RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489450.1

RABGGTB-211, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 586 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-211ENST00000489450 RELL1Q8IUW5 271 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGGTB-211ENST00000489450 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP5.36□□□□□ -1.55
RABGGTB-211ENST00000489450 DCAF11Q8TEB1 546 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGGTB-211ENST00000489450 KCNB2Q92953 911 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGGTB-211ENST00000489450 TMEM74Q96NL1 305 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGGTB-211ENST00000489450 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGGTB-211ENST00000489450 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
RABGGTB-211ENST00000489450 PF4P02776 101 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-211ENST00000489450 LIG1P18858 919 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-211ENST00000489450 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-211ENST00000489450 RPS26P62854 115 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-211ENST00000489450 RACK1P63244 317 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-211ENST00000489450 FAM160A1Q05DH4 1040 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-211ENST00000489450 PWP1Q13610 501 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-211ENST00000489450 SEPT6Q14141 434 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-211ENST00000489450 PDE3AQ14432 1141 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-211ENST00000489450 LRRC14Q15048 493 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-211ENST00000489450 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-211ENST00000489450 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-211ENST00000489450 GAL3ST3Q96A11 431 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-211ENST00000489450 RHOVQ96L33 236 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-211ENST00000489450 RUSC1Q9BVN2 902 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-211ENST00000489450 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-211ENST00000489450 USP21Q9UK80 565 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-211ENST00000489450 CYP8B1Q9UNU6 501 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF862O60290 1169 aa5.34□□□□□ -1.55
RABGGTB-211ENST00000489450 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP5.34□□□□□ -1.55
RABGGTB-211ENST00000489450 ALX3O95076 343 aa5.34□□□□□ -1.55
RABGGTB-211ENST00000489450 APBA3O96018 575 aa5.34□□□□□ -1.55
RABGGTB-211ENST00000489450 FURINP09958 794 aa5.34□□□□□ -1.55
RABGGTB-211ENST00000489450 LMNB1P20700 586 aa5.34□□□□□ -1.55
RABGGTB-211ENST00000489450 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP5.34□□□□□ -1.55
RABGGTB-211ENST00000489450 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP5.34□□□□□ -1.55
RABGGTB-211ENST00000489450 GPBAR1Q8TDU6 330 aa5.34□□□□□ -1.55
RABGGTB-211ENST00000489450 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP5.34□□□□□ -1.55
RABGGTB-211ENST00000489450 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP5.34□□□□□ -1.55
RABGGTB-211ENST00000489450 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP5.34□□□□□ -1.55
RABGGTB-211ENST00000489450 C9orf172C9J069 976 aa5.33□□□□□ -1.56
RABGGTB-211ENST00000489450 F8W735 103 aaPredicted RBP5.33□□□□□ -1.56
RABGGTB-211ENST00000489450 TRIM37O94972 964 aa5.33□□□□□ -1.56
RABGGTB-211ENST00000489450 GARTP22102 1010 aa5.33□□□□□ -1.56
RABGGTB-211ENST00000489450 LMNB2Q03252 620 aa5.33□□□□□ -1.56
RABGGTB-211ENST00000489450 SNAP47Q5SQN1 464 aa5.33□□□□□ -1.56
RABGGTB-211ENST00000489450 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP5.33□□□□□ -1.56
RABGGTB-211ENST00000489450 ACSBG1Q96GR2 724 aa5.33□□□□□ -1.56
RABGGTB-211ENST00000489450 NACC1Q96RE7 527 aa5.33□□□□□ -1.56
RABGGTB-211ENST00000489450 WDR18Q9BV38 432 aa5.33□□□□□ -1.56
RABGGTB-211ENST00000489450 TGIF2Q9GZN2 237 aa5.33□□□□□ -1.56
RABGGTB-211ENST00000489450 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa5.33□□□□□ -1.56
RABGGTB-211ENST00000489450 ACBD3Q9H3P7 528 aa5.33□□□□□ -1.56
RABGGTB-211ENST00000489450 KRT82Q9NSB4 513 aa5.33□□□□□ -1.56
RABGGTB-211ENST00000489450 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa5.33□□□□□ -1.56
RABGGTB-211ENST00000489450 AOC2O75106 756 aa5.32□□□□□ -1.56
RABGGTB-211ENST00000489450 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
RABGGTB-211ENST00000489450 CHRNA4P43681 627 aa5.32□□□□□ -1.56
RABGGTB-211ENST00000489450 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
RABGGTB-211ENST00000489450 FBXL19Q6PCT2 694 aa5.32□□□□□ -1.56
RABGGTB-211ENST00000489450 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP5.32□□□□□ -1.56
RABGGTB-211ENST00000489450 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP5.32□□□□□ -1.56
RABGGTB-211ENST00000489450 TRIM42Q8IWZ5 723 aa5.32□□□□□ -1.56
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF654Q8IZM8 581 aa5.32□□□□□ -1.56
RABGGTB-211ENST00000489450 Q8N3U1 123 aa5.32□□□□□ -1.56
RABGGTB-211ENST00000489450 GOLM1Q8NBJ4 401 aa5.32□□□□□ -1.56
RABGGTB-211ENST00000489450 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP5.32□□□□□ -1.56
RABGGTB-211ENST00000489450 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa5.32□□□□□ -1.56
RABGGTB-211ENST00000489450 RNF208Q9H0X6 261 aa5.32□□□□□ -1.56
RABGGTB-211ENST00000489450 CCSER2Q9H7U1 834 aa5.32□□□□□ -1.56
RABGGTB-211ENST00000489450 RAD18Q9NS91 495 aa5.32□□□□□ -1.56
RABGGTB-211ENST00000489450 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa5.32□□□□□ -1.56
RABGGTB-211ENST00000489450 PCDHA4Q9UN74 947 aa5.32□□□□□ -1.56
RABGGTB-211ENST00000489450 MEGF11A6BM72 1044 aa5.31□□□□□ -1.56
RABGGTB-211ENST00000489450 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa5.31□□□□□ -1.56
RABGGTB-211ENST00000489450 F13A1P00488 732 aa5.31□□□□□ -1.56
RABGGTB-211ENST00000489450 NOS3P29474 1203 aa5.31□□□□□ -1.56
RABGGTB-211ENST00000489450 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP5.31□□□□□ -1.56
RABGGTB-211ENST00000489450 IREB2P48200 963 aaKnown RBP5.31□□□□□ -1.56
RABGGTB-211ENST00000489450 TNNI2P48788 182 aa5.31□□□□□ -1.56
RABGGTB-211ENST00000489450 CDK8P49336 464 aa5.31□□□□□ -1.56
RABGGTB-211ENST00000489450 ADGRE1Q14246 886 aa5.31□□□□□ -1.56
RABGGTB-211ENST00000489450 MBTPS1Q14703 1052 aa5.31□□□□□ -1.56
RABGGTB-211ENST00000489450 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa5.31□□□□□ -1.56
RABGGTB-211ENST00000489450 AKAP4Q5JQC9 854 aa5.31□□□□□ -1.56
RABGGTB-211ENST00000489450 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP5.31□□□□□ -1.56
RABGGTB-211ENST00000489450 NUTM2GQ5VZR2 741 aa5.31□□□□□ -1.56
RABGGTB-211ENST00000489450 KIAA0825Q8IV33 1275 aa5.31□□□□□ -1.56
RABGGTB-211ENST00000489450 TMEM130Q8N3G9 435 aa5.31□□□□□ -1.56
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP5.31□□□□□ -1.56
RABGGTB-211ENST00000489450 WFDC12Q8WWY7 111 aa5.31□□□□□ -1.56
RABGGTB-211ENST00000489450 SPON2Q9BUD6 331 aa5.31□□□□□ -1.56
RABGGTB-211ENST00000489450 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa5.31□□□□□ -1.56
RABGGTB-211ENST00000489450 AKTIPQ9H8T0 292 aa5.31□□□□□ -1.56
RABGGTB-211ENST00000489450 TMPRSS2O15393 492 aa5.3□□□□□ -1.56
RABGGTB-211ENST00000489450 TLR3O15455 904 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
RABGGTB-211ENST00000489450 GLB1P16278 677 aa5.3□□□□□ -1.56
RABGGTB-211ENST00000489450 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP5.3□□□□□ -1.56
RABGGTB-211ENST00000489450 INPP5AQ14642 412 aa5.3□□□□□ -1.56
RABGGTB-211ENST00000489450 FDX2Q6P4F2 183 aa5.3□□□□□ -1.56
RABGGTB-211ENST00000489450 LRFN4Q6PJG9 635 aa5.3□□□□□ -1.56
RABGGTB-211ENST00000489450 CD163Q86VB7 1156 aa5.3□□□□□ -1.56
RABGGTB-211ENST00000489450 FBXO27Q8NI29 283 aa5.3□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.4 ms