RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484147.5

PTPN22-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 22, human

TSL 2

Gene PTPN22, Length 2,258 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPN22-205	ENST00000484147	HOXA10	P31260	410 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	DDIT3	P35638	169 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	PRPH	P41219	470 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	NFX1	Q12986	1120 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	SFMBT2	Q5VUG0	894 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	ARMC3	Q5W041	872 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	SKAP1	Q86WV1	359 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	FBXO18	Q8NFZ0	1043 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	TAF4B	Q92750	862 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	BICD1	Q96G01	975 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	CFAP53	Q96M91	514 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	BAG1	Q99933	345 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	CRACR2A	Q9BSW2	395 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	DIAPH3	Q9NSV4	1193 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	GNL3L	Q9NVN8	582 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	NRBP1	Q9UHY1	535 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	CTDP1	Q9Y5B0	961 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	KTN1	Q86UP2	1357 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	CFAP69	A5D8W1	941 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	STK10	O94804	968 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	MAP4K4	O95819	1239 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	VDR	P11473	427 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	COPB2	P35606	906 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	RRP1	P56182	461 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	PTK7	Q13308	1070 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	PRR23B	Q6ZRT6	265 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	ANKRD13B	Q86YJ7	626 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	TRIM42	Q8IWZ5	723 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	CCDC191	Q8NCU4	936 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	ADAMTS19	Q8TE59	1207 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	PPM1E	Q8WY54	764 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	TBC1D2	Q9BYX2	928 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	TRPV5	Q9NQA5	729 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	EIF4ENIF1	Q9NRA8	985 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	TMEM98	Q9Y2Y6	226 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	NR2E3	Q9Y5X4	410 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	NOS1	P29475	1434 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	ASH1L	Q9NR48	2969 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	TTC21A	Q8NDW8	1320 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	SHTN1	A0MZ66	631 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	GLTPD2	A6NH11	291 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	LRRC10B	A6NIK2	292 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	TMCO5B	A8MYB1	307 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	PYGL	P06737	847 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	PECAM1	P16284	738 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	STIP1	P31948	543 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	RAB27A	P51159	221 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	ZBED6	P86452	979 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	RBBP5	Q15291	538 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	ZNF394	Q53GI3	561 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	NUTM1	Q86Y26	1132 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	TTC30B	Q8N4P2	665 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	ARMC2	Q8NEN0	867 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	TMC2	Q8TDI7	906 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	TRAIP	Q9BWF2	469 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	ZSCAN16	Q9H4T2	348 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	ST7	Q9NRC1	585 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	SPATS2L	Q9NUQ6	558 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	TBC1D7	Q9P0N9	293 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	RABL2B	Q9UNT1	228 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	IGF2BP2	Q9Y6M1	599 aa	Known RBP eCLIP	4.55	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	U2SURP	O15042	1029 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	CREB3	O43889	395 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	KIF5C	O60282	957 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	TPPP	O94811	219 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	BAG4	O95429	457 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	GCFC2	P16383	781 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	VCAM1	P19320	739 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	ELF1	P32519	619 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	CRYM	Q14894	314 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	PREPL	Q4J6C6	727 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	ACBD5	Q5T8D3	534 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	LRRC31	Q6UY01	552 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	TAX1BP1	Q86VP1	789 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	NEK11	Q8NG66	645 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	GOLGA5	Q8TBA6	731 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	TRPM4	Q8TD43	1214 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	DHRS1	Q96LJ7	313 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	GUCD1	Q96NT3	240 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	SEZ6L	Q9BYH1	1024 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	TRIM6	Q9C030	488 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	FMN2	Q9NZ56	1722 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	CBFA2T2	O43439	604 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	HTATSF1	O43719	755 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	MYL1	P05976	194 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	TGFB3	P10600	412 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	XBP1	P17861	261 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	TPP2	P29144	1249 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	CORO7	P57737	925 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	PPP4C	P60510	307 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	HDLBP	Q00341	1268 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	SNX1	Q13596	522 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	AKNAD1	Q5T1N1	836 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	C20orf194	Q5TEA3	1177 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	SOGA3	Q5TF21	947 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	MYSM1	Q5VVJ2	828 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	LDHD	Q86WU2	507 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPN22-205	ENST00000484147	ARL10	Q8N8L6	244 aa		4.53	□□□□□ -1.68

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