RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462357.1

IMP4-209, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 5

Gene IMP4, Length 533 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4-209ENST00000462357 ATP5JP18859 108 aa25.03■■□□□ 1.6
IMP4-209ENST00000462357 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa25.03■■□□□ 1.6
IMP4-209ENST00000462357 RGMBQ6NW40 437 aa25.03■■□□□ 1.6
IMP4-209ENST00000462357 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa25.03■■□□□ 1.6
IMP4-209ENST00000462357 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa25.03■■□□□ 1.6
IMP4-209ENST00000462357 GAKO14976 1311 aa25.03■■□□□ 1.6
IMP4-209ENST00000462357 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa25.02■■□□□ 1.6
IMP4-209ENST00000462357 IDH1O75874 414 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
IMP4-209ENST00000462357 IREB2P48200 963 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
IMP4-209ENST00000462357 VEGFBP49765 207 aa25.02■■□□□ 1.6
IMP4-209ENST00000462357 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
IMP4-209ENST00000462357 DLK2Q6UY11 383 aa25.02■■□□□ 1.6
IMP4-209ENST00000462357 EXOC6Q8TAG9 804 aa25.02■■□□□ 1.6
IMP4-209ENST00000462357 CAPNS2Q96L46 248 aa25.02■■□□□ 1.6
IMP4-209ENST00000462357 ECHDC1Q9NTX5 307 aa25.02■■□□□ 1.6
IMP4-209ENST00000462357 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
IMP4-209ENST00000462357 MAP2K2P36507 400 aa25.01■■□□□ 1.59
IMP4-209ENST00000462357 BTDP43251 543 aa25.01■■□□□ 1.59
IMP4-209ENST00000462357 JMYQ8N9B5 988 aa25.01■■□□□ 1.59
IMP4-209ENST00000462357 FAM151AQ8WW52 585 aa25.01■■□□□ 1.59
IMP4-209ENST00000462357 MYH13Q9UKX3 1938 aa25.01■■□□□ 1.59
IMP4-209ENST00000462357 TRPM7Q96QT4 1865 aa25■■□□□ 1.59
IMP4-209ENST00000462357 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
IMP4-209ENST00000462357 ERC2O15083 957 aa25■■□□□ 1.59
IMP4-209ENST00000462357 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
IMP4-209ENST00000462357 GRM1Q13255 1194 aa25■■□□□ 1.59
IMP4-209ENST00000462357 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
IMP4-209ENST00000462357 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP25■■□□□ 1.59
IMP4-209ENST00000462357 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
IMP4-209ENST00000462357 NOGQ13253 232 aa24.99■■□□□ 1.59
IMP4-209ENST00000462357 ANKRD45Q5TZF3 282 aa24.99■■□□□ 1.59
IMP4-209ENST00000462357 DCAF15Q66K64 600 aa24.99■■□□□ 1.59
IMP4-209ENST00000462357 BEGAINQ9BUH8 593 aa24.99■■□□□ 1.59
IMP4-209ENST00000462357 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
IMP4-209ENST00000462357 ENTPD3O75355 529 aa24.98■■□□□ 1.59
IMP4-209ENST00000462357 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
IMP4-209ENST00000462357 CYP4F22Q6NT55 531 aa24.98■■□□□ 1.59
IMP4-209ENST00000462357 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
IMP4-209ENST00000462357 IDI2Q9BXS1 227 aa24.98■■□□□ 1.59
IMP4-209ENST00000462357 TMEM39BQ9GZU3 492 aa24.98■■□□□ 1.59
IMP4-209ENST00000462357 BOLA2Q9H3K6 86 aa24.98■■□□□ 1.59
IMP4-209ENST00000462357 CEP350Q5VT06 3117 aa24.97■■□□□ 1.59
IMP4-209ENST00000462357 CACNB3P54284 484 aa24.97■■□□□ 1.59
IMP4-209ENST00000462357 PRKG1Q13976 671 aa24.97■■□□□ 1.59
IMP4-209ENST00000462357 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
IMP4-209ENST00000462357 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa24.97■■□□□ 1.59
IMP4-209ENST00000462357 UBE2Q2LH0YL09 131 aa24.96■■□□□ 1.59
IMP4-209ENST00000462357 GOLIM4O00461 696 aa24.96■■□□□ 1.59
IMP4-209ENST00000462357 NPM3O75607 178 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
IMP4-209ENST00000462357 CYP7A1P22680 504 aa24.96■■□□□ 1.59
IMP4-209ENST00000462357 MAP3K11Q16584 847 aa24.96■■□□□ 1.59
IMP4-209ENST00000462357 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
IMP4-209ENST00000462357 AIDAQ96BJ3 306 aa24.96■■□□□ 1.59
IMP4-209ENST00000462357 HAUS7Q99871 368 aa24.96■■□□□ 1.59
IMP4-209ENST00000462357 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
IMP4-209ENST00000462357 PAG1Q9NWQ8 432 aa24.96■■□□□ 1.59
IMP4-209ENST00000462357 AOX1Q06278 1338 aa24.95■■□□□ 1.58
IMP4-209ENST00000462357 TTC41PQ6P2S7 1318 aa24.95■■□□□ 1.58
IMP4-209ENST00000462357 PPP4CP60510 307 aa24.95■■□□□ 1.58
IMP4-209ENST00000462357 TCP10Q12799 353 aa24.95■■□□□ 1.58
IMP4-209ENST00000462357 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa24.95■■□□□ 1.58
IMP4-209ENST00000462357 SLC10A4Q96EP9 437 aa24.95■■□□□ 1.58
IMP4-209ENST00000462357 MAGEB6Q8N7X4 407 aa24.94■■□□□ 1.58
IMP4-209ENST00000462357 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
IMP4-209ENST00000462357 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa24.93■■□□□ 1.58
IMP4-209ENST00000462357 TEX11Q8IYF3 940 aa24.93■■□□□ 1.58
IMP4-209ENST00000462357 TEPSINQ96N21 525 aa24.93■■□□□ 1.58
IMP4-209ENST00000462357 CSADQ9Y600 493 aa24.93■■□□□ 1.58
IMP4-209ENST00000462357 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
IMP4-209ENST00000462357 RGS3P49796 1198 aa24.92■■□□□ 1.58
IMP4-209ENST00000462357 LDLRAD1Q5T700 205 aa24.92■■□□□ 1.58
IMP4-209ENST00000462357 ANTXR1Q9H6X2 564 aa24.92■■□□□ 1.58
IMP4-209ENST00000462357 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP24.92■■□□□ 1.58
IMP4-209ENST00000462357 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa24.91■■□□□ 1.58
IMP4-209ENST00000462357 USP2O75604 605 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
IMP4-209ENST00000462357 MAP3K9P80192 1104 aa24.91■■□□□ 1.58
IMP4-209ENST00000462357 PICALMQ13492 652 aa24.91■■□□□ 1.58
IMP4-209ENST00000462357 ZNF341Q9BYN7 854 aa24.91■■□□□ 1.58
IMP4-209ENST00000462357 ECM29Q5VYK3 1845 aa24.91■■□□□ 1.58
IMP4-209ENST00000462357 SLC10A3P09131 477 aa24.9■■□□□ 1.58
IMP4-209ENST00000462357 MX1P20591 662 aa24.9■■□□□ 1.58
IMP4-209ENST00000462357 RHBDL3P58872 404 aa24.9■■□□□ 1.58
IMP4-209ENST00000462357 NFIAQ12857 509 aa24.9■■□□□ 1.58
IMP4-209ENST00000462357 MOB2Q70IA6 237 aa24.9■■□□□ 1.58
IMP4-209ENST00000462357 ZNF384Q8TF68 577 aa24.9■■□□□ 1.58
IMP4-209ENST00000462357 CSRNP1Q96S65 589 aa24.9■■□□□ 1.58
IMP4-209ENST00000462357 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
IMP4-209ENST00000462357 FAM198AQ9UFP1 575 aa24.9■■□□□ 1.58
IMP4-209ENST00000462357 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa24.9■■□□□ 1.58
IMP4-209ENST00000462357 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
IMP4-209ENST00000462357 SMC5Q8IY18 1101 aa24.89■■□□□ 1.58
IMP4-209ENST00000462357 CA12O43570 354 aa24.88■■□□□ 1.57
IMP4-209ENST00000462357 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
IMP4-209ENST00000462357 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
IMP4-209ENST00000462357 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa24.87■■□□□ 1.57
IMP4-209ENST00000462357 PDE6AP16499 860 aa24.87■■□□□ 1.57
IMP4-209ENST00000462357 USP5P45974 858 aa24.87■■□□□ 1.57
IMP4-209ENST00000462357 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
IMP4-209ENST00000462357 MYH2Q9UKX2 1941 aa24.86■■□□□ 1.57
IMP4-209ENST00000462357 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.7 ms