RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453996.6

CTU2-202, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTU2, Length 1,751 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-202ENST00000453996 FAM205AQ6ZU69 1335 aa25.23■■□□□ 1.63
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CTU2-202ENST00000453996 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
CTU2-202ENST00000453996 LAMB1P07942 1786 aa25.23■■□□□ 1.63
CTU2-202ENST00000453996 KIF13BQ9NQT8 1826 aa25.22■■□□□ 1.63
CTU2-202ENST00000453996 MCM4P33991 863 aa25.22■■□□□ 1.63
CTU2-202ENST00000453996 GIMAP6Q6P9H5 292 aa25.22■■□□□ 1.63
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CTU2-202ENST00000453996 GTF3C6Q969F1 213 aa25.21■■□□□ 1.63
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CTU2-202ENST00000453996 AKNAD1Q5T1N1 836 aa25.21■■□□□ 1.63
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CTU2-202ENST00000453996 B4E1Z4 1266 aa25.18■■□□□ 1.62
CTU2-202ENST00000453996 GTF2IP78347 998 aa25.18■■□□□ 1.62
CTU2-202ENST00000453996 DIXDC1Q155Q3 683 aa25.18■■□□□ 1.62
CTU2-202ENST00000453996 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
CTU2-202ENST00000453996 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
CTU2-202ENST00000453996 DDX11L8A8MPP1 907 aa25.17■■□□□ 1.62
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CTU2-202ENST00000453996 EVCP57679 992 aa25.17■■□□□ 1.62
CTU2-202ENST00000453996 DCAF8Q5TAQ9 597 aa25.17■■□□□ 1.62
CTU2-202ENST00000453996 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa25.17■■□□□ 1.62
CTU2-202ENST00000453996 C7orf43Q8WVR3 580 aa25.17■■□□□ 1.62
CTU2-202ENST00000453996 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
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CTU2-202ENST00000453996 CERS3Q8IU89 383 aa25.16■■□□□ 1.62
CTU2-202ENST00000453996 SLF2Q8IX21 1173 aa25.16■■□□□ 1.62
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CTU2-202ENST00000453996 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa25.15■■□□□ 1.62
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CTU2-202ENST00000453996 TACC3Q9Y6A5 838 aa25.15■■□□□ 1.62
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CTU2-202ENST00000453996 CHMP4CQ96CF2 233 aa25.14■■□□□ 1.62
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CTU2-202ENST00000453996 NKX2-3Q8TAU0 364 aa25.13■■□□□ 1.61
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CTU2-202ENST00000453996 ZBTB7AO95365 584 aa25.13■■□□□ 1.61
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CTU2-202ENST00000453996 TTLL6Q8N841 843 aa25.13■■□□□ 1.61
CTU2-202ENST00000453996 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
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CTU2-202ENST00000453996 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa25.12■■□□□ 1.61
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CTU2-202ENST00000453996 SUPT20HQ8NEM7 779 aa25.12■■□□□ 1.61
CTU2-202ENST00000453996 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
CTU2-202ENST00000453996 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
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CTU2-202ENST00000453996 USP17L21D6R901 530 aa25.11■■□□□ 1.61
CTU2-202ENST00000453996 PCP11498 1178 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
CTU2-202ENST00000453996 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
CTU2-202ENST00000453996 PDCP20941 246 aa25.11■■□□□ 1.61
CTU2-202ENST00000453996 BTDP43251 543 aa25.11■■□□□ 1.61
CTU2-202ENST00000453996 USP5P45974 858 aa25.11■■□□□ 1.61
CTU2-202ENST00000453996 GRIPAP1Q4V328 841 aa25.11■■□□□ 1.61
CTU2-202ENST00000453996 SBK1Q52WX2 424 aa25.11■■□□□ 1.61
CTU2-202ENST00000453996 ZSWIM5Q9P217 1185 aa25.11■■□□□ 1.61
CTU2-202ENST00000453996 BRPF3Q9ULD4 1205 aa25.11■■□□□ 1.61
CTU2-202ENST00000453996 GAKO14976 1311 aa25.11■■□□□ 1.61
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