RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474231.5

DMD-222, Transcript of dystrophin, human

TSL 5 BASIC

Gene DMD, Length 5,209 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DMD-222	ENST00000474231	TULP1	O00294	542 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
DMD-222	ENST00000474231	HAND2	P61296	217 aa		7.31	□□□□□ -1.24
DMD-222	ENST00000474231	DNAJC21	Q5F1R6	531 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
DMD-222	ENST00000474231	CT47A1	Q5JQC4	288 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
DMD-222	ENST00000474231	CHST3	Q7LGC8	479 aa		7.31	□□□□□ -1.24
DMD-222	ENST00000474231	TMTC1	Q8IUR5	882 aa		7.31	□□□□□ -1.24
DMD-222	ENST00000474231	TECPR2	O15040	1411 aa		7.31	□□□□□ -1.24
DMD-222	ENST00000474231	MYO1C	O00159	1063 aa		7.31	□□□□□ -1.24
DMD-222	ENST00000474231	ATP2B1	P20020	1258 aa		7.31	□□□□□ -1.24
DMD-222	ENST00000474231	CDR1	P51861	262 aa		7.31	□□□□□ -1.24
DMD-222	ENST00000474231	KLHL10	Q6JEL2	608 aa		7.31	□□□□□ -1.24
DMD-222	ENST00000474231	IGSF22	Q8N9C0	903 aa		7.31	□□□□□ -1.24
DMD-222	ENST00000474231	RGS22	Q8NE09	1264 aa		7.31	□□□□□ -1.24
DMD-222	ENST00000474231	NOC3L	Q8WTT2	800 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
DMD-222	ENST00000474231	C19orf44	Q9H6X5	657 aa		7.31	□□□□□ -1.24
DMD-222	ENST00000474231	ST7	Q9NRC1	585 aa		7.31	□□□□□ -1.24
DMD-222	ENST00000474231		G3V3G9	751 aa		7.31	□□□□□ -1.24
DMD-222	ENST00000474231	PLA2G4A	P47712	749 aa		7.31	□□□□□ -1.24
DMD-222	ENST00000474231	DCAF8	Q5TAQ9	597 aa		7.31	□□□□□ -1.24
DMD-222	ENST00000474231	FANCL	Q9NW38	375 aa		7.31	□□□□□ -1.24
DMD-222	ENST00000474231	CWC25	Q9NXE8	425 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
DMD-222	ENST00000474231	MYO1A	Q9UBC5	1043 aa		7.31	□□□□□ -1.24
DMD-222	ENST00000474231	DBNL	Q9UJU6	430 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
DMD-222	ENST00000474231	ADAM21	Q9UKJ8	722 aa		7.31	□□□□□ -1.24
DMD-222	ENST00000474231	MRFAP1	Q9Y605	127 aa		7.31	□□□□□ -1.24
DMD-222	ENST00000474231	RHOXF2B	P0C7M4	288 aa		7.3	□□□□□ -1.24
DMD-222	ENST00000474231	HSPD1	P10809	573 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
DMD-222	ENST00000474231	PNOC	Q13519	176 aa		7.3	□□□□□ -1.24
DMD-222	ENST00000474231	POSTN	Q15063	836 aa		7.3	□□□□□ -1.24
DMD-222	ENST00000474231	CCDC93	Q567U6	631 aa		7.3	□□□□□ -1.24
DMD-222	ENST00000474231	RILPL1	Q5EBL4	403 aa		7.3	□□□□□ -1.24
DMD-222	ENST00000474231	LMBR1L	Q6UX01	489 aa		7.3	□□□□□ -1.24
DMD-222	ENST00000474231	EDC3	Q96F86	508 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
DMD-222	ENST00000474231	RPGRIP1	Q96KN7	1286 aa		7.3	□□□□□ -1.24
DMD-222	ENST00000474231	RHOXF2	Q9BQY4	288 aa		7.3	□□□□□ -1.24
DMD-222	ENST00000474231	GPR108	Q9NPR9	543 aa		7.3	□□□□□ -1.24
DMD-222	ENST00000474231	EBAG9	O00559	213 aa		7.3	□□□□□ -1.24
DMD-222	ENST00000474231	EIF5	P55010	431 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
DMD-222	ENST00000474231	NCAPD2	Q15021	1401 aa		7.3	□□□□□ -1.24
DMD-222	ENST00000474231	ZMYM1	Q5SVZ6	1142 aa		7.3	□□□□□ -1.24
DMD-222	ENST00000474231	OTUD7B	Q6GQQ9	843 aa		7.3	□□□□□ -1.24
DMD-222	ENST00000474231	CCDC91	Q7Z6B0	441 aa		7.3	□□□□□ -1.24
DMD-222	ENST00000474231	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		7.3	□□□□□ -1.24
DMD-222	ENST00000474231	N4BP3	O15049	544 aa		7.3	□□□□□ -1.24
DMD-222	ENST00000474231	OPA1	O60313	960 aa		7.3	□□□□□ -1.24
DMD-222	ENST00000474231	TMEM67	Q5HYA8	995 aa		7.3	□□□□□ -1.24
DMD-222	ENST00000474231	CCDC181	Q5TID7	509 aa		7.3	□□□□□ -1.24
DMD-222	ENST00000474231	CYP26C1	Q6V0L0	522 aa		7.3	□□□□□ -1.24
DMD-222	ENST00000474231	PLCD3	Q8N3E9	789 aa		7.3	□□□□□ -1.24
DMD-222	ENST00000474231	TMEM87B	Q96K49	555 aa		7.3	□□□□□ -1.24
DMD-222	ENST00000474231	PANX2	Q96RD6	677 aa		7.3	□□□□□ -1.24
DMD-222	ENST00000474231	PDE11A	Q9HCR9	933 aa		7.3	□□□□□ -1.24
DMD-222	ENST00000474231	RMND1	Q9NWS8	449 aa		7.3	□□□□□ -1.24
DMD-222	ENST00000474231	FEZ2	Q9UHY8	353 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
DMD-222	ENST00000474231		A0A087WWV3	80 aa		7.3	□□□□□ -1.24
DMD-222	ENST00000474231	CABP4	P57796	275 aa		7.3	□□□□□ -1.24
DMD-222	ENST00000474231	KRT83	P78385	493 aa		7.3	□□□□□ -1.24
DMD-222	ENST00000474231	MICU3	Q86XE3	530 aa		7.3	□□□□□ -1.24
DMD-222	ENST00000474231	FAM76A	Q8TAV0	307 aa		7.3	□□□□□ -1.24
DMD-222	ENST00000474231	SLC26A6	Q9BXS9	759 aa		7.3	□□□□□ -1.24
DMD-222	ENST00000474231	TBX22	Q9Y458	520 aa		7.3	□□□□□ -1.24
DMD-222	ENST00000474231	MAP3K9	P80192	1104 aa		7.29	□□□□□ -1.24
DMD-222	ENST00000474231	KRT40	Q6A162	431 aa		7.29	□□□□□ -1.24
DMD-222	ENST00000474231	AIDA	Q96BJ3	306 aa		7.29	□□□□□ -1.24
DMD-222	ENST00000474231	SEC62	Q99442	399 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
DMD-222	ENST00000474231	ANGEL1	Q9UNK9	670 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
DMD-222	ENST00000474231	KCNQ3	O43525	872 aa		7.29	□□□□□ -1.24
DMD-222	ENST00000474231	ERCC5	P28715	1186 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
DMD-222	ENST00000474231	MAGEA9	P43362	315 aa		7.29	□□□□□ -1.24
DMD-222	ENST00000474231	ADK	P55263	362 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
DMD-222	ENST00000474231	KIF23	Q02241	960 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
DMD-222	ENST00000474231	HSP90AA4P	Q58FG1	418 aa		7.29	□□□□□ -1.24
DMD-222	ENST00000474231	VPS37D	Q86XT2	251 aa		7.29	□□□□□ -1.24
DMD-222	ENST00000474231	POTED	Q86YR6	584 aa		7.29	□□□□□ -1.24
DMD-222	ENST00000474231	ENOX1	Q8TC92	643 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
DMD-222	ENST00000474231	CNNM2	Q9H8M5	875 aa		7.29	□□□□□ -1.24
DMD-222	ENST00000474231	IFIT3	O14879	490 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
DMD-222	ENST00000474231	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
DMD-222	ENST00000474231	EFCAB13	Q8IY85	973 aa		7.29	□□□□□ -1.24
DMD-222	ENST00000474231	TMTC2	Q8N394	836 aa		7.29	□□□□□ -1.24
DMD-222	ENST00000474231	DHX58	Q96C10	678 aa		7.29	□□□□□ -1.24
DMD-222	ENST00000474231	WWC3	Q9ULE0	1092 aa		7.29	□□□□□ -1.24
DMD-222	ENST00000474231	PARP3	Q9Y6F1	533 aa		7.29	□□□□□ -1.24
DMD-222	ENST00000474231	ZMYM6	O95789	1325 aa		7.29	□□□□□ -1.24
DMD-222	ENST00000474231	ZBTB22	O15209	634 aa		7.29	□□□□□ -1.24
DMD-222	ENST00000474231	USO1	O60763	962 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
DMD-222	ENST00000474231	CALR	P27797	417 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
DMD-222	ENST00000474231	SPA17	Q15506	151 aa		7.29	□□□□□ -1.24
DMD-222	ENST00000474231	MICALL1	Q8N3F8	863 aa		7.29	□□□□□ -1.24
DMD-222	ENST00000474231	LUC7L	Q9NQ29	371 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
DMD-222	ENST00000474231	ZNF446	Q9NWS9	450 aa		7.29	□□□□□ -1.24
DMD-222	ENST00000474231	GOLGA6L10	A6NI86	522 aa		7.28	□□□□□ -1.24
DMD-222	ENST00000474231	KRT86	O43790	486 aa		7.28	□□□□□ -1.24
DMD-222	ENST00000474231	ATP1A3	P13637	1013 aa		7.28	□□□□□ -1.24
DMD-222	ENST00000474231	CYLC1	P35663	651 aa	Predicted RBP	7.28	□□□□□ -1.24
DMD-222	ENST00000474231	PLCD1	P51178	756 aa		7.28	□□□□□ -1.24
DMD-222	ENST00000474231	EXOSC10	Q01780	885 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
DMD-222	ENST00000474231	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		7.28	□□□□□ -1.24
DMD-222	ENST00000474231	RAB11FIP4	Q86YS3	637 aa		7.28	□□□□□ -1.24
DMD-222	ENST00000474231	APPBP2	Q92624	585 aa		7.28	□□□□□ -1.24

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.8 ms