RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468234.1

SERINC3-204, Transcript of serine incorporator 3, human

TSL 2

Gene SERINC3, Length 393 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SERINC3-204	ENST00000468234	ZMYM1	Q5SVZ6	1142 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SERINC3-204	ENST00000468234	APOBEC3H	Q6NTF7	200 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
SERINC3-204	ENST00000468234	CASC1	Q6TDU7	716 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SERINC3-204	ENST00000468234	SAMD7	Q7Z3H4	446 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SERINC3-204	ENST00000468234	ZNF384	Q8TF68	577 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SERINC3-204	ENST00000468234	ZC3H15	Q8WU90	426 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
SERINC3-204	ENST00000468234	RUFY2	Q8WXA3	655 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SERINC3-204	ENST00000468234	APPBP2	Q92624	585 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SERINC3-204	ENST00000468234	TAF1D	Q9H5J8	278 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
SERINC3-204	ENST00000468234	DAGLA	Q9Y4D2	1042 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SERINC3-204	ENST00000468234	MAGEB6P1	A0A0J9YX57	407 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SERINC3-204	ENST00000468234	WNT10B	O00744	389 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SERINC3-204	ENST00000468234	MFAP1	P55081	439 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
SERINC3-204	ENST00000468234	TBC1D10B	Q4KMP7	808 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
SERINC3-204	ENST00000468234	RBM26	Q5T8P6	1007 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
SERINC3-204	ENST00000468234	PRMT6	Q96LA8	375 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
SERINC3-204	ENST00000468234	DIAPH3	Q9NSV4	1193 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SERINC3-204	ENST00000468234	USP40	Q9NVE5	1235 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SERINC3-204	ENST00000468234	MYH13	Q9UKX3	1938 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SERINC3-204	ENST00000468234	SHTN1	A0MZ66	631 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SERINC3-204	ENST00000468234	EIF5B	O60841	1220 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
SERINC3-204	ENST00000468234	NPM3	O75607	178 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
SERINC3-204	ENST00000468234	CHML	P26374	656 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SERINC3-204	ENST00000468234	BTD	P43251	543 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SERINC3-204	ENST00000468234	MCMDC2	Q4G0Z9	681 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SERINC3-204	ENST00000468234	FKBP1C	Q5VVH2	108 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SERINC3-204	ENST00000468234	AIDA	Q96BJ3	306 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SERINC3-204	ENST00000468234	TMOD2	Q9NZR1	351 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SERINC3-204	ENST00000468234	PGAP2	Q9UHJ9	254 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SERINC3-204	ENST00000468234	PITPNM2	Q9BZ72	1349 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SERINC3-204	ENST00000468234	CDC45	O75419	566 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SERINC3-204	ENST00000468234	GNAT2	P19087	354 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SERINC3-204	ENST00000468234	HIRA	P54198	1017 aa	Predicted RBP	11.71	□□□□□ -0.53
SERINC3-204	ENST00000468234	NBPF9	Q3BBW0	867 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SERINC3-204	ENST00000468234	SPDYE2	Q495Y8	402 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SERINC3-204	ENST00000468234	CDC42EP5	Q6NZY7	148 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SERINC3-204	ENST00000468234	ADGRA1	Q86SQ6	560 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SERINC3-204	ENST00000468234	TRPM4	Q8TD43	1214 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SERINC3-204	ENST00000468234	OSBP2	Q969R2	916 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SERINC3-204	ENST00000468234	RIOK1	Q9BRS2	568 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.53
SERINC3-204	ENST00000468234	TDRD3	Q9H7E2	651 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.53
SERINC3-204	ENST00000468234	AATF	Q9NY61	560 aa	Known RBP eCLIP	11.71	□□□□□ -0.53
SERINC3-204	ENST00000468234	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	11.71	□□□□□ -0.53
SERINC3-204	ENST00000468234	ZNF646	O15015	1829 aa	Predicted RBP	11.71	□□□□□ -0.54
SERINC3-204	ENST00000468234	RPAP1	Q9BWH6	1393 aa	Predicted RBP	11.7	□□□□□ -0.54
SERINC3-204	ENST00000468234	SCN4A	P35499	1836 aa		11.7	□□□□□ -0.54
SERINC3-204	ENST00000468234	RAD50	Q92878	1312 aa		11.7	□□□□□ -0.54
SERINC3-204	ENST00000468234	EGFR	P00533	1210 aa		11.7	□□□□□ -0.54
SERINC3-204	ENST00000468234	TNNI2	P48788	182 aa		11.7	□□□□□ -0.54
SERINC3-204	ENST00000468234	RHBDL3	P58872	404 aa		11.7	□□□□□ -0.54
SERINC3-204	ENST00000468234	NMI	Q13287	307 aa	Predicted RBP	11.7	□□□□□ -0.54
SERINC3-204	ENST00000468234	TNFAIP1	Q13829	316 aa		11.7	□□□□□ -0.54
SERINC3-204	ENST00000468234	LDHD	Q86WU2	507 aa		11.7	□□□□□ -0.54
SERINC3-204	ENST00000468234	APOBEC3F	Q8IUX4	373 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
SERINC3-204	ENST00000468234	TEX11	Q8IYF3	940 aa		11.7	□□□□□ -0.54
SERINC3-204	ENST00000468234	MIGA1	Q8NAN2	632 aa		11.7	□□□□□ -0.54
SERINC3-204	ENST00000468234	DCPS	Q96C86	337 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
SERINC3-204	ENST00000468234	STRBP	Q96SI9	672 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
SERINC3-204	ENST00000468234	IDI2	Q9BXS1	227 aa		11.7	□□□□□ -0.54
SERINC3-204	ENST00000468234	CRNKL1	Q9BZJ0	848 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
SERINC3-204	ENST00000468234	PUS7L	Q9H0K6	701 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
SERINC3-204	ENST00000468234	PATL2	C9JE40	543 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
SERINC3-204	ENST00000468234	GPAA1	O43292	621 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SERINC3-204	ENST00000468234	ENTPD3	O75355	529 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SERINC3-204	ENST00000468234	MBD4	O95243	580 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SERINC3-204	ENST00000468234	DYNLL1	P63167	89 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
SERINC3-204	ENST00000468234	EAPP	Q56P03	285 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
SERINC3-204	ENST00000468234	GIMAP6	Q6P9H5	292 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SERINC3-204	ENST00000468234	CWC27	Q6UX04	472 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
SERINC3-204	ENST00000468234	FAM83A	Q86UY5	434 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SERINC3-204	ENST00000468234	SH3RF3	Q8TEJ3	882 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
SERINC3-204	ENST00000468234	DDRGK1	Q96HY6	314 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SERINC3-204	ENST00000468234	FAM227B	Q96M60	508 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SERINC3-204	ENST00000468234	ATP8A2	Q9NTI2	1148 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SERINC3-204	ENST00000468234	CLEC11A	Q9Y240	323 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SERINC3-204	ENST00000468234	PCDHAC2	Q9Y5I4	1007 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SERINC3-204	ENST00000468234	DOCK2	Q92608	1830 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SERINC3-204	ENST00000468234		A0A0D9SFI3	127 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SERINC3-204	ENST00000468234		M0R2C6	588 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SERINC3-204	ENST00000468234	CHGB	P05060	677 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SERINC3-204	ENST00000468234	USP5	P45974	858 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SERINC3-204	ENST00000468234	SLFNL1	Q499Z3	407 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SERINC3-204	ENST00000468234	ANGEL2	Q5VTE6	544 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
SERINC3-204	ENST00000468234	LCORL	Q8N3X6	602 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SERINC3-204	ENST00000468234	SEC62	Q99442	399 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
SERINC3-204	ENST00000468234	NACAP1	Q9BZK3	213 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SERINC3-204	ENST00000468234	ARMT1	Q9H993	441 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SERINC3-204	ENST00000468234	VEZT	Q9HBM0	779 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SERINC3-204	ENST00000468234	PPP2R3B	Q9Y5P8	575 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SERINC3-204	ENST00000468234	SLC4A4	Q9Y6R1	1079 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SERINC3-204	ENST00000468234	CCDC171	Q6TFL3	1326 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SERINC3-204	ENST00000468234	CLRN2	A0PK11	232 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SERINC3-204	ENST00000468234	FOXN1	O15353	648 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SERINC3-204	ENST00000468234	SGSM2	O43147	1006 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SERINC3-204	ENST00000468234	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
SERINC3-204	ENST00000468234	ALX1	Q15699	326 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SERINC3-204	ENST00000468234	KIAA1211	Q6ZU35	1233 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SERINC3-204	ENST00000468234	CDC37L1	Q7L3B6	337 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SERINC3-204	ENST00000468234	SULF1	Q8IWU6	871 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SERINC3-204	ENST00000468234	TGFBRAP1	Q8WUH2	860 aa		11.67	□□□□□ -0.54

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