RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468031.1

NME4-210, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 4, humanhuman

TSL 2

Gene NME4, Length 1,861 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME4-210ENST00000468031 NFIXQ14938 502 aa21.98■■□□□ 1.11
NME4-210ENST00000468031 MFSD6Q6ZSS7 791 aa21.98■■□□□ 1.11
NME4-210ENST00000468031 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa21.97■■□□□ 1.11
NME4-210ENST00000468031 ADD1P35611 737 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
NME4-210ENST00000468031 APOA5Q6Q788 366 aa21.97■■□□□ 1.11
NME4-210ENST00000468031 ADGRA1Q86SQ6 560 aa21.97■■□□□ 1.11
NME4-210ENST00000468031 MIGA1Q8NAN2 632 aa21.97■■□□□ 1.11
NME4-210ENST00000468031 NKX2-3Q8TAU0 364 aa21.97■■□□□ 1.11
NME4-210ENST00000468031 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
NME4-210ENST00000468031 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa21.96■■□□□ 1.11
NME4-210ENST00000468031 CDKL5O76039 1030 aa21.96■■□□□ 1.11
NME4-210ENST00000468031 CTDSPL2Q05D32 466 aa21.96■■□□□ 1.11
NME4-210ENST00000468031 SLC27A3Q5K4L6 730 aa21.96■■□□□ 1.11
NME4-210ENST00000468031 PDLIM2Q96JY6 352 aa21.96■■□□□ 1.11
NME4-210ENST00000468031 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
NME4-210ENST00000468031 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
NME4-210ENST00000468031 LY9Q9HBG7 655 aa21.96■■□□□ 1.11
NME4-210ENST00000468031 ANAPC4Q9UJX5 808 aa21.96■■□□□ 1.11
NME4-210ENST00000468031 IGSF3O75054 1194 aa21.96■■□□□ 1.11
NME4-210ENST00000468031 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
NME4-210ENST00000468031 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP21.96■■□□□ 1.112e-6■□□□□ 11.1
NME4-210ENST00000468031 CNBD1Q8NA66 436 aa21.96■■□□□ 1.11
NME4-210ENST00000468031 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
NME4-210ENST00000468031 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
NME4-210ENST00000468031 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
NME4-210ENST00000468031 NID2Q14112 1375 aa21.96■■□□□ 1.11
NME4-210ENST00000468031 MAST2Q6P0Q8 1798 aa21.95■■□□□ 1.1
NME4-210ENST00000468031 NPHP1O15259 732 aa21.95■■□□□ 1.1
NME4-210ENST00000468031 ZSWIM5Q9P217 1185 aa21.95■■□□□ 1.1
NME4-210ENST00000468031 RCOR1Q9UKL0 485 aa21.95■■□□□ 1.1
NME4-210ENST00000468031 IRS2Q9Y4H2 1338 aa21.95■■□□□ 1.1
NME4-210ENST00000468031 GRAPQ13588 217 aa21.94■■□□□ 1.1
NME4-210ENST00000468031 TMEM67Q5HYA8 995 aa21.94■■□□□ 1.1
NME4-210ENST00000468031 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
NME4-210ENST00000468031 CCDC24Q8N4L8 307 aa21.94■■□□□ 1.1
NME4-210ENST00000468031 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa21.94■■□□□ 1.1
NME4-210ENST00000468031 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
NME4-210ENST00000468031 C8orf76Q96K31 380 aa21.94■■□□□ 1.1
NME4-210ENST00000468031 FUCA2Q9BTY2 467 aa21.94■■□□□ 1.1
NME4-210ENST00000468031 TACC3Q9Y6A5 838 aa21.94■■□□□ 1.1
NME4-210ENST00000468031 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
NME4-210ENST00000468031 ZBTB43O43298 467 aa21.94■■□□□ 1.1
NME4-210ENST00000468031 KDM4AO75164 1064 aa21.94■■□□□ 1.1
NME4-210ENST00000468031 KLRK1P26718 216 aa21.94■■□□□ 1.1
NME4-210ENST00000468031 UVSSAQ2YD98 709 aa21.94■■□□□ 1.1
NME4-210ENST00000468031 GIMAP6Q6P9H5 292 aa21.94■■□□□ 1.1
NME4-210ENST00000468031 PGBD1Q96JS3 809 aa21.94■■□□□ 1.1
NME4-210ENST00000468031 BRIP1Q9BX63 1249 aa21.94■■□□□ 1.1
NME4-210ENST00000468031 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
NME4-210ENST00000468031 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
NME4-210ENST00000468031 PPARAQ07869 468 aa21.93■■□□□ 1.1
NME4-210ENST00000468031 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
NME4-210ENST00000468031 LIG1P18858 919 aa21.92■■□□□ 1.1
NME4-210ENST00000468031 FOSBP53539 338 aa21.92■■□□□ 1.1
NME4-210ENST00000468031 SART3Q15020 963 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
NME4-210ENST00000468031 TPRNQ4KMQ1 711 aa21.92■■□□□ 1.1
NME4-210ENST00000468031 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
NME4-210ENST00000468031 NUP62CLQ9H1M0 184 aa21.92■■□□□ 1.1
NME4-210ENST00000468031 LEMD3Q9Y2U8 911 aa21.92■■□□□ 1.1
NME4-210ENST00000468031 RCAN1P53805 252 aa21.92■■□□□ 1.1
NME4-210ENST00000468031 NFXL1Q6ZNB6 911 aa21.92■■□□□ 1.1
NME4-210ENST00000468031 RNF214Q8ND24 703 aa21.92■■□□□ 1.1
NME4-210ENST00000468031 ZNF384Q8TF68 577 aa21.92■■□□□ 1.1
NME4-210ENST00000468031 INCENPQ9NQS7 918 aa21.92■■□□□ 1.1
NME4-210ENST00000468031 GUCY1B3Q02153 619 aa21.91■■□□□ 1.1
NME4-210ENST00000468031 PRR5LQ6MZQ0 368 aa21.91■■□□□ 1.1
NME4-210ENST00000468031 BRAPQ7Z569 592 aa21.91■■□□□ 1.1
NME4-210ENST00000468031 SENP2Q9HC62 589 aa21.91■■□□□ 1.1
NME4-210ENST00000468031 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa21.9■■□□□ 1.1
NME4-210ENST00000468031 CCDC69A6NI79 296 aa21.9■■□□□ 1.1
NME4-210ENST00000468031 PPFIA3O75145 1194 aa21.9■■□□□ 1.1
NME4-210ENST00000468031 PCP11498 1178 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
NME4-210ENST00000468031 GYS1P13807 737 aa21.9■■□□□ 1.1
NME4-210ENST00000468031 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa21.9■■□□□ 1.1
NME4-210ENST00000468031 TMTC2Q8N394 836 aa21.9■■□□□ 1.1
NME4-210ENST00000468031 SDR42E1Q8WUS8 393 aa21.9■■□□□ 1.1
NME4-210ENST00000468031 USP28Q96RU2 1077 aa21.9■■□□□ 1.1
NME4-210ENST00000468031 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
NME4-210ENST00000468031 SLC12A7Q9Y666 1083 aa21.9■■□□□ 1.1
NME4-210ENST00000468031 GOLGA8AA7E2F4 631 aa21.9■■□□□ 1.1
NME4-210ENST00000468031 NTRK3Q16288 839 aa21.9■■□□□ 1.1
NME4-210ENST00000468031 HS1BP3Q53T59 392 aa21.9■■□□□ 1.1
NME4-210ENST00000468031 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
NME4-210ENST00000468031 KRT27Q7Z3Y8 459 aa21.9■■□□□ 1.1
NME4-210ENST00000468031 MICU3Q86XE3 530 aa21.9■■□□□ 1.1
NME4-210ENST00000468031 BICD2Q8TD16 824 aa21.9■■□□□ 1.1
NME4-210ENST00000468031 DACT1Q9NYF0 836 aa21.9■■□□□ 1.1
NME4-210ENST00000468031 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa21.9■■□□□ 1.1
NME4-210ENST00000468031 BRWD3Q6RI45 1802 aa21.9■■□□□ 1.1
NME4-210ENST00000468031 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa21.89■■□□□ 1.1
NME4-210ENST00000468031 STK36Q9NRP7 1315 aa21.89■■□□□ 1.1
NME4-210ENST00000468031 CDC27P30260 824 aa21.89■■□□□ 1.09
NME4-210ENST00000468031 MECOMQ03112 1051 aa21.89■■□□□ 1.09
NME4-210ENST00000468031 MAP3K11Q16584 847 aa21.89■■□□□ 1.09
NME4-210ENST00000468031 CRY2Q49AN0 593 aa21.89■■□□□ 1.09
NME4-210ENST00000468031 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa21.89■■□□□ 1.09
NME4-210ENST00000468031 XDHP47989 1333 aa21.89■■□□□ 1.09
NME4-210ENST00000468031 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
NME4-210ENST00000468031 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
NME4-210ENST00000468031 CLSTN2Q9H4D0 955 aa21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.5 ms