RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455321.1

PGGT1BP1-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 1, humanhuman

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Gene PGGT1BP1, Length 1,023 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LINC00528Q8N1L1 170 aa11.47□□□□□ -0.57
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa11.47□□□□□ -0.57
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 ALS2Q96Q42 1657 aa11.37□□□□□ -0.59
PGGT1BP1-201ENST00000455321 USP6P35125 1406 aa11.37□□□□□ -0.59
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP11.37□□□□□ -0.59
PGGT1BP1-201ENST00000455321 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NLRP8Q86W28 1048 aa11.37□□□□□ -0.59
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP11.37□□□□□ -0.59
PGGT1BP1-201ENST00000455321 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP11.37□□□□□ -0.59
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RHOQP17081 205 aa11.36□□□□□ -0.59
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
PGGT1BP1-201ENST00000455321 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FCGRTP55899 365 aa11.36□□□□□ -0.59
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KCNQ4P56696 695 aa11.36□□□□□ -0.59
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