RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000456423.1

CLDN16-202, Transcript of claudin 16, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CLDN16, Length 430 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN16-202ENST00000456423 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
CLDN16-202ENST00000456423 INPP5BP32019 993 aa14.56□□□□□ -0.08
CLDN16-202ENST00000456423 GTF2A2P52657 109 aa14.56□□□□□ -0.08
CLDN16-202ENST00000456423 SP3Q02447 781 aa14.56□□□□□ -0.08
CLDN16-202ENST00000456423 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
CLDN16-202ENST00000456423 ZFPM1Q8IX07 1006 aa14.56□□□□□ -0.08
CLDN16-202ENST00000456423 ERO1AQ96HE7 468 aa14.56□□□□□ -0.08
CLDN16-202ENST00000456423 PTPN22Q9Y2R2 807 aa14.56□□□□□ -0.08
CLDN16-202ENST00000456423 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
CLDN16-202ENST00000456423 IL15P40933 162 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
CLDN16-202ENST00000456423 TIMM10P62072 90 aa14.55□□□□□ -0.08
CLDN16-202ENST00000456423 FKBP1CQ5VVH2 108 aa14.55□□□□□ -0.08
CLDN16-202ENST00000456423 EFCC1Q9HA90 598 aa14.55□□□□□ -0.08
CLDN16-202ENST00000456423 FAM198AQ9UFP1 575 aa14.55□□□□□ -0.08
CLDN16-202ENST00000456423 AK9Q5TCS8 1911 aa14.54□□□□□ -0.08
CLDN16-202ENST00000456423 BTBD19C9JJ37 291 aa14.54□□□□□ -0.08
CLDN16-202ENST00000456423 LDHBP07195 334 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
CLDN16-202ENST00000456423 SLURP2P0DP57 97 aa14.54□□□□□ -0.08
CLDN16-202ENST00000456423 CCDC102BQ68D86 513 aa14.54□□□□□ -0.08
CLDN16-202ENST00000456423 ERO1BQ86YB8 467 aa14.54□□□□□ -0.08
CLDN16-202ENST00000456423 FAM151AQ8WW52 585 aa14.54□□□□□ -0.08
CLDN16-202ENST00000456423 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa14.54□□□□□ -0.08
CLDN16-202ENST00000456423 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa14.54□□□□□ -0.08
CLDN16-202ENST00000456423 COPRSQ9NQ92 184 aa14.54□□□□□ -0.08
CLDN16-202ENST00000456423 USP40Q9NVE5 1235 aa14.54□□□□□ -0.08
CLDN16-202ENST00000456423 FBXO3Q9UK99 471 aa14.54□□□□□ -0.08
CLDN16-202ENST00000456423 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
CLDN16-202ENST00000456423 BRCA2P51587 3418 aa14.53□□□□□ -0.08
CLDN16-202ENST00000456423 MYH2Q9UKX2 1941 aa14.53□□□□□ -0.08
CLDN16-202ENST00000456423 CCER2I3L3R5 266 aa14.53□□□□□ -0.08
CLDN16-202ENST00000456423 BCAR3O75815 825 aa14.53□□□□□ -0.08
CLDN16-202ENST00000456423 TFCP2Q12800 502 aa14.53□□□□□ -0.08
CLDN16-202ENST00000456423 RASGRF1Q13972 1273 aa14.53□□□□□ -0.08
CLDN16-202ENST00000456423 DCAF15Q66K64 600 aa14.53□□□□□ -0.08
CLDN16-202ENST00000456423 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
CLDN16-202ENST00000456423 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
CLDN16-202ENST00000456423 ZNF341Q9BYN7 854 aa14.53□□□□□ -0.08
CLDN16-202ENST00000456423 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
CLDN16-202ENST00000456423 SRGAP3O43295 1099 aa14.52□□□□□ -0.09
CLDN16-202ENST00000456423 PPIL2Q13356 520 aa14.52□□□□□ -0.09
CLDN16-202ENST00000456423 DENND2AQ9ULE3 1009 aa14.52□□□□□ -0.09
CLDN16-202ENST00000456423 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa14.52□□□□□ -0.09
CLDN16-202ENST00000456423 SALL1Q9NSC2 1324 aa14.51□□□□□ -0.09
CLDN16-202ENST00000456423 A0A1B0GUL7 405 aa14.51□□□□□ -0.09
CLDN16-202ENST00000456423 MYCP01106 439 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
CLDN16-202ENST00000456423 CETPP11597 493 aa14.51□□□□□ -0.09
CLDN16-202ENST00000456423 TRIM27P14373 513 aa14.51□□□□□ -0.09
CLDN16-202ENST00000456423 SNAPC2Q13487 334 aa14.51□□□□□ -0.09
CLDN16-202ENST00000456423 PI16Q6UXB8 463 aa14.51□□□□□ -0.09
CLDN16-202ENST00000456423 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
CLDN16-202ENST00000456423 CLUAP1Q96AJ1 413 aa14.51□□□□□ -0.09
CLDN16-202ENST00000456423 HOOK2Q96ED9 719 aa14.51□□□□□ -0.09
CLDN16-202ENST00000456423 XAGE2Q96GT9 111 aa14.51□□□□□ -0.09
CLDN16-202ENST00000456423 ABCF2Q9UG63 623 aa14.51□□□□□ -0.09
CLDN16-202ENST00000456423 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
CLDN16-202ENST00000456423 EN2P19622 333 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
CLDN16-202ENST00000456423 RGS3P49796 1198 aa14.5□□□□□ -0.09
CLDN16-202ENST00000456423 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
CLDN16-202ENST00000456423 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa14.5□□□□□ -0.09
CLDN16-202ENST00000456423 ARHGAP45Q92619 1136 aa14.5□□□□□ -0.09
CLDN16-202ENST00000456423 ZNF112Q9UJU3 913 aa14.5□□□□□ -0.09
CLDN16-202ENST00000456423 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
CLDN16-202ENST00000456423 DOCK2Q92608 1830 aa14.5□□□□□ -0.09
CLDN16-202ENST00000456423 RFX7Q2KHR2 1363 aa14.49□□□□□ -0.09
CLDN16-202ENST00000456423 ATRNL1Q5VV63 1379 aa14.49□□□□□ -0.09
CLDN16-202ENST00000456423 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa14.49□□□□□ -0.09
CLDN16-202ENST00000456423 SEMA3EO15041 775 aa14.49□□□□□ -0.09
CLDN16-202ENST00000456423 TLR2O60603 784 aa14.49□□□□□ -0.09
CLDN16-202ENST00000456423 GNAI3P08754 354 aa14.49□□□□□ -0.09
CLDN16-202ENST00000456423 CTGFP29279 349 aa14.49□□□□□ -0.09
CLDN16-202ENST00000456423 PPATQ06203 517 aa14.49□□□□□ -0.09
CLDN16-202ENST00000456423 ZNF384Q8TF68 577 aa14.49□□□□□ -0.09
CLDN16-202ENST00000456423 ARMC5Q96C12 935 aa14.49□□□□□ -0.09
CLDN16-202ENST00000456423 NEUROD6Q96NK8 337 aa14.49□□□□□ -0.09
CLDN16-202ENST00000456423 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
CLDN16-202ENST00000456423 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
CLDN16-202ENST00000456423 CPA4Q9UI42 421 aa14.49□□□□□ -0.09
CLDN16-202ENST00000456423 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
CLDN16-202ENST00000456423 GAKO14976 1311 aa14.48□□□□□ -0.09
CLDN16-202ENST00000456423 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
CLDN16-202ENST00000456423 BTDP43251 543 aa14.48□□□□□ -0.09
CLDN16-202ENST00000456423 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
CLDN16-202ENST00000456423 PICALMQ13492 652 aa14.48□□□□□ -0.09
CLDN16-202ENST00000456423 MTX1Q13505 466 aa14.48□□□□□ -0.09
CLDN16-202ENST00000456423 MOGSQ13724 837 aa14.48□□□□□ -0.09
CLDN16-202ENST00000456423 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa14.48□□□□□ -0.09
CLDN16-202ENST00000456423 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
CLDN16-202ENST00000456423 SH3TC2Q8TF17 1288 aa14.48□□□□□ -0.09
CLDN16-202ENST00000456423 ZNF333Q96JL9 665 aa14.48□□□□□ -0.09
CLDN16-202ENST00000456423 HDAC5Q9UQL6 1122 aa14.48□□□□□ -0.09
CLDN16-202ENST00000456423 PHF20L1A8MW92 1017 aa14.47□□□□□ -0.09
CLDN16-202ENST00000456423 PDHXO00330 501 aa14.47□□□□□ -0.09
CLDN16-202ENST00000456423 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
CLDN16-202ENST00000456423 MECOMQ03112 1051 aa14.47□□□□□ -0.09
CLDN16-202ENST00000456423 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa14.47□□□□□ -0.09
CLDN16-202ENST00000456423 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
CLDN16-202ENST00000456423 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa14.47□□□□□ -0.09
CLDN16-202ENST00000456423 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
CLDN16-202ENST00000456423 IDI2Q9BXS1 227 aa14.47□□□□□ -0.09
CLDN16-202ENST00000456423 HMG20BQ9P0W2 317 aa14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.8 ms