RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439415.1

CBX1P4-201, Transcript of chromobox 1 pseudogene 4, humanhuman

BASIC

Gene CBX1P4, Length 457 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P4-201ENST00000439415 FAM153BP0C7A2 387 aa6.22□□□□□ -1.41
CBX1P4-201ENST00000439415 BMP6P22004 513 aa6.22□□□□□ -1.41
CBX1P4-201ENST00000439415 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
CBX1P4-201ENST00000439415 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
CBX1P4-201ENST00000439415 TTC6Q86TZ1 520 aa6.22□□□□□ -1.41
CBX1P4-201ENST00000439415 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
CBX1P4-201ENST00000439415 CEP120Q8N960 986 aa6.22□□□□□ -1.41
CBX1P4-201ENST00000439415 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
CBX1P4-201ENST00000439415 NXPE3Q969Y0 559 aa6.22□□□□□ -1.41
CBX1P4-201ENST00000439415 TM9SF2Q99805 663 aa6.22□□□□□ -1.41
CBX1P4-201ENST00000439415 SPATA9Q9BWV2 254 aa6.22□□□□□ -1.41
CBX1P4-201ENST00000439415 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
CBX1P4-201ENST00000439415 SLC12A7Q9Y666 1083 aa6.22□□□□□ -1.41
CBX1P4-201ENST00000439415 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa6.22□□□□□ -1.41
CBX1P4-201ENST00000439415 A0A087X0B3 334 aa6.21□□□□□ -1.42
CBX1P4-201ENST00000439415 CREB3O43889 395 aa6.21□□□□□ -1.42
CBX1P4-201ENST00000439415 TRPA1O75762 1119 aa6.21□□□□□ -1.42
CBX1P4-201ENST00000439415 UPP2O95045 317 aa6.21□□□□□ -1.42
CBX1P4-201ENST00000439415 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
CBX1P4-201ENST00000439415 NME2P22392 152 aa6.21□□□□□ -1.42
CBX1P4-201ENST00000439415 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP6.21□□□□□ -1.42
CBX1P4-201ENST00000439415 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
CBX1P4-201ENST00000439415 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
CBX1P4-201ENST00000439415 HGSNATQ68CP4 663 aa6.21□□□□□ -1.42
CBX1P4-201ENST00000439415 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
CBX1P4-201ENST00000439415 RUFY4Q6ZNE9 571 aa6.21□□□□□ -1.42
CBX1P4-201ENST00000439415 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
CBX1P4-201ENST00000439415 RNF217Q8TC41 542 aa6.21□□□□□ -1.42
CBX1P4-201ENST00000439415 ASAP3Q8TDY4 903 aa6.21□□□□□ -1.42
CBX1P4-201ENST00000439415 PNMA5Q96PV4 448 aa6.21□□□□□ -1.42
CBX1P4-201ENST00000439415 ZFATQ9P243 1243 aa6.21□□□□□ -1.42
CBX1P4-201ENST00000439415 NFKBIEO00221 500 aa6.2□□□□□ -1.42
CBX1P4-201ENST00000439415 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
CBX1P4-201ENST00000439415 TSPAN6O43657 245 aa6.2□□□□□ -1.42
CBX1P4-201ENST00000439415 PLIN1O60240 522 aa6.2□□□□□ -1.42
CBX1P4-201ENST00000439415 PDE8AO60658 829 aa6.2□□□□□ -1.42
CBX1P4-201ENST00000439415 CAND2O75155 1236 aa6.2□□□□□ -1.42
CBX1P4-201ENST00000439415 GUCY2CP25092 1073 aa6.2□□□□□ -1.42
CBX1P4-201ENST00000439415 GNALP38405 381 aa6.2□□□□□ -1.42
CBX1P4-201ENST00000439415 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
CBX1P4-201ENST00000439415 PLAURQ03405 335 aa6.2□□□□□ -1.42
CBX1P4-201ENST00000439415 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
CBX1P4-201ENST00000439415 UBE4AQ14139 1066 aa6.2□□□□□ -1.42
CBX1P4-201ENST00000439415 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
CBX1P4-201ENST00000439415 PPP2R5AQ15172 486 aa6.2□□□□□ -1.42
CBX1P4-201ENST00000439415 MAP9Q49MG5 647 aa6.2□□□□□ -1.42
CBX1P4-201ENST00000439415 RASIP1Q5U651 963 aa6.2□□□□□ -1.42
CBX1P4-201ENST00000439415 SPRYD7Q5W111 196 aa6.2□□□□□ -1.42
CBX1P4-201ENST00000439415 WWC2Q6AWC2 1192 aa6.2□□□□□ -1.42
CBX1P4-201ENST00000439415 LLGL2Q6P1M3 1020 aa6.2□□□□□ -1.42
CBX1P4-201ENST00000439415 TICAM2Q86XR7 235 aa6.2□□□□□ -1.42
CBX1P4-201ENST00000439415 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
CBX1P4-201ENST00000439415 LINC00528Q8N1L1 170 aa6.2□□□□□ -1.42
CBX1P4-201ENST00000439415 APBA2Q99767 749 aa6.2□□□□□ -1.42
CBX1P4-201ENST00000439415 EFCC1Q9HA90 598 aa6.2□□□□□ -1.42
CBX1P4-201ENST00000439415 NISCHQ9Y2I1 1504 aa6.2□□□□□ -1.42
CBX1P4-201ENST00000439415 IQCA1LA6NCM1 817 aa6.19□□□□□ -1.42
CBX1P4-201ENST00000439415 J3QL48 77 aa6.19□□□□□ -1.42
CBX1P4-201ENST00000439415 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
CBX1P4-201ENST00000439415 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
CBX1P4-201ENST00000439415 FOXC1Q12948 553 aa6.19□□□□□ -1.42
CBX1P4-201ENST00000439415 NCAPHQ15003 741 aa6.19□□□□□ -1.42
CBX1P4-201ENST00000439415 AKAP4Q5JQC9 854 aa6.19□□□□□ -1.42
CBX1P4-201ENST00000439415 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
CBX1P4-201ENST00000439415 RNF180Q86T96 592 aa6.19□□□□□ -1.42
CBX1P4-201ENST00000439415 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
CBX1P4-201ENST00000439415 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa6.19□□□□□ -1.42
CBX1P4-201ENST00000439415 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa6.19□□□□□ -1.42
CBX1P4-201ENST00000439415 EPN3Q9H201 632 aa6.19□□□□□ -1.42
CBX1P4-201ENST00000439415 RUBCNLQ9H714 662 aa6.19□□□□□ -1.42
CBX1P4-201ENST00000439415 GPAMQ9HCL2 828 aa6.19□□□□□ -1.42
CBX1P4-201ENST00000439415 MAPRE3Q9UPY8 281 aa6.19□□□□□ -1.42
CBX1P4-201ENST00000439415 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
CBX1P4-201ENST00000439415 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
CBX1P4-201ENST00000439415 MEIS3P2A8K0S8 358 aa6.18□□□□□ -1.42
CBX1P4-201ENST00000439415 UPK3BL1B0FP48 263 aa6.18□□□□□ -1.42
CBX1P4-201ENST00000439415 UPK3BL2E5RIL1 263 aa6.18□□□□□ -1.42
CBX1P4-201ENST00000439415 ADCY3O60266 1144 aa6.18□□□□□ -1.42
CBX1P4-201ENST00000439415 GRIN3BO60391 1043 aa6.18□□□□□ -1.42
CBX1P4-201ENST00000439415 MAP3K6O95382 1288 aa6.18□□□□□ -1.42
CBX1P4-201ENST00000439415 FAM157BP0CG42 384 aa6.18□□□□□ -1.42
CBX1P4-201ENST00000439415 CPEP16870 476 aa6.18□□□□□ -1.42
CBX1P4-201ENST00000439415 RHOQP17081 205 aa6.18□□□□□ -1.42
CBX1P4-201ENST00000439415 NFKB1P19838 968 aa6.18□□□□□ -1.42
CBX1P4-201ENST00000439415 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
CBX1P4-201ENST00000439415 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
CBX1P4-201ENST00000439415 EFHC2Q5JST6 749 aa6.18□□□□□ -1.42
CBX1P4-201ENST00000439415 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF697Q5TEC3 545 aa6.18□□□□□ -1.42
CBX1P4-201ENST00000439415 SCARA3Q6AZY7 606 aa6.18□□□□□ -1.42
CBX1P4-201ENST00000439415 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa6.18□□□□□ -1.42
CBX1P4-201ENST00000439415 SULF2Q8IWU5 870 aa6.18□□□□□ -1.42
CBX1P4-201ENST00000439415 ATL2Q8NHH9 583 aa6.18□□□□□ -1.42
CBX1P4-201ENST00000439415 GAL3ST3Q96A11 431 aa6.18□□□□□ -1.42
CBX1P4-201ENST00000439415 TRERF1Q96PN7 1200 aa6.18□□□□□ -1.42
CBX1P4-201ENST00000439415 HHIPQ96QV1 700 aa6.18□□□□□ -1.42
CBX1P4-201ENST00000439415 KIF2CQ99661 725 aa6.18□□□□□ -1.42
CBX1P4-201ENST00000439415 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
CBX1P4-201ENST00000439415 CBX8Q9HC52 389 aa6.18□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.3 ms