RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459758.5

TTLL3-222, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 4

Gene TTLL3, Length 555 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-222	ENST00000459758	ADAL	Q6DHV7	355 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TTLL3-222	ENST00000459758	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TTLL3-222	ENST00000459758	TPTE2	Q6XPS3	522 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TTLL3-222	ENST00000459758	NFXL1	Q6ZNB6	911 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TTLL3-222	ENST00000459758	IFNL3	Q8IZI9	196 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TTLL3-222	ENST00000459758	SYNE4	Q8N205	404 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TTLL3-222	ENST00000459758	NGLY1	Q96IV0	654 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TTLL3-222	ENST00000459758	CHAMP1	Q96JM3	812 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TTLL3-222	ENST00000459758	SETDB2	Q96T68	719 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TTLL3-222	ENST00000459758	BCL11B	Q9C0K0	894 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
TTLL3-222	ENST00000459758	CACNA1S	Q13698	1873 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TTLL3-222	ENST00000459758	FOXP2	O15409	715 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TTLL3-222	ENST00000459758	MBD4	O95243	580 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TTLL3-222	ENST00000459758	CALM1	P0DP23	149 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TTLL3-222	ENST00000459758	CALM2	P0DP24	149 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TTLL3-222	ENST00000459758	CALM3	P0DP25	149 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TTLL3-222	ENST00000459758	IARS	P41252	1262 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
TTLL3-222	ENST00000459758	STK38	Q15208	465 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TTLL3-222	ENST00000459758	STX1A	Q16623	288 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TTLL3-222	ENST00000459758	TMEM67	Q5HYA8	995 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TTLL3-222	ENST00000459758	SPTY2D1	Q68D10	685 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
TTLL3-222	ENST00000459758	FNBP4	Q8N3X1	1017 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
TTLL3-222	ENST00000459758	MRPS27	Q92552	414 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
TTLL3-222	ENST00000459758	CCDC34	Q96HJ3	373 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TTLL3-222	ENST00000459758	TFIP11	Q9UBB9	837 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
TTLL3-222	ENST00000459758	ANAPC4	Q9UJX5	808 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TTLL3-222	ENST00000459758	SLC12A7	Q9Y666	1083 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TTLL3-222	ENST00000459758	BAZ2A	Q9UIF9	1905 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
TTLL3-222	ENST00000459758	GOLGA6L19	H0YKK7	550 aa		13.38	□□□□□ -0.27
TTLL3-222	ENST00000459758	TPM2	P07951	284 aa		13.38	□□□□□ -0.27
TTLL3-222	ENST00000459758	ADRA2B	P18089	450 aa		13.38	□□□□□ -0.27
TTLL3-222	ENST00000459758	ME1	P48163	572 aa		13.38	□□□□□ -0.27
TTLL3-222	ENST00000459758	TPM4	P67936	248 aa		13.38	□□□□□ -0.27
TTLL3-222	ENST00000459758	SSRP1	Q08945	709 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
TTLL3-222	ENST00000459758	APOA5	Q6Q788	366 aa		13.38	□□□□□ -0.27
TTLL3-222	ENST00000459758	CCAR1	Q8IX12	1150 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
TTLL3-222	ENST00000459758	ESR2	Q92731	530 aa		13.38	□□□□□ -0.27
TTLL3-222	ENST00000459758	ANO10	Q9NW15	660 aa		13.38	□□□□□ -0.27
TTLL3-222	ENST00000459758	HOOK1	Q9UJC3	728 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
TTLL3-222	ENST00000459758	RTCB	Q9Y3I0	505 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
TTLL3-222	ENST00000459758	SLC4A4	Q9Y6R1	1079 aa		13.38	□□□□□ -0.27
TTLL3-222	ENST00000459758	MAGEB6P1	A0A0J9YX57	407 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TTLL3-222	ENST00000459758	GOLGA8A	A7E2F4	631 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TTLL3-222	ENST00000459758	IFIT3	O14879	490 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
TTLL3-222	ENST00000459758	OFD1	O75665	1012 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TTLL3-222	ENST00000459758	ADCY5	O95622	1261 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TTLL3-222	ENST00000459758	CHGB	P05060	677 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TTLL3-222	ENST00000459758	ANTXR2	P58335	489 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TTLL3-222	ENST00000459758	WTAP	Q15007	396 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TTLL3-222	ENST00000459758	PI16	Q6UXB8	463 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TTLL3-222	ENST00000459758	TIGD1	Q96MW7	591 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TTLL3-222	ENST00000459758	UBAC1	Q9BSL1	405 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TTLL3-222	ENST00000459758	BRIP1	Q9BX63	1249 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TTLL3-222	ENST00000459758	WWC3	Q9ULE0	1092 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TTLL3-222	ENST00000459758	TAF1	P21675	1872 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TTLL3-222	ENST00000459758	PPP6R2	O75170	966 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TTLL3-222	ENST00000459758	LIG1	P18858	919 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TTLL3-222	ENST00000459758	FAM98C	Q17RN3	349 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
TTLL3-222	ENST00000459758	CCDC178	Q5BJE1	867 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TTLL3-222	ENST00000459758	MYSM1	Q5VVJ2	828 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TTLL3-222	ENST00000459758	NBPF5P	Q86XG9	351 aa	Predicted RBP	13.36	□□□□□ -0.27
TTLL3-222	ENST00000459758	NCOA5	Q9HCD5	579 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
TTLL3-222	ENST00000459758	SEC31B	Q9NQW1	1179 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TTLL3-222	ENST00000459758	RBM28	Q9NW13	759 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
TTLL3-222	ENST00000459758	CEP131	Q9UPN4	1083 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TTLL3-222	ENST00000459758	HPS5	Q9UPZ3	1129 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TTLL3-222	ENST00000459758	FAM177B	A6PVY3	158 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TTLL3-222	ENST00000459758		B4E1Z4	1266 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TTLL3-222	ENST00000459758	SPTLC2	O15270	562 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TTLL3-222	ENST00000459758	NEMF	O60524	1076 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TTLL3-222	ENST00000459758	DEXI	O95424	95 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TTLL3-222	ENST00000459758	FDPS	P14324	419 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
TTLL3-222	ENST00000459758	IFNAR1	P17181	557 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TTLL3-222	ENST00000459758	CYP7A1	P22680	504 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TTLL3-222	ENST00000459758	CDC25B	P30305	580 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TTLL3-222	ENST00000459758	ADD1	P35611	737 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
TTLL3-222	ENST00000459758	RPS8	P62241	208 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
TTLL3-222	ENST00000459758	AKAP17A	Q02040	695 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
TTLL3-222	ENST00000459758	SLFNL1	Q499Z3	407 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TTLL3-222	ENST00000459758	CHST3	Q7LGC8	479 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TTLL3-222	ENST00000459758	IQCA1	Q86XH1	822 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TTLL3-222	ENST00000459758	TBC1D10C	Q8IV04	446 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TTLL3-222	ENST00000459758	AMOTL1	Q8IY63	956 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TTLL3-222	ENST00000459758	CEP57L1	Q8IYX8	460 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TTLL3-222	ENST00000459758	HELB	Q8NG08	1087 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27
TTLL3-222	ENST00000459758	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
TTLL3-222	ENST00000459758	IGDCC4	Q8TDY8	1250 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TTLL3-222	ENST00000459758	PGBD1	Q96JS3	809 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TTLL3-222	ENST00000459758	USP28	Q96RU2	1077 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TTLL3-222	ENST00000459758	ALG1	Q9BT22	464 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TTLL3-222	ENST00000459758	LY9	Q9HBG7	655 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TTLL3-222	ENST00000459758	RAI14	Q9P0K7	980 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TTLL3-222	ENST00000459758	MRVI1	Q9Y6F6	885 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TTLL3-222	ENST00000459758	UBR3	Q6ZT12	1888 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TTLL3-222	ENST00000459758	NAV1	Q8NEY1	1877 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TTLL3-222	ENST00000459758	GSG1L2	A8MUP6	293 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TTLL3-222	ENST00000459758	MYO1B	O43795	1136 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TTLL3-222	ENST00000459758	NR1I2	O75469	434 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TTLL3-222	ENST00000459758	FMNL1	O95466	1100 aa	Predicted RBP	13.34	□□□□□ -0.27
TTLL3-222	ENST00000459758	BMP15	O95972	392 aa		13.34	□□□□□ -0.27

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