RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486480.1

PTPRN-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRN, Length 563 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-216ENST00000486480 BOLA2Q9H3K6 86 aa23.31■■□□□ 1.32
PTPRN-216ENST00000486480 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
PTPRN-216ENST00000486480 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa23.3■■□□□ 1.32
PTPRN-216ENST00000486480 CNTNAP1P78357 1384 aa23.3■■□□□ 1.32
PTPRN-216ENST00000486480 TNNI2P48788 182 aa23.3■■□□□ 1.32
PTPRN-216ENST00000486480 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
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PTPRN-216ENST00000486480 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa23.3■■□□□ 1.32
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PTPRN-216ENST00000486480 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa23.29■■□□□ 1.32
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PTPRN-216ENST00000486480 C2orf69Q8N8R5 385 aa23.29■■□□□ 1.32
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PTPRN-216ENST00000486480 CDAN1Q8IWY9 1227 aa23.26■■□□□ 1.31
PTPRN-216ENST00000486480 TEPSINQ96N21 525 aa23.26■■□□□ 1.31
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PTPRN-216ENST00000486480 MX1P20591 662 aa23.25■■□□□ 1.31
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PTPRN-216ENST00000486480 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa23.25■■□□□ 1.31
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PTPRN-216ENST00000486480 MOB2Q70IA6 237 aa23.24■■□□□ 1.31
PTPRN-216ENST00000486480 FAM151AQ8WW52 585 aa23.24■■□□□ 1.31
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PTPRN-216ENST00000486480 LNPKQ9C0E8 428 aa23.24■■□□□ 1.31
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PTPRN-216ENST00000486480 TCP10Q12799 353 aa23.23■■□□□ 1.31
PTPRN-216ENST00000486480 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
PTPRN-216ENST00000486480 PI4K2BQ8TCG2 481 aa23.23■■□□□ 1.31
PTPRN-216ENST00000486480 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP23.23■■□□□ 1.31
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PTPRN-216ENST00000486480 BAG3O95817 575 aa23.22■■□□□ 1.31
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PTPRN-216ENST00000486480 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
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PTPRN-216ENST00000486480 FZD1Q9UP38 647 aa23.21■■□□□ 1.31
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PTPRN-216ENST00000486480 PICALMQ13492 652 aa23.2■■□□□ 1.3
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PTPRN-216ENST00000486480 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa23.19■■□□□ 1.3
PTPRN-216ENST00000486480 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
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PTPRN-216ENST00000486480 MAP3K11Q16584 847 aa23.19■■□□□ 1.3
PTPRN-216ENST00000486480 RGMBQ6NW40 437 aa23.19■■□□□ 1.3
PTPRN-216ENST00000486480 ZFPM1Q8IX07 1006 aa23.19■■□□□ 1.3
PTPRN-216ENST00000486480 MIGA1Q8NAN2 632 aa23.19■■□□□ 1.3
PTPRN-216ENST00000486480 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
PTPRN-216ENST00000486480 NAV1Q8NEY1 1877 aa23.18■■□□□ 1.3
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