RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 CARMIL3Q8ND23 1372 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRC-210ENST00000462363 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
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PTPRC-210ENST00000462363 GOLGA6L22H0YM25 854 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRC-210ENST00000462363 JAK2O60674 1132 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRC-210ENST00000462363 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
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PTPRC-210ENST00000462363 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRC-210ENST00000462363 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
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PTPRC-210ENST00000462363 TMEM63CQ9P1W3 806 aa6.7□□□□□ -1.34
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PTPRC-210ENST00000462363 FAM177BA6PVY3 158 aa6.69□□□□□ -1.34
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PTPRC-210ENST00000462363 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
PTPRC-210ENST00000462363 IFNL3Q8IZI9 196 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRC-210ENST00000462363 LCORLQ8N3X6 602 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRC-210ENST00000462363 MAGEB6Q8N7X4 407 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRC-210ENST00000462363 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRC-210ENST00000462363 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
PTPRC-210ENST00000462363 NLRP3Q96P20 1036 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRC-210ENST00000462363 MTA3Q9BTC8 594 aa6.67□□□□□ -1.34
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