RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490205.1

NELFCD-210, Transcript of negative elongation factor complex member C/D, humanhuman

TSL 2

Gene NELFCD, Length 650 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFCD-210ENST00000490205 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
NELFCD-210ENST00000490205 NLRP2Q9NX02 1062 aa6.77□□□□□ -1.33
NELFCD-210ENST00000490205 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
NELFCD-210ENST00000490205 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP6.76□□□□□ -1.33
NELFCD-210ENST00000490205 DTHD1Q6ZMT9 781 aa6.76□□□□□ -1.33
NELFCD-210ENST00000490205 GLIS3Q8NEA6 775 aa6.76□□□□□ -1.33
NELFCD-210ENST00000490205 GATA6Q92908 595 aa6.76□□□□□ -1.33
NELFCD-210ENST00000490205 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
NELFCD-210ENST00000490205 FAM170BA6NMN3 283 aa6.75□□□□□ -1.33
NELFCD-210ENST00000490205 FAAP100Q0VG06 881 aa6.75□□□□□ -1.33
NELFCD-210ENST00000490205 CCDC39Q9UFE4 941 aa6.75□□□□□ -1.33
NELFCD-210ENST00000490205 DCTN4Q9UJW0 460 aa6.75□□□□□ -1.33
NELFCD-210ENST00000490205 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa6.75□□□□□ -1.33
NELFCD-210ENST00000490205 PRNPP04156 253 aa6.74□□□□□ -1.33
NELFCD-210ENST00000490205 SLFN14P0C7P3 912 aa6.74□□□□□ -1.33
NELFCD-210ENST00000490205 LIG1P18858 919 aa6.74□□□□□ -1.33
NELFCD-210ENST00000490205 FCGRTP55899 365 aa6.74□□□□□ -1.33
NELFCD-210ENST00000490205 PPP2R3AQ06190 1150 aa6.74□□□□□ -1.33
NELFCD-210ENST00000490205 TMC7Q7Z402 723 aa6.74□□□□□ -1.33
NELFCD-210ENST00000490205 VSIG10LQ86VR7 867 aa6.74□□□□□ -1.33
NELFCD-210ENST00000490205 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
NELFCD-210ENST00000490205 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
NELFCD-210ENST00000490205 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa6.74□□□□□ -1.33
NELFCD-210ENST00000490205 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
NELFCD-210ENST00000490205 TMPRSS2O15393 492 aa6.73□□□□□ -1.33
NELFCD-210ENST00000490205 BRD1O95696 1058 aa6.73□□□□□ -1.33
NELFCD-210ENST00000490205 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
NELFCD-210ENST00000490205 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
NELFCD-210ENST00000490205 TXKP42681 527 aa6.73□□□□□ -1.33
NELFCD-210ENST00000490205 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa6.73□□□□□ -1.33
NELFCD-210ENST00000490205 ZNF765Q7L2R6 523 aa6.73□□□□□ -1.33
NELFCD-210ENST00000490205 FBXL18Q96ME1 805 aa6.73□□□□□ -1.33
NELFCD-210ENST00000490205 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa6.73□□□□□ -1.33
NELFCD-210ENST00000490205 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
NELFCD-210ENST00000490205 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa6.73□□□□□ -1.33
NELFCD-210ENST00000490205 C1GALT1Q9NS00 363 aa6.73□□□□□ -1.33
NELFCD-210ENST00000490205 TMEM39AQ9NV64 488 aa6.73□□□□□ -1.33
NELFCD-210ENST00000490205 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
NELFCD-210ENST00000490205 ADGRE2Q9UHX3 823 aa6.73□□□□□ -1.33
NELFCD-210ENST00000490205 PLCB3Q01970 1234 aa6.72□□□□□ -1.33
NELFCD-210ENST00000490205 ID3Q02535 119 aa6.72□□□□□ -1.33
NELFCD-210ENST00000490205 OGFOD3Q6PK18 319 aa6.72□□□□□ -1.33
NELFCD-210ENST00000490205 TP53INP2Q8IXH6 220 aa6.72□□□□□ -1.33
NELFCD-210ENST00000490205 ABI1Q8IZP0 508 aa6.72□□□□□ -1.33
NELFCD-210ENST00000490205 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
NELFCD-210ENST00000490205 FMNL2Q96PY5 1086 aa6.72□□□□□ -1.33
NELFCD-210ENST00000490205 BCO2Q9BYV7 579 aa6.72□□□□□ -1.33
NELFCD-210ENST00000490205 ATXN3LQ9H3M9 355 aa6.72□□□□□ -1.33
NELFCD-210ENST00000490205 PIDD1Q9HB75 910 aa6.72□□□□□ -1.33
NELFCD-210ENST00000490205 LGR6Q9HBX8 967 aa6.72□□□□□ -1.33
NELFCD-210ENST00000490205 KRT82Q9NSB4 513 aa6.72□□□□□ -1.33
NELFCD-210ENST00000490205 CRIM1Q9NZV1 1036 aa6.72□□□□□ -1.33
NELFCD-210ENST00000490205 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
NELFCD-210ENST00000490205 ZNF862O60290 1169 aa6.71□□□□□ -1.34
NELFCD-210ENST00000490205 MAPK1P28482 360 aa6.71□□□□□ -1.34
NELFCD-210ENST00000490205 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa6.71□□□□□ -1.34
NELFCD-210ENST00000490205 PI16Q6UXB8 463 aa6.71□□□□□ -1.34
NELFCD-210ENST00000490205 FANCD2OSQ96PS1 177 aa6.71□□□□□ -1.34
NELFCD-210ENST00000490205 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa6.71□□□□□ -1.34
NELFCD-210ENST00000490205 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
NELFCD-210ENST00000490205 DSC3Q14574 896 aa6.7□□□□□ -1.34
NELFCD-210ENST00000490205 CYP27C1Q4G0S4 372 aa6.7□□□□□ -1.34
NELFCD-210ENST00000490205 KCNB2Q92953 911 aa6.7□□□□□ -1.34
NELFCD-210ENST00000490205 AKAP2Q9Y2D5 859 aa6.7□□□□□ -1.34
NELFCD-210ENST00000490205 RNF114Q9Y508 228 aa6.7□□□□□ -1.34
NELFCD-210ENST00000490205 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa6.69□□□□□ -1.34
NELFCD-210ENST00000490205 TREHO43280 583 aa6.69□□□□□ -1.34
NELFCD-210ENST00000490205 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
NELFCD-210ENST00000490205 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP6.69□□□□□ -1.34
NELFCD-210ENST00000490205 NXPE4Q6UWF7 544 aa6.69□□□□□ -1.34
NELFCD-210ENST00000490205 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
NELFCD-210ENST00000490205 AGBL5Q8NDL9 886 aa6.69□□□□□ -1.34
NELFCD-210ENST00000490205 FLCNQ8NFG4 579 aa6.69□□□□□ -1.34
NELFCD-210ENST00000490205 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
NELFCD-210ENST00000490205 LCE3BQ5TA77 95 aa6.68□□□□□ -1.34
NELFCD-210ENST00000490205 PDZD3Q86UT5 571 aa6.68□□□□□ -1.34
NELFCD-210ENST00000490205 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa6.68□□□□□ -1.34
NELFCD-210ENST00000490205 SULF2Q8IWU5 870 aa6.68□□□□□ -1.34
NELFCD-210ENST00000490205 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa6.68□□□□□ -1.34
NELFCD-210ENST00000490205 DISC1Q9NRI5 854 aa6.68□□□□□ -1.34
NELFCD-210ENST00000490205 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa6.68□□□□□ -1.34
NELFCD-210ENST00000490205 NME2P22392 152 aa6.67□□□□□ -1.34
NELFCD-210ENST00000490205 ARNTP27540 789 aa6.67□□□□□ -1.34
NELFCD-210ENST00000490205 TTLL4Q14679 1199 aa6.67□□□□□ -1.34
NELFCD-210ENST00000490205 NFXL1Q6ZNB6 911 aa6.67□□□□□ -1.34
NELFCD-210ENST00000490205 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa6.67□□□□□ -1.34
NELFCD-210ENST00000490205 FAM87AP0C7U9 286 aa6.66□□□□□ -1.34
NELFCD-210ENST00000490205 CDK5R2Q13319 367 aa6.66□□□□□ -1.34
NELFCD-210ENST00000490205 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
NELFCD-210ENST00000490205 CBLL1Q75N03 491 aa6.66□□□□□ -1.34
NELFCD-210ENST00000490205 SLC5A6Q9Y289 635 aa6.66□□□□□ -1.34
NELFCD-210ENST00000490205 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
NELFCD-210ENST00000490205 GSTT1P30711 240 aa6.65□□□□□ -1.34
NELFCD-210ENST00000490205 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa6.65□□□□□ -1.34
NELFCD-210ENST00000490205 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
NELFCD-210ENST00000490205 STK11IPQ8N1F8 1099 aa6.65□□□□□ -1.34
NELFCD-210ENST00000490205 STK35Q8TDR2 534 aa6.65□□□□□ -1.34
NELFCD-210ENST00000490205 FBF1Q8TES7 1133 aa6.65□□□□□ -1.34
NELFCD-210ENST00000490205 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa6.65□□□□□ -1.34
NELFCD-210ENST00000490205 CBX8Q9HC52 389 aa6.65□□□□□ -1.34
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