RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492545.1

CTDSP1-211, Transcript of CTD small phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDSP1, Length 634 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1-211ENST00000492545 MAP3K9P80192 1104 aa29.15■■■□□ 2.26
CTDSP1-211ENST00000492545 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP29.15■■■□□ 2.26
CTDSP1-211ENST00000492545 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP29.15■■■□□ 2.26
CTDSP1-211ENST00000492545 PANK1Q8TE04 598 aa29.15■■■□□ 2.26
CTDSP1-211ENST00000492545 FAM151AQ8WW52 585 aa29.15■■■□□ 2.26
CTDSP1-211ENST00000492545 ABCF2Q9UG63 623 aa29.15■■■□□ 2.26
CTDSP1-211ENST00000492545 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP29.14■■■□□ 2.26
CTDSP1-211ENST00000492545 CDAN1Q8IWY9 1227 aa29.14■■■□□ 2.26
CTDSP1-211ENST00000492545 CFHR5Q9BXR6 569 aa29.14■■■□□ 2.26
CTDSP1-211ENST00000492545 USP40Q9NVE5 1235 aa29.14■■■□□ 2.26
CTDSP1-211ENST00000492545 RCAN3Q9UKA8 241 aa29.14■■■□□ 2.26
CTDSP1-211ENST00000492545 DCAF15Q66K64 600 aa29.13■■■□□ 2.25
CTDSP1-211ENST00000492545 ERICH6Q7L0X2 663 aa29.13■■■□□ 2.25
CTDSP1-211ENST00000492545 SPATA5Q8NB90 893 aa29.13■■■□□ 2.25
CTDSP1-211ENST00000492545 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP29.13■■■□□ 2.25
CTDSP1-211ENST00000492545 ABHD8Q96I13 439 aa29.13■■■□□ 2.25
CTDSP1-211ENST00000492545 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP29.13■■■□□ 2.25
CTDSP1-211ENST00000492545 HMG20BQ9P0W2 317 aa29.13■■■□□ 2.25
CTDSP1-211ENST00000492545 CSADQ9Y600 493 aa29.13■■■□□ 2.25
CTDSP1-211ENST00000492545 GAKO14976 1311 aa29.13■■■□□ 2.25
CTDSP1-211ENST00000492545 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa29.12■■■□□ 2.25
CTDSP1-211ENST00000492545 TNNI3KQ59H18 835 aa29.12■■■□□ 2.25
CTDSP1-211ENST00000492545 CEP85Q6P2H3 762 aa29.12■■■□□ 2.25
CTDSP1-211ENST00000492545 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP29.12■■■□□ 2.25
CTDSP1-211ENST00000492545 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa29.12■■■□□ 2.25
CTDSP1-211ENST00000492545 CCDC158Q5M9N0 1113 aa29.11■■■□□ 2.25
CTDSP1-211ENST00000492545 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa29.1■■■□□ 2.25
CTDSP1-211ENST00000492545 DDX19BQ9UMR2 479 aa29.1■■■□□ 2.25
CTDSP1-211ENST00000492545 IGSF3O75054 1194 aa29.09■■■□□ 2.25
CTDSP1-211ENST00000492545 GSTO1P78417 241 aa29.09■■■□□ 2.25
CTDSP1-211ENST00000492545 IFNL1Q8IU54 200 aa29.09■■■□□ 2.25
CTDSP1-211ENST00000492545 IDI2Q9BXS1 227 aa29.09■■■□□ 2.25
CTDSP1-211ENST00000492545 ELP3Q9H9T3 547 aa29.09■■■□□ 2.25
CTDSP1-211ENST00000492545 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP29.08■■■□□ 2.25
CTDSP1-211ENST00000492545 TBC1D8O95759 1140 aa29.08■■■□□ 2.25
CTDSP1-211ENST00000492545 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP29.08■■■□□ 2.25
CTDSP1-211ENST00000492545 LDHCP07864 332 aa29.08■■■□□ 2.25
CTDSP1-211ENST00000492545 DGKZQ13574 1117 aa29.08■■■□□ 2.25
CTDSP1-211ENST00000492545 VGLL4Q14135 290 aa29.08■■■□□ 2.25
CTDSP1-211ENST00000492545 ERC1Q8IUD2 1116 aa29.08■■■□□ 2.25
CTDSP1-211ENST00000492545 OPTNQ96CV9 577 aa29.08■■■□□ 2.25
CTDSP1-211ENST00000492545 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP29.08■■■□□ 2.25
CTDSP1-211ENST00000492545 MCOLN1Q9GZU1 580 aa29.08■■■□□ 2.25
CTDSP1-211ENST00000492545 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP29.08■■■□□ 2.25
CTDSP1-211ENST00000492545 ENTPD3O75355 529 aa29.07■■■□□ 2.24
CTDSP1-211ENST00000492545 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa29.07■■■□□ 2.24
CTDSP1-211ENST00000492545 ZNF341Q9BYN7 854 aa29.07■■■□□ 2.24
CTDSP1-211ENST00000492545 GJA5P36382 358 aa29.06■■■□□ 2.24
CTDSP1-211ENST00000492545 MECOMQ03112 1051 aa29.06■■■□□ 2.24
CTDSP1-211ENST00000492545 TCP10Q12799 353 aa29.06■■■□□ 2.24
CTDSP1-211ENST00000492545 NFIAQ12857 509 aa29.06■■■□□ 2.24
CTDSP1-211ENST00000492545 TTC39AQ5SRH9 613 aa29.06■■■□□ 2.24
CTDSP1-211ENST00000492545 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP29.06■■■□□ 2.24
CTDSP1-211ENST00000492545 WRNIP1Q96S55 665 aa29.06■■■□□ 2.24
CTDSP1-211ENST00000492545 FAM198AQ9UFP1 575 aa29.06■■■□□ 2.24
CTDSP1-211ENST00000492545 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa29.05■■■□□ 2.24
CTDSP1-211ENST00000492545 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa29.05■■■□□ 2.24
CTDSP1-211ENST00000492545 GPR25O00155 361 aa29.05■■■□□ 2.24
CTDSP1-211ENST00000492545 MCAMP43121 646 aa29.05■■■□□ 2.24
CTDSP1-211ENST00000492545 GTF2A2P52657 109 aa29.04■■■□□ 2.24
CTDSP1-211ENST00000492545 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP29.04■■■□□ 2.24
CTDSP1-211ENST00000492545 ERO1BQ86YB8 467 aa29.04■■■□□ 2.24
CTDSP1-211ENST00000492545 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP29.04■■■□□ 2.24
CTDSP1-211ENST00000492545 DBNDD2Q9BQY9 259 aa29.04■■■□□ 2.24
CTDSP1-211ENST00000492545 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa29.04■■■□□ 2.24
CTDSP1-211ENST00000492545 SPDYE5A6NIY4 337 aa29.03■■■□□ 2.24
CTDSP1-211ENST00000492545 BTDP43251 543 aa29.03■■■□□ 2.24
CTDSP1-211ENST00000492545 PDE3AQ14432 1141 aa29.03■■■□□ 2.24
CTDSP1-211ENST00000492545 PI16Q6UXB8 463 aa29.03■■■□□ 2.24
CTDSP1-211ENST00000492545 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP29.03■■■□□ 2.24
CTDSP1-211ENST00000492545 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP29.03■■■□□ 2.24
CTDSP1-211ENST00000492545 MS4A4AQ96JQ5 239 aa29.03■■■□□ 2.24
CTDSP1-211ENST00000492545 RAI14Q9P0K7 980 aa29.03■■■□□ 2.24
CTDSP1-211ENST00000492545 LRP2BPQ9P2M1 347 aa29.03■■■□□ 2.24
CTDSP1-211ENST00000492545 HMMRO75330 724 aa29.02■■■□□ 2.24
CTDSP1-211ENST00000492545 NPM3O75607 178 aaKnown RBP29.02■■■□□ 2.24
CTDSP1-211ENST00000492545 RGS3P49796 1198 aa29.02■■■□□ 2.24
CTDSP1-211ENST00000492545 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP29.02■■■□□ 2.24
CTDSP1-211ENST00000492545 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa29.02■■■□□ 2.24
CTDSP1-211ENST00000492545 MIGA2Q7L4E1 593 aa29.02■■■□□ 2.24
CTDSP1-211ENST00000492545 ZNF112Q9UJU3 913 aa29.02■■■□□ 2.24
CTDSP1-211ENST00000492545 COG6Q9Y2V7 657 aa29.02■■■□□ 2.24
CTDSP1-211ENST00000492545 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP29.01■■■□□ 2.23
CTDSP1-211ENST00000492545 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa29.01■■■□□ 2.23
CTDSP1-211ENST00000492545 MYH2Q9UKX2 1941 aa29■■■□□ 2.23
CTDSP1-211ENST00000492545 FKTNO75072 461 aa29■■■□□ 2.23
CTDSP1-211ENST00000492545 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP29■■■□□ 2.23
CTDSP1-211ENST00000492545 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP29■■■□□ 2.23
CTDSP1-211ENST00000492545 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP29■■■□□ 2.23
CTDSP1-211ENST00000492545 OTUD5Q96G74 571 aa29■■■□□ 2.23
CTDSP1-211ENST00000492545 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP29■■■□□ 2.23
CTDSP1-211ENST00000492545 ZNF384Q8TF68 577 aa28.99■■■□□ 2.23
CTDSP1-211ENST00000492545 RHBDL3P58872 404 aa28.98■■■□□ 2.23
CTDSP1-211ENST00000492545 PPATQ06203 517 aa28.98■■■□□ 2.23
CTDSP1-211ENST00000492545 ZFPM1Q8IX07 1006 aa28.98■■■□□ 2.23
CTDSP1-211ENST00000492545 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa28.98■■■□□ 2.23
CTDSP1-211ENST00000492545 PTPN18Q99952 460 aa28.98■■■□□ 2.23
CTDSP1-211ENST00000492545 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa28.98■■■□□ 2.23
CTDSP1-211ENST00000492545 RFX7Q2KHR2 1363 aa28.98■■■□□ 2.23
CTDSP1-211ENST00000492545 CCDC85CA6NKD9 419 aa28.97■■■□□ 2.23
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