RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437111.1

SHQ1P1-201, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene SHQ1P1, Length 1,544 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1P1-201ENST00000437111 TSHZ3Q63HK5 1081 aa7.53□□□□□ -1.2
SHQ1P1-201ENST00000437111 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
SHQ1P1-201ENST00000437111 CFHR5Q9BXR6 569 aa7.53□□□□□ -1.2
SHQ1P1-201ENST00000437111 DBNDD1Q9H9R9 158 aa7.53□□□□□ -1.2
SHQ1P1-201ENST00000437111 KCNQ5Q9NR82 932 aa7.53□□□□□ -1.2
SHQ1P1-201ENST00000437111 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa7.53□□□□□ -1.2
SHQ1P1-201ENST00000437111 RTL9Q8NET4 1388 aa7.53□□□□□ -1.2
SHQ1P1-201ENST00000437111 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
SHQ1P1-201ENST00000437111 LAMB2P55268 1798 aa7.52□□□□□ -1.2
SHQ1P1-201ENST00000437111 UBE2Q2LH0YL09 131 aa7.52□□□□□ -1.2
SHQ1P1-201ENST00000437111 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.2
SHQ1P1-201ENST00000437111 BAG4O95429 457 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.2
SHQ1P1-201ENST00000437111 NCLP19338 710 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.2
SHQ1P1-201ENST00000437111 PSMA5P28066 241 aa7.52□□□□□ -1.2
SHQ1P1-201ENST00000437111 KCNJ4P48050 445 aa7.52□□□□□ -1.2
SHQ1P1-201ENST00000437111 PDIA6Q15084 440 aa7.52□□□□□ -1.2
SHQ1P1-201ENST00000437111 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa7.52□□□□□ -1.2
SHQ1P1-201ENST00000437111 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.2
SHQ1P1-201ENST00000437111 KIF6Q6ZMV9 814 aa7.52□□□□□ -1.2
SHQ1P1-201ENST00000437111 COPS6Q7L5N1 327 aa7.52□□□□□ -1.2
SHQ1P1-201ENST00000437111 OTUD5Q96G74 571 aa7.52□□□□□ -1.2
SHQ1P1-201ENST00000437111 SUCLG2Q96I99 432 aa7.52□□□□□ -1.2
SHQ1P1-201ENST00000437111 HMG20BQ9P0W2 317 aa7.52□□□□□ -1.2
SHQ1P1-201ENST00000437111 TRIM17Q9Y577 477 aa7.52□□□□□ -1.2
SHQ1P1-201ENST00000437111 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa7.52□□□□□ -1.2
SHQ1P1-201ENST00000437111 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.2
SHQ1P1-201ENST00000437111 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
SHQ1P1-201ENST00000437111 GRAPQ13588 217 aa7.52□□□□□ -1.21
SHQ1P1-201ENST00000437111 CUL4AQ13619 759 aa7.52□□□□□ -1.21
SHQ1P1-201ENST00000437111 ANKRD1Q15327 319 aa7.52□□□□□ -1.21
SHQ1P1-201ENST00000437111 WASHC4Q2M389 1173 aa7.52□□□□□ -1.21
SHQ1P1-201ENST00000437111 PARP10Q53GL7 1025 aa7.52□□□□□ -1.21
SHQ1P1-201ENST00000437111 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
SHQ1P1-201ENST00000437111 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
SHQ1P1-201ENST00000437111 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
SHQ1P1-201ENST00000437111 OTOP1Q7RTM1 612 aa7.52□□□□□ -1.21
SHQ1P1-201ENST00000437111 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
SHQ1P1-201ENST00000437111 TMX3Q96JJ7 454 aa7.52□□□□□ -1.21
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
SHQ1P1-201ENST00000437111 FSD1Q9BTV5 496 aa7.52□□□□□ -1.21
SHQ1P1-201ENST00000437111 COPRSQ9NQ92 184 aa7.52□□□□□ -1.21
SHQ1P1-201ENST00000437111 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
SHQ1P1-201ENST00000437111 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
SHQ1P1-201ENST00000437111 MYH15Q9Y2K3 1946 aa7.51□□□□□ -1.21
SHQ1P1-201ENST00000437111 ARAP2Q8WZ64 1704 aa7.51□□□□□ -1.21
SHQ1P1-201ENST00000437111 CCDC171Q6TFL3 1326 aa7.51□□□□□ -1.21
SHQ1P1-201ENST00000437111 LAMA4Q16363 1823 aa7.51□□□□□ -1.21
SHQ1P1-201ENST00000437111 BRCA2P51587 3418 aa7.51□□□□□ -1.21
SHQ1P1-201ENST00000437111 TCHHQ07283 1943 aa7.51□□□□□ -1.21
SHQ1P1-201ENST00000437111 RIMBP2O15034 1052 aa7.51□□□□□ -1.21
SHQ1P1-201ENST00000437111 ECE2O60344 883 aa7.51□□□□□ -1.21
SHQ1P1-201ENST00000437111 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
SHQ1P1-201ENST00000437111 PLCB2Q00722 1185 aa7.51□□□□□ -1.21
SHQ1P1-201ENST00000437111 SCARF1Q14162 830 aa7.51□□□□□ -1.21
SHQ1P1-201ENST00000437111 KRT32Q14532 448 aa7.51□□□□□ -1.21
SHQ1P1-201ENST00000437111 DOK7Q18PE1 504 aa7.51□□□□□ -1.21
SHQ1P1-201ENST00000437111 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
SHQ1P1-201ENST00000437111 LHX8Q68G74 356 aa7.51□□□□□ -1.21
SHQ1P1-201ENST00000437111 FBXO22Q8NEZ5 403 aa7.51□□□□□ -1.21
SHQ1P1-201ENST00000437111 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
SHQ1P1-201ENST00000437111 TM6SF1Q9BZW5 370 aa7.51□□□□□ -1.21
SHQ1P1-201ENST00000437111 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
SHQ1P1-201ENST00000437111 CENPFP49454 3210 aa7.5□□□□□ -1.21
SHQ1P1-201ENST00000437111 FSD2A1L4K1 749 aa7.5□□□□□ -1.21
SHQ1P1-201ENST00000437111 H0YGN5 161 aa7.5□□□□□ -1.21
SHQ1P1-201ENST00000437111 IGKV5-2P06315 115 aa7.5□□□□□ -1.21
SHQ1P1-201ENST00000437111 VIL1P09327 827 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
SHQ1P1-201ENST00000437111 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
SHQ1P1-201ENST00000437111 SREBF2Q12772 1141 aa7.5□□□□□ -1.21
SHQ1P1-201ENST00000437111 VPS53Q5VIR6 699 aa7.5□□□□□ -1.21
SHQ1P1-201ENST00000437111 MCTP1Q6DN14 999 aa7.5□□□□□ -1.21
SHQ1P1-201ENST00000437111 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
SHQ1P1-201ENST00000437111 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa7.5□□□□□ -1.21
SHQ1P1-201ENST00000437111 CCDC191Q8NCU4 936 aa7.5□□□□□ -1.21
SHQ1P1-201ENST00000437111 ARMC5Q96C12 935 aa7.5□□□□□ -1.21
SHQ1P1-201ENST00000437111 CHMP4CQ96CF2 233 aa7.5□□□□□ -1.21
SHQ1P1-201ENST00000437111 MS4A4AQ96JQ5 239 aa7.5□□□□□ -1.21
SHQ1P1-201ENST00000437111 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
SHQ1P1-201ENST00000437111 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
SHQ1P1-201ENST00000437111 GRPEL1Q9HAV7 217 aa7.5□□□□□ -1.21
SHQ1P1-201ENST00000437111 POLLQ9UGP5 575 aa7.5□□□□□ -1.21
SHQ1P1-201ENST00000437111 PTPN22Q9Y2R2 807 aa7.5□□□□□ -1.21
SHQ1P1-201ENST00000437111 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa7.5□□□□□ -1.21
SHQ1P1-201ENST00000437111 CEP290O15078 2479 aa7.49□□□□□ -1.21
SHQ1P1-201ENST00000437111 CUL9Q8IWT3 2517 aa7.49□□□□□ -1.21
SHQ1P1-201ENST00000437111 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
SHQ1P1-201ENST00000437111 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa7.49□□□□□ -1.21
SHQ1P1-201ENST00000437111 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa7.49□□□□□ -1.21
SHQ1P1-201ENST00000437111 TMC4Q7Z404 712 aa7.49□□□□□ -1.21
SHQ1P1-201ENST00000437111 FAM43AQ8N2R8 423 aa7.49□□□□□ -1.21
SHQ1P1-201ENST00000437111 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
SHQ1P1-201ENST00000437111 SIL1Q9H173 461 aa7.49□□□□□ -1.21
SHQ1P1-201ENST00000437111 GPR108Q9NPR9 543 aa7.49□□□□□ -1.21
SHQ1P1-201ENST00000437111 SNRKQ9NRH2 765 aa7.49□□□□□ -1.21
SHQ1P1-201ENST00000437111 METRNQ9UJH8 293 aa7.49□□□□□ -1.21
SHQ1P1-201ENST00000437111 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
SHQ1P1-201ENST00000437111 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa7.49□□□□□ -1.21
SHQ1P1-201ENST00000437111 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
SHQ1P1-201ENST00000437111 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa7.49□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17 ms