RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491472.2

EBF4-208, Transcript of early B cell factor 4, human

TSL 5

Gene EBF4, Length 665 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EBF4-208	ENST00000491472	DZIP1	Q86YF9	867 aa	Known RBP	27.93	■■■□□ 2.06
EBF4-208	ENST00000491472	FAM151A	Q8WW52	585 aa		27.93	■■■□□ 2.06
EBF4-208	ENST00000491472	FAM163A	Q96GL9	167 aa	Predicted RBP	27.93	■■■□□ 2.06
EBF4-208	ENST00000491472	ABCF2	Q9UG63	623 aa		27.93	■■■□□ 2.06
EBF4-208	ENST00000491472	LAMB1	P07942	1786 aa		27.92	■■■□□ 2.06
EBF4-208	ENST00000491472	ALDH1A1	P00352	501 aa		27.92	■■■□□ 2.06
EBF4-208	ENST00000491472	MAP3K9	P80192	1104 aa		27.92	■■■□□ 2.06
EBF4-208	ENST00000491472	MKRN3	Q13064	507 aa	Known RBP	27.92	■■■□□ 2.06
EBF4-208	ENST00000491472	CDC42EP5	Q6NZY7	148 aa		27.92	■■■□□ 2.06
EBF4-208	ENST00000491472	SPATA5	Q8NB90	893 aa		27.92	■■■□□ 2.06
EBF4-208	ENST00000491472	HMG20B	Q9P0W2	317 aa		27.92	■■■□□ 2.06
EBF4-208	ENST00000491472	DDX19B	Q9UMR2	479 aa		27.92	■■■□□ 2.06
EBF4-208	ENST00000491472	MYH2	Q9UKX2	1941 aa		27.92	■■■□□ 2.06
EBF4-208	ENST00000491472	GAK	O14976	1311 aa		27.92	■■■□□ 2.06
EBF4-208	ENST00000491472	TNNI3K	Q59H18	835 aa		27.91	■■■□□ 2.06
EBF4-208	ENST00000491472	DCAF15	Q66K64	600 aa		27.91	■■■□□ 2.06
EBF4-208	ENST00000491472	CEP85	Q6P2H3	762 aa		27.91	■■■□□ 2.06
EBF4-208	ENST00000491472	ERICH6	Q7L0X2	663 aa		27.91	■■■□□ 2.06
EBF4-208	ENST00000491472	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		27.91	■■■□□ 2.06
EBF4-208	ENST00000491472	NOM1	Q5C9Z4	860 aa	Known RBP	27.9	■■■□□ 2.06
EBF4-208	ENST00000491472	CCDC158	Q5M9N0	1113 aa		27.9	■■■□□ 2.06
EBF4-208	ENST00000491472	CDAN1	Q8IWY9	1227 aa		27.9	■■■□□ 2.06
EBF4-208	ENST00000491472	CFHR5	Q9BXR6	569 aa		27.9	■■■□□ 2.06
EBF4-208	ENST00000491472	USP40	Q9NVE5	1235 aa		27.9	■■■□□ 2.06
EBF4-208	ENST00000491472	CSAD	Q9Y600	493 aa		27.9	■■■□□ 2.06
EBF4-208	ENST00000491472	DDX55	Q8NHQ9	600 aa	Known RBP eCLIP	27.89	■■■□□ 2.06
EBF4-208	ENST00000491472	OTOF	Q9HC10	1997 aa		27.89	■■■□□ 2.06
EBF4-208	ENST00000491472	CAPN15	O75808	1086 aa		27.88	■■■□□ 2.05
EBF4-208	ENST00000491472	LDHC	P07864	332 aa		27.88	■■■□□ 2.05
EBF4-208	ENST00000491472	GSTO1	P78417	241 aa		27.88	■■■□□ 2.05
EBF4-208	ENST00000491472	PPP1R3F	Q6ZSY5	799 aa	Predicted RBP	27.88	■■■□□ 2.05
EBF4-208	ENST00000491472	ERC1	Q8IUD2	1116 aa		27.88	■■■□□ 2.05
EBF4-208	ENST00000491472	GOLGA6L2	Q8N9W4	650 aa	Predicted RBP	27.88	■■■□□ 2.05
EBF4-208	ENST00000491472	ZNF512B	Q96KM6	892 aa	Predicted RBP	27.88	■■■□□ 2.05
EBF4-208	ENST00000491472	IGSF3	O75054	1194 aa		27.87	■■■□□ 2.05
EBF4-208	ENST00000491472	HSP90AB4P	Q58FF6	505 aa		27.87	■■■□□ 2.05
EBF4-208	ENST00000491472	RPAP2	Q8IXW5	612 aa	Predicted RBP	27.87	■■■□□ 2.05
EBF4-208	ENST00000491472	IDI2	Q9BXS1	227 aa		27.87	■■■□□ 2.05
EBF4-208	ENST00000491472	MAP4K4	O95819	1239 aa	Predicted RBP	27.86	■■■□□ 2.05
EBF4-208	ENST00000491472	TTC39A	Q5SRH9	613 aa		27.86	■■■□□ 2.05
EBF4-208	ENST00000491472	OTUD7B	Q6GQQ9	843 aa		27.86	■■■□□ 2.05
EBF4-208	ENST00000491472	ABHD8	Q96I13	439 aa		27.86	■■■□□ 2.05
EBF4-208	ENST00000491472	ZNF341	Q9BYN7	854 aa		27.86	■■■□□ 2.05
EBF4-208	ENST00000491472	ELP3	Q9H9T3	547 aa		27.86	■■■□□ 2.05
EBF4-208	ENST00000491472	ZBTB4	Q9P1Z0	1013 aa	Predicted RBP	27.86	■■■□□ 2.05
EBF4-208	ENST00000491472	MROH7-TTC4	A0A0A0MT08	1334 aa		27.86	■■■□□ 2.05
EBF4-208	ENST00000491472	ENTPD3	O75355	529 aa		27.85	■■■□□ 2.05
EBF4-208	ENST00000491472	MCAM	P43121	646 aa		27.85	■■■□□ 2.05
EBF4-208	ENST00000491472	MECOM	Q03112	1051 aa		27.85	■■■□□ 2.05
EBF4-208	ENST00000491472	VGLL4	Q14135	290 aa		27.85	■■■□□ 2.05
EBF4-208	ENST00000491472	IFNL1	Q8IU54	200 aa		27.85	■■■□□ 2.05
EBF4-208	ENST00000491472	OPTN	Q96CV9	577 aa		27.85	■■■□□ 2.05
EBF4-208	ENST00000491472	HMMR	O75330	724 aa		27.84	■■■□□ 2.05
EBF4-208	ENST00000491472	TCP10	Q12799	353 aa		27.84	■■■□□ 2.05
EBF4-208	ENST00000491472	NFIA	Q12857	509 aa		27.84	■■■□□ 2.05
EBF4-208	ENST00000491472	PDE3A	Q14432	1141 aa		27.84	■■■□□ 2.05
EBF4-208	ENST00000491472	DBNDD2	Q9BQY9	259 aa		27.84	■■■□□ 2.05
EBF4-208	ENST00000491472	ZBTB40	Q9NUA8	1239 aa		27.84	■■■□□ 2.05
EBF4-208	ENST00000491472	FAM198A	Q9UFP1	575 aa		27.84	■■■□□ 2.05
EBF4-208	ENST00000491472	AK9	Q5TCS8	1911 aa		27.83	■■■□□ 2.05
EBF4-208	ENST00000491472	GPR75-ASB3	A0A0A6YYF3	556 aa		27.83	■■■□□ 2.05
EBF4-208	ENST00000491472	TESPA1	A2RU30	521 aa	Predicted RBP	27.83	■■■□□ 2.05
EBF4-208	ENST00000491472	TBC1D8	O95759	1140 aa		27.83	■■■□□ 2.05
EBF4-208	ENST00000491472	DGKZ	Q13574	1117 aa		27.83	■■■□□ 2.05
EBF4-208	ENST00000491472	NSUN4	Q96CB9	384 aa	Known RBP	27.83	■■■□□ 2.05
EBF4-208	ENST00000491472	WRNIP1	Q96S55	665 aa		27.83	■■■□□ 2.05
EBF4-208	ENST00000491472	COG6	Q9Y2V7	657 aa		27.83	■■■□□ 2.05
EBF4-208	ENST00000491472	GJA5	P36382	358 aa		27.82	■■■□□ 2.04
EBF4-208	ENST00000491472	PI16	Q6UXB8	463 aa		27.82	■■■□□ 2.04
EBF4-208	ENST00000491472	MCOLN1	Q9GZU1	580 aa		27.82	■■■□□ 2.04
EBF4-208	ENST00000491472	RAI14	Q9P0K7	980 aa		27.82	■■■□□ 2.04
EBF4-208	ENST00000491472	LRP2BP	Q9P2M1	347 aa		27.82	■■■□□ 2.04
EBF4-208	ENST00000491472	NPM3	O75607	178 aa	Known RBP	27.81	■■■□□ 2.04
EBF4-208	ENST00000491472	BTD	P43251	543 aa		27.81	■■■□□ 2.04
EBF4-208	ENST00000491472	RGS3	P49796	1198 aa		27.81	■■■□□ 2.04
EBF4-208	ENST00000491472	GTF2A2	P52657	109 aa		27.81	■■■□□ 2.04
EBF4-208	ENST00000491472	TBC1D9	Q6ZT07	1266 aa		27.81	■■■□□ 2.04
EBF4-208	ENST00000491472	ERO1B	Q86YB8	467 aa		27.81	■■■□□ 2.04
EBF4-208	ENST00000491472	SPDYE5	A6NIY4	337 aa		27.8	■■■□□ 2.04
EBF4-208	ENST00000491472	GPR25	O00155	361 aa		27.8	■■■□□ 2.04
EBF4-208	ENST00000491472	ZNF112	Q9UJU3	913 aa		27.8	■■■□□ 2.04
EBF4-208	ENST00000491472	DBNL	Q9UJU6	430 aa	Known RBP	27.8	■■■□□ 2.04
EBF4-208	ENST00000491472	RFX7	Q2KHR2	1363 aa		27.79	■■■□□ 2.04
EBF4-208	ENST00000491472	MIGA2	Q7L4E1	593 aa		27.79	■■■□□ 2.04
EBF4-208	ENST00000491472	CTU1	Q7Z7A3	348 aa	Known RBP	27.79	■■■□□ 2.04
EBF4-208	ENST00000491472	EAF2	Q96CJ1	260 aa	Predicted RBP	27.79	■■■□□ 2.04
EBF4-208	ENST00000491472	EXOC6B	Q9Y2D4	811 aa		27.79	■■■□□ 2.04
EBF4-208	ENST00000491472	SNCAIP	Q9Y6H5	919 aa		27.79	■■■□□ 2.04
EBF4-208	ENST00000491472	IGF2BP3	O00425	579 aa	Known RBP eCLIP	27.78	■■■□□ 2.04
EBF4-208	ENST00000491472	ZNF384	Q8TF68	577 aa		27.78	■■■□□ 2.04
EBF4-208	ENST00000491472	ZNF296	Q8WUU4	475 aa	Predicted RBP	27.78	■■■□□ 2.04
EBF4-208	ENST00000491472	MS4A4A	Q96JQ5	239 aa		27.78	■■■□□ 2.04
EBF4-208	ENST00000491472	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	27.77	■■■□□ 2.04
EBF4-208	ENST00000491472	ZKSCAN4	Q969J2	545 aa	Predicted RBP	27.77	■■■□□ 2.04
EBF4-208	ENST00000491472	NOL10	Q9BSC4	688 aa	Known RBP	27.77	■■■□□ 2.04
EBF4-208	ENST00000491472	CCDC8	Q9H0W5	538 aa	Predicted RBP	27.77	■■■□□ 2.04
EBF4-208	ENST00000491472	SNRK	Q9NRH2	765 aa		27.77	■■■□□ 2.04
EBF4-208	ENST00000491472	FKTN	O75072	461 aa		27.76	■■■□□ 2.03
EBF4-208	ENST00000491472	RHBDL3	P58872	404 aa		27.76	■■■□□ 2.03
EBF4-208	ENST00000491472	PPAT	Q06203	517 aa		27.76	■■■□□ 2.03

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