RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477413.1

CNIH4-208, Transcript of cornichon family AMPA receptor auxiliary protein 4, human

TSL 5

Gene CNIH4, Length 820 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CNIH4-208	ENST00000477413	CDC42EP5	Q6NZY7	148 aa		27.92	■■■□□ 2.06
CNIH4-208	ENST00000477413	C1orf115	Q9H7X2	142 aa		27.92	■■■□□ 2.06
CNIH4-208	ENST00000477413	CEP85	Q6P2H3	762 aa		27.91	■■■□□ 2.06
CNIH4-208	ENST00000477413	PPP1R3F	Q6ZSY5	799 aa	Predicted RBP	27.91	■■■□□ 2.06
CNIH4-208	ENST00000477413	DOCK2	Q92608	1830 aa		27.9	■■■□□ 2.06
CNIH4-208	ENST00000477413	SPTY2D1	Q68D10	685 aa	Predicted RBP	27.9	■■■□□ 2.06
CNIH4-208	ENST00000477413	PANK1	Q8TE04	598 aa		27.9	■■■□□ 2.06
CNIH4-208	ENST00000477413	FAM151A	Q8WW52	585 aa		27.9	■■■□□ 2.06
CNIH4-208	ENST00000477413	ABHD8	Q96I13	439 aa		27.9	■■■□□ 2.06
CNIH4-208	ENST00000477413	HMG20B	Q9P0W2	317 aa		27.9	■■■□□ 2.06
CNIH4-208	ENST00000477413	ALDH1A1	P00352	501 aa		27.89	■■■□□ 2.06
CNIH4-208	ENST00000477413	GJA5	P36382	358 aa		27.89	■■■□□ 2.06
CNIH4-208	ENST00000477413	TNNI3K	Q59H18	835 aa		27.89	■■■□□ 2.06
CNIH4-208	ENST00000477413	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		27.89	■■■□□ 2.06
CNIH4-208	ENST00000477413	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		27.89	■■■□□ 2.06
CNIH4-208	ENST00000477413	TESPA1	A2RU30	521 aa	Predicted RBP	27.88	■■■□□ 2.05
CNIH4-208	ENST00000477413	MKRN3	Q13064	507 aa	Known RBP	27.88	■■■□□ 2.05
CNIH4-208	ENST00000477413	VGLL4	Q14135	290 aa		27.88	■■■□□ 2.05
CNIH4-208	ENST00000477413	SLF2	Q8IX21	1173 aa		27.88	■■■□□ 2.05
CNIH4-208	ENST00000477413	SPATA5	Q8NB90	893 aa		27.88	■■■□□ 2.05
CNIH4-208	ENST00000477413	ZNF512B	Q96KM6	892 aa	Predicted RBP	27.88	■■■□□ 2.05
CNIH4-208	ENST00000477413	IDI2	Q9BXS1	227 aa		27.88	■■■□□ 2.05
CNIH4-208	ENST00000477413	UQCRFS1P1	P0C7P4	283 aa		27.87	■■■□□ 2.05
CNIH4-208	ENST00000477413	MAP3K9	P80192	1104 aa		27.87	■■■□□ 2.05
CNIH4-208	ENST00000477413	FAM198A	Q9UFP1	575 aa		27.87	■■■□□ 2.05
CNIH4-208	ENST00000477413	ATRNL1	Q5VV63	1379 aa		27.86	■■■□□ 2.05
CNIH4-208	ENST00000477413	SURF6	O75683	361 aa	Known RBP	27.86	■■■□□ 2.05
CNIH4-208	ENST00000477413	MCAM	P43121	646 aa		27.86	■■■□□ 2.05
CNIH4-208	ENST00000477413	NFIA	Q12857	509 aa		27.86	■■■□□ 2.05
CNIH4-208	ENST00000477413	DCAF15	Q66K64	600 aa		27.86	■■■□□ 2.05
CNIH4-208	ENST00000477413	DZIP1	Q86YF9	867 aa	Known RBP	27.86	■■■□□ 2.05
CNIH4-208	ENST00000477413	IFNL1	Q8IU54	200 aa		27.86	■■■□□ 2.05
CNIH4-208	ENST00000477413	ZNF384	Q8TF68	577 aa		27.86	■■■□□ 2.05
CNIH4-208	ENST00000477413	MCOLN1	Q9GZU1	580 aa		27.86	■■■□□ 2.05
CNIH4-208	ENST00000477413	RCAN3	Q9UKA8	241 aa		27.86	■■■□□ 2.05
CNIH4-208	ENST00000477413	MROH7-TTC4	A0A0A0MT08	1334 aa		27.86	■■■□□ 2.05
CNIH4-208	ENST00000477413	IGSF3	O75054	1194 aa		27.85	■■■□□ 2.05
CNIH4-208	ENST00000477413	GORAB	Q5T7V8	394 aa		27.85	■■■□□ 2.05
CNIH4-208	ENST00000477413	ABCF2	Q9UG63	623 aa		27.85	■■■□□ 2.05
CNIH4-208	ENST00000477413	MECOM	Q03112	1051 aa		27.84	■■■□□ 2.05
CNIH4-208	ENST00000477413	PI16	Q6UXB8	463 aa		27.84	■■■□□ 2.05
CNIH4-208	ENST00000477413	ERICH6	Q7L0X2	663 aa		27.84	■■■□□ 2.05
CNIH4-208	ENST00000477413	OPTN	Q96CV9	577 aa		27.84	■■■□□ 2.05
CNIH4-208	ENST00000477413	DDX19B	Q9UMR2	479 aa		27.84	■■■□□ 2.05
CNIH4-208	ENST00000477413	CSAD	Q9Y600	493 aa		27.84	■■■□□ 2.05
CNIH4-208	ENST00000477413	COL2A1	P02458	1487 aa	Predicted RBP	27.83	■■■□□ 2.05
CNIH4-208	ENST00000477413	SPDYE5	A6NIY4	337 aa		27.83	■■■□□ 2.05
CNIH4-208	ENST00000477413	IGF2BP3	O00425	579 aa	Known RBP eCLIP	27.83	■■■□□ 2.05
CNIH4-208	ENST00000477413	ENTPD3	O75355	529 aa		27.83	■■■□□ 2.05
CNIH4-208	ENST00000477413	CAPN15	O75808	1086 aa		27.83	■■■□□ 2.05
CNIH4-208	ENST00000477413	MAP4K4	O95819	1239 aa	Predicted RBP	27.83	■■■□□ 2.05
CNIH4-208	ENST00000477413	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	27.83	■■■□□ 2.05
CNIH4-208	ENST00000477413	MS4A4A	Q96JQ5	239 aa		27.83	■■■□□ 2.05
CNIH4-208	ENST00000477413	ELP3	Q9H9T3	547 aa		27.83	■■■□□ 2.05
CNIH4-208	ENST00000477413	USP40	Q9NVE5	1235 aa		27.83	■■■□□ 2.05
CNIH4-208	ENST00000477413	SNCAIP	Q9Y6H5	919 aa		27.83	■■■□□ 2.05
CNIH4-208	ENST00000477413	AK9	Q5TCS8	1911 aa		27.82	■■■□□ 2.04
CNIH4-208	ENST00000477413	GPR75-ASB3	A0A0A6YYF3	556 aa		27.82	■■■□□ 2.04
CNIH4-208	ENST00000477413	NPM3	O75607	178 aa	Known RBP	27.82	■■■□□ 2.04
CNIH4-208	ENST00000477413	NSUN4	Q96CB9	384 aa	Known RBP	27.82	■■■□□ 2.04
CNIH4-208	ENST00000477413	WRNIP1	Q96S55	665 aa		27.82	■■■□□ 2.04
CNIH4-208	ENST00000477413	DBNDD2	Q9BQY9	259 aa		27.82	■■■□□ 2.04
CNIH4-208	ENST00000477413	ZBTB40	Q9NUA8	1239 aa		27.82	■■■□□ 2.04
CNIH4-208	ENST00000477413	ZNF112	Q9UJU3	913 aa		27.82	■■■□□ 2.04
CNIH4-208	ENST00000477413	GPR25	O00155	361 aa		27.81	■■■□□ 2.04
CNIH4-208	ENST00000477413	TBC1D8	O95759	1140 aa		27.81	■■■□□ 2.04
CNIH4-208	ENST00000477413	DGKZ	Q13574	1117 aa		27.81	■■■□□ 2.04
CNIH4-208	ENST00000477413	ZNF341	Q9BYN7	854 aa		27.81	■■■□□ 2.04
CNIH4-208	ENST00000477413	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	27.8	■■■□□ 2.04
CNIH4-208	ENST00000477413	RHBDL3	P58872	404 aa		27.8	■■■□□ 2.04
CNIH4-208	ENST00000477413	GSTO1	P78417	241 aa		27.8	■■■□□ 2.04
CNIH4-208	ENST00000477413	CTU1	Q7Z7A3	348 aa	Known RBP	27.8	■■■□□ 2.04
CNIH4-208	ENST00000477413	ERC1	Q8IUD2	1116 aa		27.8	■■■□□ 2.04
CNIH4-208	ENST00000477413	ZNF296	Q8WUU4	475 aa	Predicted RBP	27.8	■■■□□ 2.04
CNIH4-208	ENST00000477413	DBNL	Q9UJU6	430 aa	Known RBP	27.8	■■■□□ 2.04
CNIH4-208	ENST00000477413	FOCAD	Q5VW36	1801 aa		27.79	■■■□□ 2.04
CNIH4-208	ENST00000477413	BTD	P43251	543 aa		27.79	■■■□□ 2.04
CNIH4-208	ENST00000477413	CCDC158	Q5M9N0	1113 aa		27.79	■■■□□ 2.04
CNIH4-208	ENST00000477413	ERO1B	Q86YB8	467 aa		27.79	■■■□□ 2.04
CNIH4-208	ENST00000477413	CHMP4B	Q9H444	224 aa	Known RBP	27.79	■■■□□ 2.04
CNIH4-208	ENST00000477413	MYO5A	Q9Y4I1	1855 aa	Known RBP	27.78	■■■□□ 2.04
CNIH4-208	ENST00000477413	RGS3	P49796	1198 aa		27.78	■■■□□ 2.04
CNIH4-208	ENST00000477413	GTF2A2	P52657	109 aa		27.78	■■■□□ 2.04
CNIH4-208	ENST00000477413	MAP3K10	Q02779	954 aa		27.78	■■■□□ 2.04
CNIH4-208	ENST00000477413	TCP10	Q12799	353 aa		27.78	■■■□□ 2.04
CNIH4-208	ENST00000477413	PDE3A	Q14432	1141 aa		27.78	■■■□□ 2.04
CNIH4-208	ENST00000477413	NOL9	Q5SY16	702 aa	Known RBP	27.78	■■■□□ 2.04
CNIH4-208	ENST00000477413	RPAP2	Q8IXW5	612 aa	Predicted RBP	27.78	■■■□□ 2.04
CNIH4-208	ENST00000477413	PTPN18	Q99952	460 aa		27.78	■■■□□ 2.04
CNIH4-208	ENST00000477413	LDHC	P07864	332 aa		27.77	■■■□□ 2.04
CNIH4-208	ENST00000477413	HSP90AB4P	Q58FF6	505 aa		27.77	■■■□□ 2.04
CNIH4-208	ENST00000477413	TTC39A	Q5SRH9	613 aa		27.77	■■■□□ 2.04
CNIH4-208	ENST00000477413	OTUD7B	Q6GQQ9	843 aa		27.77	■■■□□ 2.04
CNIH4-208	ENST00000477413	CNKSR2	Q8WXI2	1034 aa		27.77	■■■□□ 2.04
CNIH4-208	ENST00000477413	EAF2	Q96CJ1	260 aa	Predicted RBP	27.77	■■■□□ 2.04
CNIH4-208	ENST00000477413	R3HDML	Q9H3Y0	253 aa		27.77	■■■□□ 2.04
CNIH4-208	ENST00000477413	CDK5RAP2	Q96SN8	1893 aa		27.76	■■■□□ 2.04
CNIH4-208	ENST00000477413	PPIL2	Q13356	520 aa		27.76	■■■□□ 2.03
CNIH4-208	ENST00000477413	TBC1D9	Q6ZT07	1266 aa		27.76	■■■□□ 2.03
CNIH4-208	ENST00000477413	ZFPM1	Q8IX07	1006 aa		27.76	■■■□□ 2.03

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