RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484528.1

USP40-215, Transcript of ubiquitin specific peptidase 40, humanhuman

TSL 2

Gene USP40, Length 933 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP40-215ENST00000484528 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa26.75■■□□□ 1.87
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USP40-215ENST00000484528 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
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USP40-215ENST00000484528 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
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USP40-215ENST00000484528 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
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USP40-215ENST00000484528 RASGRF1Q13972 1273 aa26.73■■□□□ 1.87
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USP40-215ENST00000484528 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP26.69■■□□□ 1.86
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USP40-215ENST00000484528 NEUROD6Q96NK8 337 aa26.69■■□□□ 1.86
USP40-215ENST00000484528 ZNF341Q9BYN7 854 aa26.69■■□□□ 1.86
USP40-215ENST00000484528 FAM198AQ9UFP1 575 aa26.69■■□□□ 1.86
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USP40-215ENST00000484528 ERO1AQ96HE7 468 aa26.68■■□□□ 1.86
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USP40-215ENST00000484528 HTTP42858 3142 aa26.67■■□□□ 1.86
USP40-215ENST00000484528 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa26.67■■□□□ 1.86
USP40-215ENST00000484528 IRF6O14896 467 aa26.66■■□□□ 1.86
USP40-215ENST00000484528 CAP1Q01518 475 aa26.66■■□□□ 1.86
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USP40-215ENST00000484528 ZBTB22O15209 634 aa26.63■■□□□ 1.85
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USP40-215ENST00000484528 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
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USP40-215ENST00000484528 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
USP40-215ENST00000484528 SLURP2P0DP57 97 aa26.58■■□□□ 1.85
USP40-215ENST00000484528 RLBP1P12271 317 aa26.58■■□□□ 1.85
USP40-215ENST00000484528 ITPRIPQ8IWB1 547 aa26.58■■□□□ 1.85
USP40-215ENST00000484528 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
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