RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000443667.1

PDZK1-204, Transcript of PDZ domain containing 1, human

TSL 5

Gene PDZK1, Length 1,010 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PDZK1-204	ENST00000443667	TDH	Q8IZJ6	230 aa		11.38	□□□□□ -0.59
PDZK1-204	ENST00000443667	CCDC191	Q8NCU4	936 aa		11.38	□□□□□ -0.59
PDZK1-204	ENST00000443667	TTLL11	Q8NHH1	800 aa		11.38	□□□□□ -0.59
PDZK1-204	ENST00000443667	GUCD1	Q96NT3	240 aa		11.38	□□□□□ -0.59
PDZK1-204	ENST00000443667	KCNJ4	P48050	445 aa		11.37	□□□□□ -0.59
PDZK1-204	ENST00000443667	SNAPC2	Q13487	334 aa		11.37	□□□□□ -0.59
PDZK1-204	ENST00000443667	IER5L	Q5T953	404 aa		11.37	□□□□□ -0.59
PDZK1-204	ENST00000443667	ZKSCAN4	Q969J2	545 aa	Predicted RBP	11.37	□□□□□ -0.59
PDZK1-204	ENST00000443667	ZCCHC17	Q9NP64	241 aa	Known RBP	11.37	□□□□□ -0.59
PDZK1-204	ENST00000443667	PRUNE2	Q8WUY3	3088 aa		11.37	□□□□□ -0.59
PDZK1-204	ENST00000443667	LAMA2	P24043	3122 aa	Known RBP	11.37	□□□□□ -0.59
PDZK1-204	ENST00000443667	ADGRA2	Q96PE1	1338 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PDZK1-204	ENST00000443667	PDHX	O00330	501 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PDZK1-204	ENST00000443667	CHL1	O00533	1208 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PDZK1-204	ENST00000443667	ADCY3	O60266	1144 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PDZK1-204	ENST00000443667	INHA	P05111	366 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PDZK1-204	ENST00000443667	IGHMBP2	P38935	993 aa	Known RBP	11.36	□□□□□ -0.59
PDZK1-204	ENST00000443667	TNFAIP1	Q13829	316 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PDZK1-204	ENST00000443667	NEUROD2	Q15784	382 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PDZK1-204	ENST00000443667	ERO1B	Q86YB8	467 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PDZK1-204	ENST00000443667	GOLGA6L2	Q8N9W4	650 aa	Predicted RBP	11.36	□□□□□ -0.59
PDZK1-204	ENST00000443667	SLAIN1	Q8ND83	568 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PDZK1-204	ENST00000443667	UBE2O	Q9C0C9	1292 aa	Known RBP	11.36	□□□□□ -0.59
PDZK1-204	ENST00000443667		A0A1B0GUL6	1792 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PDZK1-204	ENST00000443667	TAF5L	O75529	589 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PDZK1-204	ENST00000443667	DUSP27	Q5VZP5	1158 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PDZK1-204	ENST00000443667	NECAB2	Q7Z6G3	386 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PDZK1-204	ENST00000443667	HELB	Q8NG08	1087 aa	Predicted RBP	11.35	□□□□□ -0.59
PDZK1-204	ENST00000443667	WRNIP1	Q96S55	665 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PDZK1-204	ENST00000443667	ANKRD2	Q9GZV1	360 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PDZK1-204	ENST00000443667	DDX60L	Q5H9U9	1706 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
PDZK1-204	ENST00000443667	CLSPN	Q9HAW4	1339 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PDZK1-204	ENST00000443667	TMPO	P42166	694 aa	Known RBP	11.34	□□□□□ -0.59
PDZK1-204	ENST00000443667	CACNB3	P54284	484 aa		11.34	□□□□□ -0.59
PDZK1-204	ENST00000443667	FCGRT	P55899	365 aa		11.34	□□□□□ -0.59
PDZK1-204	ENST00000443667	CHRND	Q07001	517 aa		11.34	□□□□□ -0.59
PDZK1-204	ENST00000443667	PPIL2	Q13356	520 aa		11.34	□□□□□ -0.59
PDZK1-204	ENST00000443667	TAOK2	Q9UL54	1235 aa		11.34	□□□□□ -0.59
PDZK1-204	ENST00000443667	HOXB7	P09629	217 aa		11.33	□□□□□ -0.6
PDZK1-204	ENST00000443667	CYP2C8	P10632	490 aa		11.33	□□□□□ -0.6
PDZK1-204	ENST00000443667	PSEN1	P49768	467 aa		11.33	□□□□□ -0.6
PDZK1-204	ENST00000443667	FLT3LG	P49771	235 aa		11.33	□□□□□ -0.6
PDZK1-204	ENST00000443667	ANKRD23	Q86SG2	305 aa		11.33	□□□□□ -0.6
PDZK1-204	ENST00000443667	MPHOSPH8	Q99549	860 aa		11.33	□□□□□ -0.6
PDZK1-204	ENST00000443667	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	11.33	□□□□□ -0.6
PDZK1-204	ENST00000443667	CRISPLD2	Q9H0B8	497 aa		11.33	□□□□□ -0.6
PDZK1-204	ENST00000443667	PNN	Q9H307	717 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
PDZK1-204	ENST00000443667	PAK6	Q9NQU5	681 aa	Predicted RBP	11.33	□□□□□ -0.6
PDZK1-204	ENST00000443667	TTF2	Q9UNY4	1162 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
PDZK1-204	ENST00000443667	IGKV5-2	P06315	115 aa		11.32	□□□□□ -0.6
PDZK1-204	ENST00000443667	IL1R1	P14778	569 aa		11.32	□□□□□ -0.6
PDZK1-204	ENST00000443667	ITGA6	P23229	1130 aa		11.32	□□□□□ -0.6
PDZK1-204	ENST00000443667	TNNI2	P48788	182 aa		11.32	□□□□□ -0.6
PDZK1-204	ENST00000443667	IRX5	P78411	483 aa	Predicted RBP	11.32	□□□□□ -0.6
PDZK1-204	ENST00000443667	LMOD3	Q0VAK6	560 aa		11.32	□□□□□ -0.6
PDZK1-204	ENST00000443667	DZIP1L	Q8IYY4	767 aa	Known RBP	11.32	□□□□□ -0.6
PDZK1-204	ENST00000443667	RNF25	Q96BH1	459 aa	Predicted RBP	11.32	□□□□□ -0.6
PDZK1-204	ENST00000443667	TTC28	Q96AY4	2481 aa		11.32	□□□□□ -0.6
PDZK1-204	ENST00000443667	ELL2	O00472	640 aa	Predicted RBP	11.31	□□□□□ -0.6
PDZK1-204	ENST00000443667	BCR	P11274	1271 aa		11.31	□□□□□ -0.6
PDZK1-204	ENST00000443667	INPP5B	P32019	993 aa		11.31	□□□□□ -0.6
PDZK1-204	ENST00000443667	FKBP1A	P62942	108 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
PDZK1-204	ENST00000443667	MDM2	Q00987	491 aa	Predicted RBP	11.31	□□□□□ -0.6
PDZK1-204	ENST00000443667	MOGS	Q13724	837 aa		11.31	□□□□□ -0.6
PDZK1-204	ENST00000443667	CWF19L2	Q2TBE0	894 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
PDZK1-204	ENST00000443667	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		11.31	□□□□□ -0.6
PDZK1-204	ENST00000443667	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		11.31	□□□□□ -0.6
PDZK1-204	ENST00000443667	MAFA	Q8NHW3	353 aa	Predicted RBP	11.31	□□□□□ -0.6
PDZK1-204	ENST00000443667	XRN2	Q9H0D6	950 aa	Known RBP eCLIP	11.31	□□□□□ -0.6
PDZK1-204	ENST00000443667	MAP3K2	Q9Y2U5	619 aa		11.31	□□□□□ -0.6
PDZK1-204	ENST00000443667	DOCK3	Q8IZD9	2030 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PDZK1-204	ENST00000443667	CRK	P46108	304 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PDZK1-204	ENST00000443667	PPAT	Q06203	517 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PDZK1-204	ENST00000443667	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
PDZK1-204	ENST00000443667	GRIK5	Q16478	980 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PDZK1-204	ENST00000443667	MFSD14B	Q5SR56	506 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PDZK1-204	ENST00000443667	MIGA2	Q7L4E1	593 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PDZK1-204	ENST00000443667	CCDC146	Q8IYE0	955 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PDZK1-204	ENST00000443667	SERPINA10	Q9UK55	444 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PDZK1-204	ENST00000443667	SEC24B	O95487	1268 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PDZK1-204	ENST00000443667	PDAP1	Q13442	181 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
PDZK1-204	ENST00000443667	FAM109B	Q6ICB4	259 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
PDZK1-204	ENST00000443667	C15orf52	Q6ZUT6	534 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
PDZK1-204	ENST00000443667	PXYLP1	Q8TE99	480 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PDZK1-204	ENST00000443667	PARK7	Q99497	189 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
PDZK1-204	ENST00000443667	CDX2	Q99626	313 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
PDZK1-204	ENST00000443667	NBPF3	Q9H094	633 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PDZK1-204	ENST00000443667	C11orf49	Q9H6J7	331 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PDZK1-204	ENST00000443667	TNPO2	O14787	897 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
PDZK1-204	ENST00000443667	PLIN1	O60240	522 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PDZK1-204	ENST00000443667	ZNF697	Q5TEC3	545 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PDZK1-204	ENST00000443667	GPAT2	Q6NUI2	795 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PDZK1-204	ENST00000443667	MBIP	Q9NS73	344 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PDZK1-204	ENST00000443667	KCNH4	Q9UQ05	1017 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PDZK1-204	ENST00000443667	FAM205A	Q6ZU69	1335 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PDZK1-204	ENST00000443667	MUC3A	Q02505	3323 aa		11.27	□□□□□ -0.6
PDZK1-204	ENST00000443667	COL2A1	P02458	1487 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.6
PDZK1-204	ENST00000443667		H7C1W4	665 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PDZK1-204	ENST00000443667	DDX58	O95786	925 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
PDZK1-204	ENST00000443667	PLA2G5	P39877	138 aa		11.27	□□□□□ -0.61

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.3 ms