RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466222.6

CAPN3-209, Transcript of calpain 3, humanhuman

TSL 2

Gene CAPN3, Length 1,934 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3-209ENST00000466222 ANAPC15P60006 121 aa22.12■■□□□ 1.13
CAPN3-209ENST00000466222 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
CAPN3-209ENST00000466222 IARSP41252 1262 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
CAPN3-209ENST00000466222 SCNN1DP51172 638 aa22.11■■□□□ 1.13
CAPN3-209ENST00000466222 STRIP1Q5VSL9 837 aa22.11■■□□□ 1.13
CAPN3-209ENST00000466222 USP17L3A6NCW0 530 aa22.1■■□□□ 1.13
CAPN3-209ENST00000466222 USP17L4A6NCW7 530 aa22.1■■□□□ 1.13
CAPN3-209ENST00000466222 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
CAPN3-209ENST00000466222 USP17L1Q7RTZ2 530 aa22.1■■□□□ 1.13
CAPN3-209ENST00000466222 KIAA0825Q8IV33 1275 aa22.1■■□□□ 1.13
CAPN3-209ENST00000466222 SMIM22K7EJ46 135 aa22.1■■□□□ 1.13
CAPN3-209ENST00000466222 NEK4P51957 841 aa22.1■■□□□ 1.13
CAPN3-209ENST00000466222 STOX1Q6ZVD7 989 aa22.1■■□□□ 1.13
CAPN3-209ENST00000466222 IFNL3Q8IZI9 196 aa22.1■■□□□ 1.13
CAPN3-209ENST00000466222 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
CAPN3-209ENST00000466222 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
CAPN3-209ENST00000466222 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
CAPN3-209ENST00000466222 IL17RAQ96F46 866 aa22.09■■□□□ 1.13
CAPN3-209ENST00000466222 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa22.09■■□□□ 1.13
CAPN3-209ENST00000466222 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa22.08■■□□□ 1.12
CAPN3-209ENST00000466222 DOCK2Q92608 1830 aa22.08■■□□□ 1.12
CAPN3-209ENST00000466222 CASTP20810 708 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
CAPN3-209ENST00000466222 RNF20Q5VTR2 975 aa22.08■■□□□ 1.12
CAPN3-209ENST00000466222 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.12
CAPN3-209ENST00000466222 GRPEL1Q9HAV7 217 aa22.08■■□□□ 1.12
CAPN3-209ENST00000466222 BTDP43251 543 aa22.07■■□□□ 1.12
CAPN3-209ENST00000466222 GSTO1P78417 241 aa22.07■■□□□ 1.12
CAPN3-209ENST00000466222 EVX2Q03828 476 aa22.07■■□□□ 1.12
CAPN3-209ENST00000466222 INCENPQ9NQS7 918 aa22.07■■□□□ 1.12
CAPN3-209ENST00000466222 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
CAPN3-209ENST00000466222 PSMD14O00487 310 aa22.06■■□□□ 1.12
CAPN3-209ENST00000466222 NIM1KQ8IY84 436 aa22.06■■□□□ 1.12
CAPN3-209ENST00000466222 TCEANC2Q96MN5 208 aa22.06■■□□□ 1.12
CAPN3-209ENST00000466222 NBPF3Q9H094 633 aa22.06■■□□□ 1.12
CAPN3-209ENST00000466222 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa22.06■■□□□ 1.12
CAPN3-209ENST00000466222 STK11IPQ8N1F8 1099 aa22.06■■□□□ 1.12
CAPN3-209ENST00000466222 NKX2-3Q8TAU0 364 aa22.06■■□□□ 1.12
CAPN3-209ENST00000466222 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
CAPN3-209ENST00000466222 ZNRF3Q9ULT6 936 aa22.06■■□□□ 1.12
CAPN3-209ENST00000466222 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa22.05■■□□□ 1.12
CAPN3-209ENST00000466222 GNAT2P19087 354 aa22.05■■□□□ 1.12
CAPN3-209ENST00000466222 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa22.05■■□□□ 1.12
CAPN3-209ENST00000466222 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
CAPN3-209ENST00000466222 NAPBQ9H115 298 aa22.05■■□□□ 1.12
CAPN3-209ENST00000466222 FOXD4L1Q9NU39 408 aa22.05■■□□□ 1.12
CAPN3-209ENST00000466222 CTNNA3Q9UI47 895 aa22.05■■□□□ 1.12
CAPN3-209ENST00000466222 CHD4Q14839 1912 aa22.05■■□□□ 1.12
CAPN3-209ENST00000466222 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa22.04■■□□□ 1.12
CAPN3-209ENST00000466222 ZNF213O14771 459 aa22.04■■□□□ 1.12
CAPN3-209ENST00000466222 TDO2P48775 406 aa22.04■■□□□ 1.12
CAPN3-209ENST00000466222 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
CAPN3-209ENST00000466222 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa22.04■■□□□ 1.12
CAPN3-209ENST00000466222 TSGA10IPQ3SY00 556 aa22.04■■□□□ 1.12
CAPN3-209ENST00000466222 TACC3Q9Y6A5 838 aa22.04■■□□□ 1.12
CAPN3-209ENST00000466222 E7EWF7 191 aa22.04■■□□□ 1.12
CAPN3-209ENST00000466222 BAG4O95429 457 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
CAPN3-209ENST00000466222 LDHCP07864 332 aa22.04■■□□□ 1.12
CAPN3-209ENST00000466222 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP22.04■■□□□ 1.12
CAPN3-209ENST00000466222 MCM2P49736 904 aa22.04■■□□□ 1.12
CAPN3-209ENST00000466222 CXCL9Q07325 125 aa22.04■■□□□ 1.12
CAPN3-209ENST00000466222 TBC1D10CQ8IV04 446 aa22.04■■□□□ 1.12
CAPN3-209ENST00000466222 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
CAPN3-209ENST00000466222 VPS33BQ9H267 617 aa22.04■■□□□ 1.12
CAPN3-209ENST00000466222 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa22.04■■□□□ 1.12
CAPN3-209ENST00000466222 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa22.04■■□□□ 1.12
CAPN3-209ENST00000466222 GAKO14976 1311 aa22.03■■□□□ 1.12
CAPN3-209ENST00000466222 PPP4CP60510 307 aa22.03■■□□□ 1.12
CAPN3-209ENST00000466222 CTDSPL2Q05D32 466 aa22.03■■□□□ 1.12
CAPN3-209ENST00000466222 ALX1Q15699 326 aa22.03■■□□□ 1.12
CAPN3-209ENST00000466222 KLHL40Q2TBA0 621 aa22.03■■□□□ 1.12
CAPN3-209ENST00000466222 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
CAPN3-209ENST00000466222 BAG3O95817 575 aa22.02■■□□□ 1.12
CAPN3-209ENST00000466222 RHBDL3P58872 404 aa22.02■■□□□ 1.12
CAPN3-209ENST00000466222 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa22.02■■□□□ 1.12
CAPN3-209ENST00000466222 JDP2Q8WYK2 163 aa22.02■■□□□ 1.12
CAPN3-209ENST00000466222 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
CAPN3-209ENST00000466222 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
CAPN3-209ENST00000466222 VIL1P09327 827 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.11
CAPN3-209ENST00000466222 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.11
CAPN3-209ENST00000466222 NEK1Q96PY6 1258 aa22.02■■□□□ 1.11
CAPN3-209ENST00000466222 NACAP1Q9BZK3 213 aa22.02■■□□□ 1.11
CAPN3-209ENST00000466222 CRKP46108 304 aa22.01■■□□□ 1.11
CAPN3-209ENST00000466222 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
CAPN3-209ENST00000466222 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
CAPN3-209ENST00000466222 RUFY3Q7L099 469 aa22.01■■□□□ 1.11
CAPN3-209ENST00000466222 CHST3Q7LGC8 479 aa22.01■■□□□ 1.11
CAPN3-209ENST00000466222 TTC14Q96N46 770 aa22.01■■□□□ 1.11
CAPN3-209ENST00000466222 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
CAPN3-209ENST00000466222 SCN9AQ15858 1988 aa22■■□□□ 1.11
CAPN3-209ENST00000466222 MINDY4BA8MYZ0 360 aa22■■□□□ 1.11
CAPN3-209ENST00000466222 USP17L12C9JPN9 530 aa22■■□□□ 1.11
CAPN3-209ENST00000466222 USP17L21D6R901 530 aa22■■□□□ 1.11
CAPN3-209ENST00000466222 CYP2D6P10635 497 aa22■■□□□ 1.11
CAPN3-209ENST00000466222 CTR9Q6PD62 1173 aa22■■□□□ 1.11
CAPN3-209ENST00000466222 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
CAPN3-209ENST00000466222 TM6SF1Q9BZW5 370 aa22■■□□□ 1.11
CAPN3-209ENST00000466222 LTBP3Q9NS15 1303 aa22■■□□□ 1.11
CAPN3-209ENST00000466222 IGSF3O75054 1194 aa22■■□□□ 1.11
CAPN3-209ENST00000466222 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP22■■□□□ 1.11
CAPN3-209ENST00000466222 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa22■■□□□ 1.11
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