□□□ -1.4
STRADB-210ENST00000498648 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
STRADB-210ENST00000498648 NECAB2Q7Z6G3 386 aa6.32□□□□□ -1.4
STRADB-210ENST00000498648 NCAPG2Q86XI2 1143 aa6.32□□□□□ -1.4
STRADB-210ENST00000498648 TEX2Q8IWB9 1127 aa6.32□□□□□ -1.4
STRADB-210ENST00000498648 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
STRADB-210ENST00000498648 SCYL1Q96KG9 808 aa6.32□□□□□ -1.4
STRADB-210ENST00000498648 RUSC1Q9BVN2 902 aa6.32□□□□□ -1.4
STRADB-210ENST00000498648 CDH19Q9H159 772 aa6.32□□□□□ -1.4
STRADB-210ENST00000498648 SLC12A7Q9Y666 1083 aa6.32□□□□□ -1.4
STRADB-210ENST00000498648 E2F8A0AVK6 867 aa6.31□□□□□ -1.4
STRADB-210ENST00000498648 IQCA1LA6NCM1 817 aa6.31□□□□□ -1.4
STRADB-210ENST00000498648 SUSD5O60279 629 aa6.31□□□□□ -1.4
STRADB-210ENST00000498648 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
STRADB-210ENST00000498648 TRPA1O75762 1119 aa6.31□□□□□ -1.4
STRADB-210ENST00000498648 ALDH1A1P00352 501 aa6.31□□□□□ -1.4
STRADB-210ENST00000498648 CPEP16870 476 aa6.31□□□□□ -1.4
STRADB-210ENST00000498648 TARSP26639 723 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
STRADB-210ENST00000498648 MSX1P28360 303 aa6.31□□□□□ -1.4
STRADB-210ENST00000498648 SOX18P35713 384 aa6.31□□□□□ -1.4
STRADB-210ENST00000498648 KCNQ4P56696 695 aa6.31□□□□□ -1.4
STRADB-210ENST00000498648 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
STRADB-210ENST00000498648 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
STRADB-210ENST00000498648 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
STRADB-210ENST00000498648 WDR44Q5JSH3 913 aa6.31□□□□□ -1.4
STRADB-210ENST00000498648 FOXB2Q5VYV0 432 aa6.31□□□□□ -1.4
STRADB-210ENST00000498648 VHLLQ6RSH7 139 aa6.31□□□□□ -1.4
STRADB-210ENST00000498648 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
STRADB-210ENST00000498648 KRT25Q7Z3Z0 450 aa6.31□□□□□ -1.4
STRADB-210ENST00000498648 STRA8Q7Z7C7 330 aa6.31□□□□□ -1.4
STRADB-210ENST00000498648 NME8Q8N427 588 aa6.31□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.3 ms