RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442563.5

RABGEF1-204, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 4

Gene RABGEF1, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-204ENST00000442563 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
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RABGEF1-204ENST00000442563 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
RABGEF1-204ENST00000442563 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
RABGEF1-204ENST00000442563 ARMC9Q7Z3E5 817 aa20.53■□□□□ 0.88
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RABGEF1-204ENST00000442563 MAP3K11Q16584 847 aa20.52■□□□□ 0.88
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RABGEF1-204ENST00000442563 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
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RABGEF1-204ENST00000442563 ANKRD45Q5TZF3 282 aa20.5■□□□□ 0.87
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RABGEF1-204ENST00000442563 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
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RABGEF1-204ENST00000442563 MX1P20591 662 aa20.43■□□□□ 0.86
RABGEF1-204ENST00000442563 MAP3K9P80192 1104 aa20.43■□□□□ 0.86
RABGEF1-204ENST00000442563 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
RABGEF1-204ENST00000442563 GRM1Q13255 1194 aa20.43■□□□□ 0.86
RABGEF1-204ENST00000442563 RASAL3Q86YV0 1011 aa20.43■□□□□ 0.86
RABGEF1-204ENST00000442563 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa20.43■□□□□ 0.86
RABGEF1-204ENST00000442563 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
RABGEF1-204ENST00000442563 SLC10A4Q96EP9 437 aa20.43■□□□□ 0.86
RABGEF1-204ENST00000442563 STAP2Q9UGK3 403 aa20.43■□□□□ 0.86
RABGEF1-204ENST00000442563 FZD1Q9UP38 647 aa20.43■□□□□ 0.86
RABGEF1-204ENST00000442563 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa20.42■□□□□ 0.86
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